RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539589.5

PACSIN3-211, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene PACSIN3, Length 2,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-211ENST00000539589 SLC30A3Q99726 388 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 KXD1Q9BQD3 176 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 CIPCQ9C0C6 399 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 MTG2Q9H4K7 406 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 LMCD1Q9NZU5 365 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 IKZF3Q9UKT9 509 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 TMCO1Q9UM00 188 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 POMPQ9Y244 141 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 NVLO15381 856 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 ANPEPP15144 967 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 GRIN2CQ14957 1233 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 MAPRE2Q15555 327 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 MUM1Q2TAK8 710 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 UGT3A2Q3SY77 523 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 CES5AQ6NT32 575 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 PARM1Q6UWI2 310 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 EP400NLQ6ZTU2 488 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 ECHDC3Q96DC8 303 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 LINGO1Q96FE5 620 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 P2RY12Q9H244 342 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 LRRC14BA6NHZ5 514 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 STX16O14662 325 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 TSPAN12O95859 305 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 LAMP2P13473 410 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 SERPINA4P29622 427 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 LCP2Q13094 533 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 PDGFRLQ15198 375 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 CDKN3Q16667 212 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP1R3AQ16821 1122 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 ANKS6Q68DC2 871 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 TXNDC11Q6PKC3 985 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP20.03■□□□□ 0.87e-8■■■□□ 15.6
PACSIN3-211ENST00000539589 PGAM4Q8N0Y7 254 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 PPFIBP2Q8ND30 876 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 GIMAP7Q8NHV1 300 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 TRPC4APQ8TEL6 797 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 NRG4Q8WWG1 115 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 CHFRQ96EP1 664 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 MSLNLQ96KJ4 702 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 APPL1Q9UKG1 709 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 WASF2Q9Y6W5 498 aa20.03■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 AZIN1O14977 448 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 KLK8O60259 260 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 PRAMEF1O95521 474 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 HNF1BP35680 557 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 ERFP50548 548 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 CLCQ05315 142 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 FAM151BQ6UXP7 276 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 DNAJC9Q8WXX5 260 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 SUV39H2Q9H5I1 410 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 NMRK1Q9NWW6 199 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
PACSIN3-211ENST00000539589 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 POP4O95707 220 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 STX5Q13190 355 aa20.02■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 CYHR1Q6ZMK1 362 aa20.02■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 SNX20Q7Z614 316 aa20.02■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 EFCAB3Q8N7B9 438 aa20.02■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 ZNF366Q8N895 744 aa20.02■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa20.02■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa20.02■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa20.02■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 CLPBQ9H078 707 aa20.02■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 S100A14Q9HCY8 104 aa20.02■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 ELOVL2Q9NXB9 296 aa20.02■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 ANTXRLA6NF34 631 aa20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 CAPN8A6NHC0 703 aa20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 WASH3PC4AMC7 463 aa20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 PPP6CO00743 305 aa20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 GPR39O43194 453 aa20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 RPS17P08708 135 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 ITGALP20701 1170 aa20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 CLCN7P51798 805 aa20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 SEMG2Q02383 582 aa20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 CCNIQ14094 377 aa20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 CMPK2Q5EBM0 449 aa20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 KANK2Q63ZY3 851 aa20.01■□□□□ 0.79
PACSIN3-211ENST00000539589 SERPINA9Q86WD7 417 aa20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms