RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 LMO1P25800 156 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 MC5RP33032 325 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 TERF1P54274 439 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 CDH13P55290 713 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 NR1D2Q14995 579 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 OASLQ15646 514 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 LEXMQ3ZCV2 418 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF534Q76KX8 674 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 GLCCI1Q86VQ1 547 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 KIF18AQ8NI77 898 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 SPAG5Q96R06 1193 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 NUP85Q9BW27 656 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 NOX4Q9NPH5 578 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 MYO6Q9UM54 1294 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 TTC3P53804 2025 aa7.52□□□□□ -1.2
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 TSPAN1O60635 241 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 CREG1O75629 220 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 PTAFRP25105 342 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 PEX5P50542 639 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 UBE2V1Q13404 147 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 CALCRLQ16602 461 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 XKR9Q5GH70 373 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 C6orf163Q5TEZ5 329 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 FAM47EQ6ZV65 393 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 FJX1Q86VR8 437 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 METTL23Q86XA0 190 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 Q8NFD4 153 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 EXD1Q8NHP7 514 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 ATP6V1E2Q96A05 226 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 ERLEC1Q96DZ1 483 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 MS4A10Q96PG2 267 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 STK26Q9P289 416 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 PTPRCP08575 1304 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF521Q96K83 1311 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 TAF1P21675 1872 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 SSX4O60224 188 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 TOMM40O96008 361 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 CRYABP02511 175 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 FDPSP14324 419 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 PCGF2P35227 344 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF75DP51815 510 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 KRT83P78385 493 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 RBP5P82980 135 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 MELKQ14680 651 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 HLFQ16534 295 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 TEX38Q6PEX7 206 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 HMGCLL1Q8TB92 370 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 WDR20Q8TBZ3 569 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 SLC22A12Q96S37 553 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 SLC29A3Q9BZD2 475 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 MRGBPQ9NV56 204 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 PADI3Q9ULW8 664 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 LINC01553A4QN01 128 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 WDR46O15213 610 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 PRSS2P07478 247 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 SSTR2P30874 369 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 GP5P40197 560 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 CDK3Q00526 305 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 PPARDQ03181 441 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 BFSP1Q12934 665 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 PTPRCAPQ14761 206 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC142Q17RM4 750 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 ACVR1CQ8NER5 493 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 SETD6Q8TBK2 473 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 ATL1Q8WXF7 558 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 GRPEL1Q9HAV7 217 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 EQTNQ9NQ60 294 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 C1RLQ9NZP8 487 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF112Q9UJU3 913 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 AMDHD2Q9Y303 409 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 NFS1Q9Y697 457 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 BUD23O43709 281 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 DIAPH2O60879 1101 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 SCP2P22307 547 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 DNASE1P24855 282 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 PCYT1AP49585 367 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 HSPB3Q12988 150 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRC-212ENST00000491302 HYAL4Q2M3T9 481 aa7.49□□□□□ -1.21
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