RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469852.5

COL9A3-209, Transcript of collagen type IX alpha 3 chain, humanhuman

TSL 3

Gene COL9A3, Length 901 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3-209ENST00000469852 BNIP3Q12983 259 aa14.61□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 CTBP1Q13363 440 aa14.61□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 CSRP2Q16527 193 aa14.61□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 KYNUQ16719 465 aa14.61□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 ZNF470Q6ECI4 717 aa14.61□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 ZNF547Q8IVP9 402 aa14.61□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 PHACTR4Q8IZ21 702 aa14.61□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 OTUD6BQ8N6M0 293 aa14.61□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 GPR150Q8NGU9 434 aa14.61□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 GSDMBQ8TAX9 411 aa14.61□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 SKA1Q96BD8 255 aa14.61□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 COPS8Q99627 209 aa14.61□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 GAREM1Q9H706 876 aa14.61□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa14.61□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 SMYD2Q9NRG4 433 aa14.61□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 VPS18Q9P253 973 aa14.61□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 ST14Q9Y5Y6 855 aa14.61□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 OR2AG2A6NM03 316 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 TNFRSF10CO14798 259 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 CHUKO15111 745 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 NUAK1O60285 661 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 LRP3O75074 770 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 CDK14O94921 469 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 IVLP07476 585 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 JUNDP17535 347 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 MSH3P20585 1137 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 KELP23276 732 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 GNPDA1P46926 289 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 HK3P52790 923 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 TUBB4BP68371 445 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 MPP1Q00013 466 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 PPARDQ03181 441 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 C1orf61Q13536 156 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 TYSND1Q2T9J0 566 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 PYCR3Q53H96 274 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 CRTC3Q6UUV7 619 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 PRR23CQ6ZRP0 262 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 CILP2Q8IUL8 1156 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 RELL1Q8IUW5 271 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 PALM2Q8IXS6 379 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 MINDY1Q8N5J2 469 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 CLDN19Q8N6F1 224 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 CCL4L1Q8NHW4 92 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 SGF29Q96ES7 293 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 LRRC61Q9BV99 259 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 PARD6BQ9BYG5 372 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 TXLNGYQ9BZA5 131 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 TMEM168Q9H0V1 697 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 UCKL1Q9NWZ5 548 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 MOCS1Q9NZB8 636 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 DGKBQ9Y6T7 804 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa14.6□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 A0A1B0GTQ1 180 aa14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 VEGFDO43915 354 aa14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 GDF9O60383 454 aa14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 RASGRP1O95267 797 aa14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 S1PR4O95977 384 aa14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 SYPP08247 313 aa14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 OGNP20774 298 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 GABRB3P28472 473 aa14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 ABCG1P45844 678 aa14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.073e-7■□□□□ 10.5
COL9A3-209ENST00000469852 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 WDR93Q6P2C0 686 aa14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 TMEM220Q6QAJ8 160 aa14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 C11orf96Q7Z7L8 435 aa14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 SPNS2Q8IVW8 549 aa14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 CNTN4Q8IWV2 1026 aa14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 LPGAT1Q92604 370 aa14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 CLPBQ9H078 707 aa14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 VPS37BQ9H9H4 285 aa14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 SLC23A2Q9UGH3 650 aa14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 PSAT1Q9Y617 370 aa14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa14.58□□□□□ -0.07
COL9A3-209ENST00000469852 GRID2O43424 1007 aa14.58□□□□□ -0.08
COL9A3-209ENST00000469852 PIAS2O75928 621 aa14.58□□□□□ -0.08
COL9A3-209ENST00000469852 ACSL3O95573 720 aa14.58□□□□□ -0.08
COL9A3-209ENST00000469852 CER1O95813 267 aa14.58□□□□□ -0.08
COL9A3-209ENST00000469852 TNFP01375 233 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms