RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533362.1

PUF60-222, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 5

Gene PUF60, Length 616 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-222ENST00000533362 ITGA8P53708 1063 aa22.16■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 ITIH4Q14624 930 aa22.16■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 PROX2Q3B8N5 592 aa22.16■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 ARL10Q8N8L6 244 aa22.16■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 FAM46DQ8NEK8 389 aa22.16■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 BOCQ9BWV1 1114 aa22.16■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa22.16■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 QSOX1O00391 747 aa22.15■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 PFDN6O15212 129 aa22.15■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 CDK4P11802 303 aa22.15■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 ACP5P13686 325 aa22.15■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 SLC2A4P14672 509 aa22.15■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 FOXN2P32314 431 aa22.15■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 ACTR1BP42025 376 aa22.15■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 ARL4CP56559 192 aa22.15■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 ACTR1AP61163 376 aa22.15■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 NR0B2Q15466 257 aa22.15■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 INSCQ1MX18 579 aa22.15■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 PPM1JQ5JR12 505 aa22.15■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 CRTC3Q6UUV7 619 aa22.15■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 SERPINA9Q86WD7 417 aa22.15■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 CCNJLQ8IV13 435 aa22.15■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 MPP5Q8N3R9 675 aa22.15■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 OR6C4Q8NGE1 309 aa22.15■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 LRRC39Q96DD0 335 aa22.15■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa22.15■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 APOLD1Q96LR9 279 aa22.15■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 ZNF778Q96MU6 729 aa22.15■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 DPEP2Q9H4A9 486 aa22.15■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 VPS37BQ9H9H4 285 aa22.15■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 CATSPERZQ9NTU4 200 aa22.15■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 TAAR2Q9P1P5 351 aa22.15■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 SNX24Q9Y343 169 aa22.15■■□□□ 1.14
PUF60-222ENST00000533362 POLBP06746 335 aa22.14■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 CKMT1AP12532 417 aa22.14■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 NMBRP28336 390 aa22.14■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 RPL21P46778 160 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 CLCNKAP51800 687 aa22.14■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 CAV1Q03135 178 aa22.14■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 ILKQ13418 452 aa22.14■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 TCEA2Q15560 299 aa22.14■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 HIF1AQ16665 826 aa22.14■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 SLC30A9Q6PML9 568 aa22.14■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 MMGT1Q8N4V1 131 aa22.14■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa22.14■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 FAM96AQ9H5X1 160 aa22.14■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 PRKAB1Q9Y478 270 aa22.14■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa22.14■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa22.13■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 USP1O94782 785 aa22.13■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 AP2A2O94973 939 aa22.13■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 TTC4O95801 387 aa22.13■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 GSTM1P09488 218 aa22.13■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 PGAM1P18669 254 aa22.13■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 NSG1P42857 185 aa22.13■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 TTPAP49638 278 aa22.13■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 GSTM4Q03013 218 aa22.13■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 BCL7AQ4VC05 210 aa22.13■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 DUPD1Q68J44 220 aa22.13■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 MRNIPQ6NTE8 343 aa22.13■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 PACS1Q6VY07 963 aa22.13■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 NRROSQ86YC3 692 aa22.13■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 CCL4L1Q8NHW4 92 aa22.13■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 NAT6Q93015 286 aa22.13■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 MFSD3Q96ES6 412 aa22.13■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 SIGLEC10Q96LC7 697 aa22.13■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 DPH5Q9H2P9 285 aa22.13■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 CAAP1Q9H8G2 361 aa22.13■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa22.13■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa22.13■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa22.12■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 OR51F1A6NGY5 319 aa22.12■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 B4DGG1 531 aa22.12■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 VAPBO95292 243 aa22.12■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 ACP1P24666 158 aa22.12■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 AK4P27144 223 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 DBN1Q16643 649 aa22.12■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 BBS9Q3SYG4 887 aa22.12■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa22.12■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 OGFOD3Q6PK18 319 aa22.12■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 TMEM220Q6QAJ8 160 aa22.12■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 TMEM135Q86UB9 458 aa22.12■■□□□ 1.13
PUF60-222ENST00000533362 AMZ2Q86W34 360 aa22.12■■□□□ 1.13
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