RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 WISP2O76076 250 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 AMBPP02760 352 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACADMP11310 421 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 RARGP13631 454 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 NR2C2P49116 596 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATP12AP54707 1039 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRAMEP78395 509 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 MBTD1Q05BQ5 628 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAMLD1Q13495 774 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDR38Q5JTN6 314 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 CEP85LQ5SZL2 805 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 JADE1Q6IE81 842 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLXDC2Q6UX71 529 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 PACS1Q6VY07 963 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 TICAM1Q8IUC6 712 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 TEX11Q8IYF3 940 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMTC2Q8N394 836 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 NGEFQ8N5V2 710 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 SCFD2Q8WU76 684 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF524Q96C55 264 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 CMTM3Q96MX0 182 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 NEUROD6Q96NK8 337 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 ITPAQ9BY32 194 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLK3Q9H4B4 646 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF696Q9H7X3 374 aa2.92□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1W2PPI3 338 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 F5H0A9 414 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 CIDEAO60543 219 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMCC2O75069 709 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF217O75362 1048 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 BMP10O95393 424 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 NR3C1P04150 777 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 TFAP2AP05549 437 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 LIPFP07098 398 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 TUBBP07437 444 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 HRH2P25021 359 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 CAMPP49913 170 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 CD81P60033 236 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 DCAF7P61962 342 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 TUBB4BP68371 445 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 UBE2V1Q13404 147 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 CRYMQ14894 314 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIR2DS3Q14952 304 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC6Q16204 474 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 MEP1AQ16819 746 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 CFAP77Q6ZQR2 320 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAATS1Q7Z4T9 603 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 STPG4Q8N801 248 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM76AQ8TAV0 307 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 WBP2Q969T9 261 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 C17orf77Q96MU5 243 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR2A14Q96R47 310 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 F2RL3Q96RI0 385 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 GAD1Q99259 594 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAD21L1Q9H4I0 556 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF69Q9UC07 566 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 YIPF1Q9Y548 306 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRAG1Q86YV5 1406 aa2.91□□□□□ -1.94
RNU6-552P-201ENST00000362869 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 FRMD3A2A2Y4 597 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 PI4KAP2A4QPH2 592 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM8BA6NDV4 472 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMIM1B2RUZ4 78 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 H0YIN7 160 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 J3QR06 171 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLK4O00444 970 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCDH7O60245 1069 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 USO1O60763 962 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 CAVIN2O95810 425 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 CGAP01215 116 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 APOHP02749 345 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 RB1P06400 928 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLTBP09497 229 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 TNFAIP3P21580 790 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 MMP15P51511 669 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDH8P55286 799 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPOCK1Q08629 439 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 IKQ13123 557 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 DUOXA1Q1HG43 343 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF876PQ49A33 203 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 TECRLQ5HYJ1 363 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC30Q5VVM6 783 aa2.9□□□□□ -1.95
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa2.9□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms