RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545204.1

MDM2-233, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5 BASIC

Gene MDM2, Length 398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-233	ENST00000545204	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
MDM2-233	ENST00000545204	TMEM198	Q66K66	360 aa		2.84	□□□□□ -1.95
MDM2-233	ENST00000545204	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		2.84	□□□□□ -1.95
MDM2-233	ENST00000545204	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		2.84	□□□□□ -1.95
MDM2-233	ENST00000545204	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		2.84	□□□□□ -1.95
MDM2-233	ENST00000545204	KLHL35	Q6PF15	583 aa		2.84	□□□□□ -1.95
MDM2-233	ENST00000545204	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		2.84	□□□□□ -1.95
MDM2-233	ENST00000545204	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		2.84	□□□□□ -1.95
MDM2-233	ENST00000545204	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		2.84	□□□□□ -1.95
MDM2-233	ENST00000545204	LONP2	Q86WA8	852 aa		2.84	□□□□□ -1.95
MDM2-233	ENST00000545204	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		2.84	□□□□□ -1.95
MDM2-233	ENST00000545204	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		2.84	□□□□□ -1.95
MDM2-233	ENST00000545204	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
MDM2-233	ENST00000545204	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
MDM2-233	ENST00000545204	RDM1	Q8NG50	284 aa		2.84	□□□□□ -1.95
MDM2-233	ENST00000545204	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		2.84	□□□□□ -1.95
MDM2-233	ENST00000545204	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		2.84	□□□□□ -1.95
MDM2-233	ENST00000545204	USP6NL	Q92738	828 aa		2.84	□□□□□ -1.95
MDM2-233	ENST00000545204	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
MDM2-233	ENST00000545204	C17orf77	Q96MU5	243 aa		2.84	□□□□□ -1.95
MDM2-233	ENST00000545204	CMTM3	Q96MX0	182 aa		2.84	□□□□□ -1.95
MDM2-233	ENST00000545204	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		2.84	□□□□□ -1.95
MDM2-233	ENST00000545204	PLK3	Q9H4B4	646 aa		2.84	□□□□□ -1.95
MDM2-233	ENST00000545204	KAT14	Q9H8E8	782 aa		2.84	□□□□□ -1.95
MDM2-233	ENST00000545204	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		2.84	□□□□□ -1.95
MDM2-233	ENST00000545204	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		2.84	□□□□□ -1.95
MDM2-233	ENST00000545204	KRT84	Q9NSB2	600 aa		2.84	□□□□□ -1.95
MDM2-233	ENST00000545204	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		2.84	□□□□□ -1.95
MDM2-233	ENST00000545204	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
MDM2-233	ENST00000545204	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	2.84	□□□□□ -1.95
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF624	Q9P2J8	865 aa	Predicted RBP	2.84	□□□□□ -1.95
MDM2-233	ENST00000545204	TAF1	P21675	1872 aa		2.84	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	MYO1G	B0I1T2	1018 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	TMCC2	O75069	709 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	GPC4	O75487	556 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	TFAP2A	P05549	437 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	TUBB	P07437	444 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	ACADM	P11310	421 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	MAPK4	P31152	587 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	NR2C2	P49116	596 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	CAMP	P49913	170 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	TUBB4B	P68371	445 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	MBTD1	Q05BQ5	628 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	LCE1E	Q5T753	118 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	FAM180B	Q6P0A1	224 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	PACS1	Q6VY07	963 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	ANO5	Q75V66	913 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF534	Q76KX8	674 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	CEP97	Q8IW35	865 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	PAF1	Q8N7H5	531 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	CNBD1	Q8NA66	436 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	SMPDL3B	Q92485	455 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	TM9SF4	Q92544	642 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	STAMBPL1	Q96FJ0	436 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	F2RL3	Q96RI0	385 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	GAD1	Q99259	594 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	OGFR	Q9NZT2	677 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	YIPF1	Q9Y548	306 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		2.83	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	WDR81	Q562E7	1941 aa		2.82	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	OR2M5	A3KFT3	312 aa		2.82	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	C15orf62	A8K5M9	175 aa		2.82	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		2.82	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		2.82	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204		H0YIN7	160 aa		2.82	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		2.82	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		2.82	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204		J3QR06	171 aa		2.82	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	ZBTB43	O43298	467 aa		2.82	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	HS6ST1	O60243	411 aa		2.82	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	BMP10	O95393	424 aa		2.82	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	CGA	P01215	116 aa		2.82	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	2.82	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	LIPF	P07098	398 aa		2.82	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	PATE4	P0C8F1	98 aa		2.82	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	GABRB1	P18505	474 aa		2.82	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	TNFAIP3	P21580	790 aa		2.82	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	MMP15	P51511	669 aa		2.82	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	ATP12A	P54707	1039 aa		2.82	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	CDH8	P55286	799 aa		2.82	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	CD81	P60033	236 aa		2.82	□□□□□ -1.96
MDM2-233	ENST00000545204	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	2.82	□□□□□ -1.96

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