RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 PPEF2O14830 753 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 SPIBQ01892 262 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC9A5Q14940 896 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 PDGFRLQ15198 375 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 SPANXN2Q5MJ10 180 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM220Q6QAJ8 160 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 TBC1D21Q8IYX1 336 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 SFRP1Q8N474 314 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 MOSPD2Q8NHP6 518 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 PCBD2Q9H0N5 130 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 NEK6Q9HC98 313 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 CACNG4Q9UBN1 327 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 CNTN6Q9UQ52 1028 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa16.2■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 PDZK1Q5T2W1 519 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 MSANTD2Q6P1R3 559 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 CPNE9Q8IYJ1 553 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF248Q8NDW4 579 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 CLHC1Q8NHS4 586 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 PPP1R14AQ96A00 147 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 SCML2Q9UQR0 700 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 INCA1Q0VD86 236 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 TRAF3Q13114 568 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 CHIT1Q13231 466 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 NPAS2Q99743 824 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 SMOC2Q9H3U7 446 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 EGFL7Q9UHF1 273 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 CCNA2P20248 432 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 ECT2LQ008S8 904 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 GTF2H2Q13888 395 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 IL23RQ5VWK5 629 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 GALNT18Q6P9A2 607 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 LCN9Q8WX39 176 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 DENND6AQ8IWF6 608 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 C7orf43Q8WVR3 580 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 MYDGFQ969H8 173 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 AGAP2Q99490 1192 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 GKN1Q9NS71 199 aa16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A1W2PQY0 241 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 EFCAB10A6NFE3 127 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 METTL18O95568 372 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 CHN2P52757 468 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 BROXQ5VW32 411 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 GK5Q6ZS86 529 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 SNX20Q7Z614 316 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 CNTD1Q8N815 330 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 DGCR6LQ9BY27 220 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 PALMDQ9NP74 551 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 FPGTO14772 594 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 IL1R2P27930 398 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 GRIP2Q9C0E4 1043 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 HDHD2Q9H0R4 259 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 MUC13Q9H3R2 512 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 SUV39H2Q9H5I1 410 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC31A1O15431 190 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC35G6P0C7Q6 338 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF132P52740 706 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 C2orf80Q0P641 193 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 DGCR6Q14129 220 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 SNAP47Q5SQN1 464 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 UBXN11Q5T124 520 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 TRAF7Q6Q0C0 670 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 SMYD1Q8NB12 490 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 SLCO2A1Q92959 643 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 BTBD9Q96Q07 612 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 OSBPL11Q9BXB4 747 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 IQCF5A8MTL0 148 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM63AO94886 807 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 PRPS2P11908 318 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 AKT2P31751 481 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 DEF8Q6ZN54 512 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM220AQ7Z4H9 259 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM192AQ9GZU8 254 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 ARL8BQ9NVJ2 186 aa16.18■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 PI15O43692 258 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 NPHS1O60500 1241 aa16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms