RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 CBFA2T2O43439 604 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 SUV39H1O43463 412 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 MFAP3LO75121 409 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 STK17BO94768 372 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 CDK14O94921 469 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 VIPP01282 170 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 GPR89BP0CG08 455 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 PRKAR1AP10644 381 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 RPL10P27635 214 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC19A1P41440 591 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 CCR10P46092 362 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 SEPHS1P49903 392 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 CSRP3P50461 194 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 CLCNKAP51800 687 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 POLE2P56282 527 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 NOMO1Q15155 1222 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 TEX44Q53QW1 395 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 PDPK2PQ6A1A2 396 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 CCDC70Q6NSX1 233 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 MFSD7Q6UXD7 560 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 LRRTM4Q86VH4 590 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 VSIG1Q86XK7 387 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 PLXDC1Q8IUK5 500 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF547Q8IVP9 402 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 VSTM4Q8IW00 320 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 RHOT2Q8IXI1 618 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 RHOT1Q8IXI2 618 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC45A3Q96JT2 553 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 TEKT5Q96M29 485 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 TGM7Q96PF1 710 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 ZPBPQ9BS86 351 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC25A18Q9H1K4 315 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 EPB41L1Q9H4G0 881 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 UCK1Q9HA47 277 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 ABHD10Q9NUJ1 306 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 OGFRQ9NZT2 677 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 TRIM10Q9UDY6 481 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 IL17BQ9UHF5 180 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP4-206ENST00000446904 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 OR52A4PA6NMU1 304 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 TERTO14746 1132 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 KMOO15229 486 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 SPOPO43791 374 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 VEGFDO43915 354 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 UBXN7O94888 489 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 DLGAP3O95886 979 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 TPM1P09493 284 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 ANKRD34CP0C6C1 535 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 AMD1P17707 334 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 COMTP21964 271 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 PTPN3P26045 913 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 CD68P34810 354 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 CDKN2BP42772 138 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 DRG2P55039 364 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 FOXM1Q08050 763 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 KCNAB2Q13303 367 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC14A2Q15849 920 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 KAZNQ674X7 775 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC25A41Q8N5S1 370 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 GDAP1Q8TB36 358 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 C9orf72Q96LT7 481 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 TIMM29Q9BSF4 260 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 ADNPQ9H2P0 1102 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 COL12A1Q99715 3063 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 PRR19A6NJB7 356 aa10.13□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 CST8O60676 142 aa10.13□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 RASSF9O75901 435 aa10.13□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 C9P02748 559 aa10.13□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 BRAFP15056 766 aa10.13□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF28P17035 718 aa10.13□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 NFKB1P19838 968 aa10.13□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 IDSP22304 550 aa10.13□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 OAS2P29728 719 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 SLC1A1P43005 524 aa10.13□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 CHRNA4P43681 627 aa10.13□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 NR2C2P49116 596 aa10.13□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 WNT3AP56704 352 aa10.13□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 SH3BP2P78314 561 aa10.13□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 ABHD18Q0P651 414 aa10.13□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 WASHC5Q12768 1159 aa10.13□□□□□ -0.79
SH3BP4-206ENST00000446904 GTF2H3Q13889 308 aa10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms