RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440289.6

PTPRJ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 3,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-202ENST00000440289 C16orf59Q7L2K0 433 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 LZTR1Q8N653 840 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 STAG3L4Q8TBR4 150 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 FAM162AQ96A26 154 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 TSGA13Q96PP4 275 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 VPS45Q9NRW7 570 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 TAS2R13Q9NYV9 303 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 A0A1W2PQ67 120 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 SYCE1LA8MT33 242 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 ARVCFO00192 962 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 IDO1P14902 403 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 FSHRP23945 695 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 IL12AP29459 219 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 CHRNB3Q05901 458 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 UPP1Q16831 310 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 MS4A13Q5J8X5 152 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 PSD4Q8NDX1 1056 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 PTPN18Q99952 460 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 BDH2Q9BUT1 245 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 DAPK2Q9UIK4 370 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 TMEM247A6NEH6 219 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 UPK3BL1B0FP48 263 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 UPK3BL2E5RIL1 263 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 SPIDRQ14159 915 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 TRIM16LQ309B1 348 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 GTDC1Q4AE62 458 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 BORAQ6PGQ7 559 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 LHPPQ9H008 270 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 ARMC1Q9NVT9 282 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 SH3GLB1Q9Y371 365 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 SPO11Q9Y5K1 396 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 DNAH14Q0VDD8 3507 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 CST1P01037 141 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 DNAJB2P25686 324 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 IL5RAQ01344 420 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 BBS5Q8N3I7 341 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 FBXO32Q969P5 355 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 FKBPLQ9UIM3 349 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 NEU3Q9UQ49 428 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 A0A1W2PP18 115 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 AQP12BA6NM10 295 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 CFAP99D6REC4 459 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 ACOX3O15254 700 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC7A4O43246 635 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 DFNA5O60443 496 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 CTPS1P17812 591 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 KCNQ1P51787 676 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 CDC42EP1Q00587 391 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 ATP6AP1Q15904 470 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 PRR23BQ6ZRT6 265 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 AQP12AQ8IXF9 295 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 LGI2Q8N0V4 545 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 TBC1D15Q8TC07 691 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 ZBED2Q9BTP6 218 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 TOR3AQ9H497 397 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
PTPRJ-202ENST00000440289 ASPDHA6ND91 283 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-202ENST00000440289 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-202ENST00000440289 LRATO95237 230 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-202ENST00000440289 RASAL1O95294 804 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-202ENST00000440289 CSRP3P50461 194 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-202ENST00000440289 TUBA4AP68366 448 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-202ENST00000440289 BNIP2Q12982 314 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-202ENST00000440289 DNASE1L3Q13609 305 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-202ENST00000440289 DTWD1Q8N5C7 304 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-202ENST00000440289 TOP1MTQ969P6 601 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-202ENST00000440289 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-202ENST00000440289 TRMOQ9BU70 441 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-202ENST00000440289 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-202ENST00000440289 MFSD1Q9H3U5 465 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-202ENST00000440289 PADI3Q9ULW8 664 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-202ENST00000440289 PADI4Q9UM07 663 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRJ-202ENST00000440289 MGEA5O60502 916 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRJ-202ENST00000440289 B3GALT4O96024 378 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRJ-202ENST00000440289 MMP2P08253 660 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRJ-202ENST00000440289 ACADVLP49748 655 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRJ-202ENST00000440289 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRJ-202ENST00000440289 GPSM1Q86YR5 675 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRJ-202ENST00000440289 PIANPQ8IYJ0 282 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC22A15Q8IZD6 547 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRJ-202ENST00000440289 ELMO1Q92556 727 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRJ-202ENST00000440289 SERPINB11Q96P15 392 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRJ-202ENST00000440289 ZNF510Q9Y2H8 683 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRJ-202ENST00000440289 H0Y626 953 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRJ-202ENST00000440289 TRIM16O95361 564 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRJ-202ENST00000440289 FUCA1P04066 466 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRJ-202ENST00000440289 SERPINF2P08697 491 aa18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms