RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000101395.2

Hoxa4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxa4, Length 1,594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm10800D3Z496 220 aa28.49■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Eef1bO70251 225 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Scd1P13516 355 aa28.49■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 ChgbP16014 677 aa28.49■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rbp1Q00915 135 aa28.49■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Akap14Q3V0I7 536 aa28.49■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tigd3Q7TM95 470 aa28.49■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mettl22Q8R1C6 393 aa28.49■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Spats2lQ91WJ7 558 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 WwoxQ91WL8 414 aa28.49■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 GmprQ9DCZ1 345 aa28.49■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tle6Q9WVB3 581 aa28.49■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Btnl6A2CG22 539 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nt5c1aA3KFX0 365 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Vmn2r21K7N6Y7 853 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Vmn2r20L7N2B1 853 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Syn1O88935 706 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 GhrhrP32082 423 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cxcr2P35343 359 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Vps26aP40336 327 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 UcmaQ14BU0 138 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tra2aQ6PFR5 281 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pggt1bQ8BUY9 377 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 MdficQ8BX65 247 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 SntnQ8C9X1 147 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ipo13Q8K0C1 963 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Hid1Q8R1F6 788 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Hdac8Q8VH37 377 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 GzmnQ920S1 248 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Trim12aQ99PQ1 284 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cyc1Q9D0M3 325 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Smad9Q9JIW5 430 aa28.48■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tdrd6P61407 2134 aa28.47■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ighv11-1A0A075B5R6 117 aa28.47■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 A0A1Y7VP24 259 aa28.47■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr726E9Q8X3 321 aa28.47■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Dsg2O55111 1122 aa28.47■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 ZfrO88532 1074 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr725Q05A45 321 aa28.47■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ggt1Q60928 568 aa28.47■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cyp1b1Q64429 543 aa28.47■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ssxb5Q6XAS2 159 aa28.47■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Atg16l1Q8C0J2 607 aa28.47■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Irak3Q8K4B2 609 aa28.47■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 RalbQ9JIW9 206 aa28.47■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Dcun1d1Q9QZ73 259 aa28.47■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 RgrQ9Z2B3 291 aa28.47■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gria3Q9Z2W9 888 aa28.47■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Faap100A2ACJ2 879 aa28.46■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Map3k10Q66L42 940 aa28.46■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fastkd1Q6DI86 829 aa28.46■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Utp14bQ6EJB6 756 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ddx51Q6P9R1 639 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Wasf2Q8BH43 497 aa28.46■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Prkaa2Q8BRK8 552 aa28.46■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Svs2Q8BS30 375 aa28.46■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 RalylQ8BTF8 293 aa28.46■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Hdac7Q8C2B3 938 aa28.46■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gas2l1Q8JZP9 678 aa28.46■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 SuoxQ8R086 546 aa28.46■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr398Q8VFY0 314 aa28.46■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Syt17Q920M7 470 aa28.46■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tceal1Q921P9 165 aa28.46■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Taf7lQ9D3R9 471 aa28.46■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 AadatQ9WVM8 425 aa28.46■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Krt6bQ9Z331 562 aa28.46■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slc11a1P41251 548 aa28.45■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Atp6v0d1P51863 351 aa28.45■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lefty2P57785 368 aa28.45■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Prmt9Q3U3W5 846 aa28.45■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fam91a1Q3UVG3 837 aa28.45■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ppp1r13lQ5I1X5 824 aa28.45■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Heatr6Q6P1G0 1184 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cog4Q8R1U1 785 aa28.45■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Q9CPS8 106 aa28.45■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Hyal6Q9D4E9 494 aa28.45■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ppp1r2Q9DCL8 206 aa28.45■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Plxna2P70207 1894 aa28.45■■■□□ 2.15
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tex13aA2AFS9 377 aa28.45■■■□□ 2.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lrrc31F6VYM1 502 aa28.45■■■□□ 2.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr596F8VQ26 312 aa28.45■■■□□ 2.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Zfp871G5E905 615 aa28.45■■■□□ 2.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 RngttO55236 597 aa28.45■■■□□ 2.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 VimP20152 466 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Htr4P97288 388 aa28.45■■■□□ 2.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Bpifa1P97361 278 aa28.45■■■□□ 2.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 TekQ02858 1122 aa28.45■■■□□ 2.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Rabl6Q5U3K5 725 aa28.45■■■□□ 2.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 PianpQ6P1B3 278 aa28.45■■■□□ 2.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 GnasQ6R0H7 1133 aa28.45■■■□□ 2.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Olfr45Q8VGM1 311 aa28.45■■■□□ 2.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tcam1Q99NB3 548 aa28.45■■■□□ 2.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ndufab1Q9CR21 156 aa28.45■■■□□ 2.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Spc24Q9D083 201 aa28.45■■■□□ 2.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sun1Q9D666 913 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tp73Q9JJP2 631 aa28.45■■■□□ 2.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cacna1eQ61290 2272 aa28.45■■■□□ 2.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mup18A2BIM8 181 aa28.44■■■□□ 2.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Eif2b3B1AUN2 452 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fam181aJ3QNB7 292 aa28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.8 ms