RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mrpl37Q921S7 423 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rnf34Q99KR6 376 aa11.02□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 MlxiplQ99MZ3 864 aa11.02□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pcbd2Q9CZL5 136 aa11.02□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Spata17Q9D552 379 aa11.02□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdc20Q9JJ66 499 aa11.02□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trpc4Q9QUQ5 974 aa11.02□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pacsin2Q9WVE8 486 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 DnpepQ9Z2W0 473 aa11.02□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm8251F6VUT6 1994 aa11.02□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tgm7A2ART8 616 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Armc4B2RY50 1037 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm3460E9QAI8 215 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 AF366264G3X9P9 502 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm10715J3QP74 227 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Grap2O89100 322 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Il3P01586 166 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P01641 117 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sbk3P0C5K0 361 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PlgP20918 812 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 P2ry2P35383 373 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Psma2P49722 234 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 StarP51557 284 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Eif3eP60229 445 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pip5k1bP70181 539 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sox4Q06831 440 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Wfdc9Q3UW41 83 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Clca4bQ3UW98 925 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Syn2Q64332 586 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ankrd6Q69ZU8 712 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccdc154Q6RUT8 657 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fastkd5Q7TMV3 762 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Eml2Q7TNG5 649 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr845Q7TRG2 312 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 IpmkQ7TT16 396 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ntf4Q80VU4 209 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Baiap2l2Q80Y61 522 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mospd3Q8BGG6 235 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CyrenQ8BHZ5 157 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Chrnb3Q8BMN3 464 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Shisa7Q8C3Q5 558 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pnpt1Q8K1R3 783 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Acad10Q8K370 1069 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PhykplQ8R1K4 467 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Chrna3Q8R4G9 499 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CthQ8VCN5 398 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1208Q8VG47 308 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr808Q8VGI8 312 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr394Q8VGR5 310 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 DdoQ922Z0 341 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sugt1Q9CX34 336 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tspan11Q9D1D1 253 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Atp6v1e2Q9D593 226 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 S100pbpQ9D5K4 396 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Clca1Q9D7Z6 913 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Arr3Q9EQP6 381 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 PlekQ9JHK5 350 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Anxa9Q9JHQ0 345 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RecqlQ9Z129 648 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cacna2d3Q9Z1L5 1091 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pdpk1Q9Z2A0 559 aa11.01□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 HelzQ6DFV5 1964 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 FscbA1EGX6 1074 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1188A2AV10 312 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mup18A2BIM8 181 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm6880A3KG45 208 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pramef20B1ARV6 477 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lrp3E9Q1T6 790 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Kcng2F7A6P6 480 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mup11P04938 181 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Msx1P13297 303 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Trpv5P69744 723 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Anxa4P97429 319 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ampd1Q3V1D3 745 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm21320Q4FZE8 181 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm13103Q4VAD2 491 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Afap1l2Q5DTU0 825 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Armc5Q5EBP3 926 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Srsf1Q6PDM2 248 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q810S2 196 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Arl15Q8BGR6 204 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lpcat2Q8BYI6 544 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ppp4r4Q8C0Y0 875 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adgrg1Q8K209 687 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q8R3C1 574 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr1Q8VGI1 314 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Agap3Q8VHH5 910 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ubl7Q91W67 380 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Yif1bQ9CX30 311 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CinpQ9D0V8 212 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam227aQ9D3V8 625 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc25a27Q9D6D0 322 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prorsd1Q9D820 169 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 IcmtQ9EQK7 283 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gpr63Q9EQQ3 425 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Scgb2b20Q9JI02 112 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lgals8Q9JL15 316 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cetn2Q9R1K9 172 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 B9d1Q9R1S0 204 aa11□□□□□ -0.65
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 B4galt6Q9WVK5 382 aa11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 55.2 ms