Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
Gm6880A3KG45 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Gm6880A3KG45 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Gm6880A3KG45 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Gm6880A3KG45 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
Gm6880A3KG45 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Gm6880A3KG45 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Gm6880A3KG45 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Gm6880A3KG45 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Gm6880A3KG45 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Gm6880A3KG45 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Gm6880A3KG45 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Gm6880A3KG45 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Gm6880A3KG45 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Gm6880A3KG45 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Gm6880A3KG45 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Gm6880A3KG45 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Gm6880A3KG45 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Gm6880A3KG45 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Gm6880A3KG45 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Gm6880A3KG45 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gm6880A3KG45 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Gm6880A3KG45 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gm6880A3KG45 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gm6880A3KG45 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gm6880A3KG45 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Gm6880A3KG45 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Gm6880A3KG45 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Gm6880A3KG45 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Gm6880A3KG45 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gm6880A3KG45 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gm6880A3KG45 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gm6880A3KG45 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gm6880A3KG45 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Gm6880A3KG45 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Gm6880A3KG45 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gm6880A3KG45 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gm6880A3KG45 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gm6880A3KG45 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gm6880A3KG45 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Gm6880A3KG45 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gm6880A3KG45 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Gm6880A3KG45 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gm6880A3KG45 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Gm6880A3KG45 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Gm6880A3KG45 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Gm6880A3KG45 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Gm6880A3KG45 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gm6880A3KG45 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Gm6880A3KG45 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Gm6880A3KG45 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Gm6880A3KG45 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Gm6880A3KG45 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Gm6880A3KG45 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Gm6880A3KG45 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Gm6880A3KG45 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Gm6880A3KG45 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Gm6880A3KG45 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Gm6880A3KG45 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Gm6880A3KG45 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Gm6880A3KG45 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Gm6880A3KG45 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Gm6880A3KG45 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Gm6880A3KG45 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gm6880A3KG45 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Gm6880A3KG45 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Gm6880A3KG45 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gm6880A3KG45 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gm6880A3KG45 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gm6880A3KG45 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Gm6880A3KG45 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gm6880A3KG45 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gm6880A3KG45 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gm6880A3KG45 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gm6880A3KG45 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gm6880A3KG45 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Gm6880A3KG45 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Gm6880A3KG45 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Gm6880A3KG45 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gm6880A3KG45 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gm6880A3KG45 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gm6880A3KG45 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gm6880A3KG45 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gm6880A3KG45 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gm6880A3KG45 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gm6880A3KG45 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gm6880A3KG45 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Gm6880A3KG45 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gm6880A3KG45 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gm6880A3KG45 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gm6880A3KG45 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gm6880A3KG45 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gm6880A3KG45 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Gm6880A3KG45 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gm6880A3KG45 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Gm6880A3KG45 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Gm6880A3KG45 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Gm6880A3KG45 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Gm6880A3KG45 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Gm6880A3KG45 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
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