RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 A0A0G2JMP0 313 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 DHRS12A0PJE2 317 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 MYBPHLA2RUH7 354 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 FMO4P31512 558 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 HADHAP40939 763 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 GRIA4P48058 902 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 NAGLUP54802 743 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 TWF1Q12792 350 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 GPR17Q13304 367 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 TUBA3CQ13748 450 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 FAM35AQ86V20 835 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC103Q8IW40 242 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 ACVR1CQ8NER5 493 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 KLHL5Q96PQ7 755 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM265A0A087WTH1 108 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 KRT7P08729 469 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 FSHRP23945 695 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 CYP2F1P24903 491 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 GARSP41250 739 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 RPS9P46781 194 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 GP2P55259 537 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 MPP1Q00013 466 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 CDK10Q15131 360 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 ZBTB6Q15916 424 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 C10orf120Q5SQS8 335 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 BSPRYQ5W0U4 402 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 DCLK2Q8N568 766 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 NIPA2Q8N8Q9 360 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 OR6F1Q8NGZ6 308 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 PEBP4Q96S96 227 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 C9orf16Q9BUW7 83 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 A8MX80 341 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 F8W810 466 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 AP3D1O14617 1153 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 LMO2P25791 158 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 CNTFP26441 200 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 MIPP30301 263 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 ERVFC1P60507 584 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 SLC12A1Q13621 1099 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 PDK2Q15119 407 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 PYCR3Q53H96 274 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 XKR4Q5GH76 650 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 SDHAF4Q5VUM1 108 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 LEMD2Q8NC56 503 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 SLC22A17Q8WUG5 538 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 SDCCAG3Q96C92 435 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 TTYH2Q9BSA4 534 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 RUBCNLQ9H714 662 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 SP140LQ9H930 580 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 FBXO8Q9NRD0 319 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 BAG5Q9UL15 447 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 RAP2CQ9Y3L5 183 aa10.01□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 CLDN5O00501 218 aa10□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 SLC22A1O15245 554 aa10□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 CILPO75339 1184 aa10□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 NPR3P17342 541 aa10□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 CRHBPP24387 322 aa10□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 FASP25445 335 aa10□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 TKTL1P51854 596 aa10□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 AGKQ53H12 422 aa10□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 TCEAL5Q5H9L2 206 aa10□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 SPRED1Q7Z699 444 aa10□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 C12orf29Q8N999 325 aa10□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 OR7A2PQ8NGA2 310 aa10□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 DEPDC7Q96QD5 511 aa10□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 ING2Q9H160 280 aa10□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM181Q9P2C4 612 aa10□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 V9GYQ6 96 aa10□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 PCNTO95613 3336 aa10□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 SYCE1LA8MT33 242 aa10□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 STAU1O95793 577 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 GABRR2P28476 465 aa10□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 PAGE2Q7Z2X7 111 aa10□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 LSMEM2Q8N112 164 aa10□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TRPS1-211ENST00000520276 GLMNQ92990 594 aa10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms