RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	FAM8A1	Q9UBU6	413 aa		17.48	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		17.48	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	17.47	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	AVIL	O75366	819 aa		17.47	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	17.47	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	SLC2A4	P14672	509 aa		17.47	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	IDS	P22304	550 aa		17.47	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	17.47	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	ALDH4A1	P30038	563 aa		17.47	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	CCL7	P80098	99 aa		17.47	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	SPIDR	Q14159	915 aa		17.47	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	AFTPH	Q6ULP2	937 aa		17.47	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	CCNJL	Q8IV13	435 aa		17.47	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		17.47	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		17.47	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		17.47	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	17.47	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	DEPDC7	Q96QD5	511 aa		17.47	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	17.47	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	SYBU	Q9NX95	663 aa		17.47	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		17.47	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		17.47	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		17.47	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		17.46	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	AGAP14	A8MT82	685 aa		17.46	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	CCDC188	H7C350	402 aa		17.46	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	17.46	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	ZW10	O43264	779 aa		17.46	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	TMEM63A	O94886	807 aa		17.46	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	17.46	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	CAPNS1	P04632	268 aa		17.46	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	F3	P13726	295 aa		17.46	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	17.46	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	ACRV1	P26436	265 aa		17.46	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	MAGEA6	P43360	314 aa		17.46	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	DR1	Q01658	176 aa		17.46	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	AMZ1	Q400G9	498 aa		17.46	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	IYD	Q6PHW0	289 aa		17.46	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	17.46	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	ZNF534	Q76KX8	674 aa		17.46	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		17.46	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		17.46	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		17.46	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	OR4L1	Q8NH43	312 aa		17.46	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	WDR48	Q8TAF3	677 aa		17.46	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		17.46	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	17.46	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	TTC1	Q99614	292 aa		17.46	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		17.46	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		17.46	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		17.46	■□□□□ 0.39
USP19-210	ENST00000465902	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		17.45	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	PPM1D	O15297	605 aa		17.45	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	CS	O75390	466 aa	Known RBP	17.45	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	PNLIP	P16233	465 aa		17.45	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	NMBR	P28336	390 aa		17.45	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	PTGIR	P43119	386 aa		17.45	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	CLCNKA	P51800	687 aa		17.45	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	17.45	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	OR1D5	P58170	312 aa		17.45	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	B4GALNT1	Q00973	533 aa		17.45	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	HHEX	Q03014	270 aa		17.45	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	PTK6	Q13882	451 aa		17.45	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	DBN1	Q16643	649 aa		17.45	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	FASTKD1	Q53R41	847 aa	Known RBP	17.45	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	CES3	Q6UWW8	571 aa		17.45	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	SPRED1	Q7Z699	444 aa		17.45	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		17.45	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		17.45	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	17.45	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	ZNF761	Q86XN6	746 aa	Predicted RBP	17.45	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	SFRP1	Q8N474	314 aa		17.45	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	OTUD6B	Q8N6M0	293 aa		17.45	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	17.45	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	17.45	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	KRT12	Q99456	494 aa		17.45	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	SLC38A3	Q99624	504 aa		17.45	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	ZMYND15	Q9H091	742 aa		17.45	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		17.45	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	XAB2	Q9HCS7	855 aa	Known RBP	17.45	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	17.45	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		17.45	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		17.44	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		17.44	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902		A0A0G2JNG1	304 aa		17.44	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	OR5K4	A6NMS3	321 aa		17.44	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		17.44	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	KCNJ13	O60928	360 aa		17.44	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	PSMA3	P25788	255 aa		17.44	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	FOXN2	P32314	431 aa		17.44	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	HAL	P42357	657 aa		17.44	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	NFE2L1	Q14494	772 aa		17.44	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	KIR2DS5	Q14953	304 aa		17.44	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	LYPLAL1	Q5VWZ2	237 aa		17.44	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		17.44	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	SYDE1	Q6ZW31	735 aa	Predicted RBP	17.44	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	17.44	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	MPP5	Q8N3R9	675 aa		17.44	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		17.44	■□□□□ 0.38
USP19-210	ENST00000465902	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		17.44	■□□□□ 0.38

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