RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587914.1

EFTUD2-208, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-208ENST00000587914 SLC7A9P82251 487 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 TRAF2Q12933 501 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 CEACAM7Q14002 265 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 LRP8Q14114 963 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 OR4D1Q15615 310 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 PPM1LQ5SGD2 360 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 ARMC12Q5T9G4 340 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 TMEM198Q66K66 360 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 TTC23LQ6PF05 361 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 RNF165Q6ZSG1 346 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 RTL10Q7L3V2 364 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 MIER2Q8N344 545 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 LPCAT1Q8NF37 534 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 ADCY4Q8NFM4 1077 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 MDGA1Q8NFP4 955 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 GDPD5Q8WTR4 605 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 PYDC1Q8WXC3 89 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 GATA6Q92908 595 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 PHF21BQ96EK2 531 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 ALG14Q96F25 216 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 BIRC8Q96P09 236 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 FEM1AQ9BSK4 669 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 FAM192AQ9GZU8 254 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 RNF38Q9H0F5 515 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 P2RY12Q9H244 342 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 MUC13Q9H3R2 512 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 Q9H521 79 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 SPAG4Q9NPE6 437 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 C11orf16Q9NQ32 467 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 LATS2Q9NRM7 1088 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 NUDT4Q9NZJ9 180 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 TBX21Q9UL17 535 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 MED16Q9Y2X0 877 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 ZNF711Q9Y462 761 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 INSL5Q9Y5Q6 135 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 VWA8A3KMH1 1905 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 TTC3P53804 2025 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 A0A1W2PQ67 120 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 FAM221BA6H8Z2 402 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 CCDC85CA6NKD9 419 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 SOBPA7XYQ1 873 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 SUPT3HB4E1H0 165 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 UBXN8O00124 270 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 CCL22O00626 93 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 MRASO14807 208 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 TRIM24O15164 1050 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 AP1G1O43747 822 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 FBXO24O75426 580 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 SUPT3HO75486 399 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 ECI2O75521 394 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 GJB3O75712 270 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 PGLSO95336 258 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 STAMBPO95630 424 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 ESRRBO95718 433 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 FGF19O95750 216 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 TSPAN12O95859 305 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 NPPAP01160 153 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 UROSP10746 265 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 UQCRBP14927 111 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 RPL17P18621 184 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 GPX3P22352 226 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 FMO4P31512 558 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 MC4RP32245 332 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 RHOAP61586 193 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 CLCQ05315 142 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 TWF1Q12792 350 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 CDH18Q13634 790 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 ADGRE1Q14246 886 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 LAPTM4AQ15012 233 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-208ENST00000587914 PFKFB4Q16877 469 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46 ms