RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261349.8

LRP6-201, Transcript of LDL receptor related protein 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP6, Length 10,020 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP6-201ENST00000261349 SLC37A3Q8NCC5 494 aa4.81□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 OTULINQ96BN8 352 aa4.81□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 ZNF670Q9BS34 389 aa4.81□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 TRIM54Q9BYV2 358 aa4.81□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 RHOJQ9H4E5 214 aa4.81□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 SMLR1H3BR10 107 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 CABYRO75952 493 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 MICAL2O94851 1124 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 AGXTP21549 392 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 EVI2BP34910 448 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 PPP5CP53041 499 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 GJA9P57773 515 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 VPS72Q15906 364 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 CRY1Q16526 586 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 FAM205BPQ63HN1 556 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 RIOX2Q8IUF8 465 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 FAM45AQ8TCE6 357 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 MUL1Q969V5 352 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 PSKH2Q96QS6 385 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 CDADC1Q9BWV3 514 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 NECTIN3Q9NQS3 549 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 INVSQ9Y283 1065 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 TCAF1Q9Y4C2 921 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 NEMP2A6NFY4 417 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 hCG_2039718K7EN88 272 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 MITFO75030 526 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 JCHAINP01591 159 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 SPNP16150 400 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 NR2C2P49116 596 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 DEFA5Q01523 94 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 CDK10Q15131 360 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 SNAPC1Q16533 368 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 C6orf141Q5SZD1 244 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 XYLT1Q86Y38 959 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 NT5DC4Q86YG4 428 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 ABCG8Q9H221 673 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 BRD7Q9NPI1 651 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 SEC14L2O76054 403 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 NR3C2P08235 984 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 PTPN2P17706 415 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 MAZP56270 477 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 CLCA4Q14CN2 919 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 PLEKHG6Q3KR16 790 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 HSD17B12Q53GQ0 312 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 TOR2AQ5JU69 321 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 C11orf88Q6PI97 169 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 CFAP77Q6ZQR2 320 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 SCUBE3Q8IX30 993 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 PARP16Q8N5Y8 322 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 EFHBQ8N7U6 833 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 TRPV1Q8NER1 839 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 TRPV3Q8NET8 790 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 AP3S1Q92572 193 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 MYLPFQ96A32 169 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 VMP1Q96GC9 406 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 NECTIN4Q96NY8 510 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 ATXN3LQ9H3M9 355 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 CYP3A43Q9HB55 503 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 DNMT3LQ9UJW3 386 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 RIMKLBQ9ULI2 386 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 PGK2P07205 417 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 ARSAP15289 507 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 GOT1P17174 413 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 OR3A3P47888 321 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 BTN1A1Q13410 526 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 GNA13Q14344 377 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 GPR162Q16538 588 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 OR5B17Q8NGF7 314 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 OR5K1Q8NHB7 308 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 TFAP2BQ92481 460 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 ZNF285Q96NJ3 590 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 ACOX2Q99424 681 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 SLC2A11Q9BYW1 496 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 MUC3BQ9H195 1237 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 IL1RAPQ9NPH3 570 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 STARD7Q9NQZ5 370 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 DMAC2Q9NW81 257 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 TSPAN16Q9UKR8 245 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 MAU2Q9Y6X3 613 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 SDHDO14521 159 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 HPRP00739 348 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 ITGB3P05106 788 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 CYP11A1P05108 521 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 ITGB6P18564 788 aa4.8□□□□□ -1.64
LRP6-201ENST00000261349 WEE1P30291 646 aa4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms