RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390930.1

SNORD17-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 17, humanhuman

BASIC

Gene SNORD17, Length 237 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD17-201ENST00000390930 ACVR1Q04771 509 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 CDH17Q12864 832 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 GPS1Q13098 491 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 ILKQ13418 452 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 NFATC2Q13469 925 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 SEPT6Q14141 434 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 NFE2L1Q14494 772 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 NR1D2Q14995 579 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 CLCA4Q14CN2 919 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 NR0B2Q15466 257 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 TPSAB1Q15661 275 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 DBN1Q16643 649 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 INAVAQ3KP66 663 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 MSS51Q4VC12 460 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 C14orf28Q4W4Y0 310 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 TSTD2Q5T7W7 516 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 HES3Q5TGS1 186 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 PDPK2PQ6A1A2 396 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 LRRC8BQ6P9F7 803 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 IYDQ6PHW0 289 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 TMEM220Q6QAJ8 160 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 CRTC3Q6UUV7 619 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 CES3Q6UWW8 571 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 SYT10Q6XYQ8 523 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 DET1Q7L5Y6 550 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF438Q7Z4V0 828 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 SNX20Q7Z614 316 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 GALNT13Q8IUC8 556 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 NXPE1Q8N323 547 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 SFRP1Q8N474 314 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 CCDC89Q8N998 374 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 NAT8LQ8N9F0 302 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 SLC37A2Q8TED4 501 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 SLCO2A1Q92959 643 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 HDAC10Q969S8 669 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 CCDC74AQ96AQ1 378 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 MFSD3Q96ES6 412 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 SGF29Q96ES7 293 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 SIGLEC10Q96LC7 697 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 PWWP2AQ96N64 755 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 RANBP9Q96S59 729 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 NRTNQ99748 197 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 C19orf43Q9BQ61 176 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 CCDC3Q9BQI4 270 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 FERMT1Q9BQL6 677 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 GSDMCQ9BYG8 508 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 CDH19Q9H159 772 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 DPEP2Q9H4A9 486 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 ASB8Q9H765 288 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 RMI1Q9H9A7 625 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 CHRAC1Q9NRG0 131 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 RAD18Q9NS91 495 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 HOMER3Q9NSC5 361 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 TREX1Q9NSU2 369 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 SYBUQ9NX95 663 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 PCYOX1Q9UHG3 505 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 APPL1Q9UKG1 709 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 RIMKLBQ9ULI2 386 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 MSRB2Q9Y3D2 182 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 PKP3Q9Y446 797 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 TCAF1Q9Y4C2 921 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 SAR1BQ9Y6B6 198 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 URB1O60287 2271 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 ANKRD12Q6UB98 2062 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 IGF2RP11717 2491 aa3.42□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 CEP295Q9C0D2 2601 aa3.41□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 ADAMTS20P59510 1910 aa3.41□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 ACACAQ13085 2346 aa3.41□□□□□ -1.86
SNORD17-201ENST00000390930 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa3.41□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms