RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 TRIM38O00635 465 aa26.48■■□□□ 1.83
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SH3BP2-212ENST00000508338 SIGLEC6O43699 453 aa26.48■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 GOT2P00505 430 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 CDK4P11802 303 aa26.48■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 FOXN2P32314 431 aa26.48■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 CLCNKAP51800 687 aa26.48■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 ARL4CP56559 192 aa26.48■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 CTBSQ01459 385 aa26.48■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 DEFB133Q30KQ1 61 aa26.48■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 PROX2Q3B8N5 592 aa26.48■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 DUPD1Q68J44 220 aa26.48■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa26.48■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa26.48■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF778Q96MU6 729 aa26.48■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 CAMK1GQ96NX5 476 aa26.48■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 SNX24Q9Y343 169 aa26.48■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 SPTBN4Q9H254 2564 aa26.47■■□□□ 1.83
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SH3BP2-212ENST00000508338 DCDC2BA2VCK2 349 aa26.47■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 MTX2O75431 263 aa26.47■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 USP1O94782 785 aa26.47■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 TTC4O95801 387 aa26.47■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 POLBP06746 335 aa26.47■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 CKMT2P17540 419 aa26.47■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 RPL21P46778 160 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 DRG2P55039 364 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
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SH3BP2-212ENST00000508338 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa26.47■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM135Q86UB9 458 aa26.47■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 SERPINA9Q86WD7 417 aa26.47■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 ARL10Q8N8L6 244 aa26.47■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM46DQ8NEK8 389 aa26.47■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 OR6C4Q8NGE1 309 aa26.47■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 SIGLEC10Q96LC7 697 aa26.47■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 VPS37BQ9H9H4 285 aa26.47■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 CATSPERZQ9NTU4 200 aa26.47■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa26.47■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 GPR39O43194 453 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 AP2A2O94973 939 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 GSTM1P09488 218 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 CKMT1AP12532 417 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC2A4P14672 509 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 NMBRP28336 390 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 NSG1P42857 185 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 TTPAP49638 278 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 DAB2P98082 770 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 GSTM4Q03013 218 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 ILKQ13418 452 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 MRNIPQ6NTE8 343 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 MFSD3Q96ES6 412 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 APOLD1Q96LR9 279 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 PGAM1P18669 254 aa26.45■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 ACTR1BP42025 376 aa26.45■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 ACTR1AP61163 376 aa26.45■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 CBLBQ13191 982 aa26.45■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 NR0B2Q15466 257 aa26.45■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 INSCQ1MX18 579 aa26.45■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa26.45■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 BCL7AQ4VC05 210 aa26.45■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 OGFOD3Q6PK18 319 aa26.45■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 PACS1Q6VY07 963 aa26.45■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa26.45■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
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SH3BP2-212ENST00000508338 LMNTD2Q8IXW0 634 aa26.45■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 DPEP2Q9H4A9 486 aa26.45■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM96AQ9H5X1 160 aa26.45■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 TAAR2Q9P1P5 351 aa26.45■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa26.45■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
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SH3BP2-212ENST00000508338 SLC30A9Q6PML9 568 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 TMEM220Q6QAJ8 160 aa26.44■■□□□ 1.82
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SH3BP2-212ENST00000508338 PIANPQ8IYJ0 282 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 NAT6Q93015 286 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 TCF12Q99081 682 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
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SH3BP2-212ENST00000508338 DPH5Q9H2P9 285 aa26.44■■□□□ 1.82
SH3BP2-212ENST00000508338 BPTFQ12830 3046 aa26.44■■□□□ 1.82
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