RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516127.1

RNA5SP249-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 249, humanhuman

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Gene RNA5SP249, Length 99 nt, Biotype rRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP249-201ENST00000516127 CBSLP0DN79 551 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 IRF1P10914 325 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 CDH1P12830 882 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 ELNP15502 786 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 CD1EP15812 388 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 ZNF23P17027 643 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 CKMT2P17540 419 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 HDCP19113 662 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 CR2P20023 1033 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 HIST1H2ADP20671 130 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 MYF6P23409 242 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 MAPK1P28482 360 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 CTGFP29279 349 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 SLC6A4P31645 630 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 CBSP35520 551 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 HMGCLP35914 325 aa4.84□□□□□ -1.63
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RNA5SP249-201ENST00000516127 GNPDA1P46926 289 aa4.84□□□□□ -1.63
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RNA5SP249-201ENST00000516127 CSNK1DP48730 415 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 GSK3BP49841 420 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 CDK9P50750 372 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 ARHGDIAP52565 204 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 UFM1P61960 85 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 CDKL1Q00532 357 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP4.84□□□□□ -1.63
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RNA5SP249-201ENST00000516127 PLD1Q13393 1074 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 PWP1Q13610 501 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 CDH18Q13634 790 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 GTF2H2Q13888 395 aa4.84□□□□□ -1.63
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RNA5SP249-201ENST00000516127 SEMA3AQ14563 771 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 MYBPC3Q14896 1274 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 NR6A1Q15406 480 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 TGFBIQ15582 683 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 ATP6AP1Q15904 470 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 AP5B1Q2VPB7 878 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 MYLK3Q32MK0 819 aa4.84□□□□□ -1.63
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RNA5SP249-201ENST00000516127 KCTD21Q4G0X4 260 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
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RNA5SP249-201ENST00000516127 TTC23Q5W5X9 447 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 SLC8B1Q6J4K2 584 aa4.84□□□□□ -1.63
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RNA5SP249-201ENST00000516127 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa4.84□□□□□ -1.63
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RNA5SP249-201ENST00000516127 LRRC43Q8N309 656 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 ZNF786Q8N393 782 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 TCAIMQ8N3R3 496 aa4.84□□□□□ -1.63
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RNA5SP249-201ENST00000516127 DPP10Q8N608 796 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 CDYL2Q8N8U2 506 aa4.84□□□□□ -1.63
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RNA5SP249-201ENST00000516127 ZNF461Q8TAF7 563 aa4.84□□□□□ -1.63
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RNA5SP249-201ENST00000516127 HHIPL1Q96JK4 782 aa4.84□□□□□ -1.63
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RNA5SP249-201ENST00000516127 ACOX2Q99424 681 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 SLC29A1Q99808 456 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 CIB1Q99828 191 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 HIST1H2AJQ99878 128 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 C17orf80Q9BSJ5 609 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 H2AFJQ9BTM1 129 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 CHID1Q9BWS9 393 aa4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RNA5SP249-201ENST00000516127 LRRC3Q9BY71 257 aa4.84□□□□□ -1.63
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