RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637223.1

CLN6-218, Transcript of CLN6, transmembrane ER protein, humanhuman

TSL 5

Gene CLN6, Length 652 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6-218ENST00000637223 ANP32CO43423 234 aa23.1■■□□□ 1.29
CLN6-218ENST00000637223 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa23.1■■□□□ 1.29
CLN6-218ENST00000637223 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
CLN6-218ENST00000637223 TATP17735 454 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
CLN6-218ENST00000637223 PDE3BQ13370 1112 aa23.09■■□□□ 1.29
CLN6-218ENST00000637223 AEBP1Q8IUX7 1158 aa23.09■■□□□ 1.29
CLN6-218ENST00000637223 WNK3Q9BYP7 1800 aa23.09■■□□□ 1.29
CLN6-218ENST00000637223 EXOC5O00471 708 aa23.08■■□□□ 1.29
CLN6-218ENST00000637223 SULT6B1Q6IMI4 303 aa23.08■■□□□ 1.29
CLN6-218ENST00000637223 CAMKK2Q96RR4 588 aa23.08■■□□□ 1.29
CLN6-218ENST00000637223 LRRC37A3O60309 1634 aa23.08■■□□□ 1.28
CLN6-218ENST00000637223 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
CLN6-218ENST00000637223 TRIM37O94972 964 aa23.06■■□□□ 1.28
CLN6-218ENST00000637223 HMOX1P09601 288 aa23.06■■□□□ 1.28
CLN6-218ENST00000637223 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.06■■□□□ 1.28
CLN6-218ENST00000637223 TNS2Q63HR2 1409 aa23.06■■□□□ 1.28
CLN6-218ENST00000637223 NUDCQ9Y266 331 aa23.04■■□□□ 1.28
CLN6-218ENST00000637223 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CLN6-218ENST00000637223 APBA3O96018 575 aa23.03■■□□□ 1.28
CLN6-218ENST00000637223 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
CLN6-218ENST00000637223 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CLN6-218ENST00000637223 FAM196AQ6ZSG2 479 aa23.02■■□□□ 1.28
CLN6-218ENST00000637223 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
CLN6-218ENST00000637223 KDRP35968 1356 aa23.01■■□□□ 1.27
CLN6-218ENST00000637223 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
CLN6-218ENST00000637223 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.27
CLN6-218ENST00000637223 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
CLN6-218ENST00000637223 SPG7Q9UQ90 795 aa22.97■■□□□ 1.27
CLN6-218ENST00000637223 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN6-218ENST00000637223 CCDC184Q52MB2 194 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN6-218ENST00000637223 NBPF14Q5TI25 921 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN6-218ENST00000637223 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN6-218ENST00000637223 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.96■■□□□ 1.27
CLN6-218ENST00000637223 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
CLN6-218ENST00000637223 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
CLN6-218ENST00000637223 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
CLN6-218ENST00000637223 CYP27B1O15528 508 aa22.94■■□□□ 1.26
CLN6-218ENST00000637223 PRKAR2BP31323 418 aa22.94■■□□□ 1.26
CLN6-218ENST00000637223 RSPH6AQ9H0K4 717 aa22.94■■□□□ 1.26
CLN6-218ENST00000637223 AMOTQ4VCS5 1084 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN6-218ENST00000637223 SPON1Q9HCB6 807 aa22.93■■□□□ 1.26
CLN6-218ENST00000637223 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa22.92■■□□□ 1.26
CLN6-218ENST00000637223 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.92■■□□□ 1.26
CLN6-218ENST00000637223 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CLN6-218ENST00000637223 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.91■■□□□ 1.26
CLN6-218ENST00000637223 FCHSD2O94868 740 aa22.91■■□□□ 1.26
CLN6-218ENST00000637223 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.26
CLN6-218ENST00000637223 KCNQ2O43526 872 aa22.9■■□□□ 1.26
CLN6-218ENST00000637223 PHKG2P15735 406 aa22.9■■□□□ 1.26
CLN6-218ENST00000637223 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.9■■□□□ 1.26
CLN6-218ENST00000637223 MRS2Q9HD23 443 aa22.9■■□□□ 1.26
CLN6-218ENST00000637223 IFNL2Q8IZJ0 200 aa22.89■■□□□ 1.25
CLN6-218ENST00000637223 BCL9O00512 1426 aa22.89■■□□□ 1.25
CLN6-218ENST00000637223 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
CLN6-218ENST00000637223 PHACTR3Q96KR7 559 aa22.88■■□□□ 1.25
CLN6-218ENST00000637223 C1orf141Q5JVX7 400 aa22.86■■□□□ 1.25
CLN6-218ENST00000637223 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.86■■□□□ 1.25
CLN6-218ENST00000637223 RREB1Q92766 1687 aa22.86■■□□□ 1.25
CLN6-218ENST00000637223 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.85■■□□□ 1.25
CLN6-218ENST00000637223 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.85■■□□□ 1.25
CLN6-218ENST00000637223 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
CLN6-218ENST00000637223 GAS2L2Q8NHY3 880 aa22.83■■□□□ 1.25
CLN6-218ENST00000637223 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
CLN6-218ENST00000637223 PLEKHF1Q96S99 279 aa22.83■■□□□ 1.25
CLN6-218ENST00000637223 NEFMP07197 916 aa22.82■■□□□ 1.24
CLN6-218ENST00000637223 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CLN6-218ENST00000637223 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.82■■□□□ 1.24
CLN6-218ENST00000637223 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.82■■□□□ 1.24
CLN6-218ENST00000637223 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CLN6-218ENST00000637223 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
CLN6-218ENST00000637223 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CLN6-218ENST00000637223 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa22.81■■□□□ 1.24
CLN6-218ENST00000637223 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa22.81■■□□□ 1.24
CLN6-218ENST00000637223 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
CLN6-218ENST00000637223 DCAF5Q96JK2 942 aa22.8■■□□□ 1.24
CLN6-218ENST00000637223 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CLN6-218ENST00000637223 MIER1Q8N108 512 aa22.78■■□□□ 1.24
CLN6-218ENST00000637223 DOT1LQ8TEK3 1739 aa22.78■■□□□ 1.24
CLN6-218ENST00000637223 NHSQ6T4R5 1651 aa22.77■■□□□ 1.24
CLN6-218ENST00000637223 MAP3K5Q99683 1374 aa22.77■■□□□ 1.24
CLN6-218ENST00000637223 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
CLN6-218ENST00000637223 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.76■■□□□ 1.23
CLN6-218ENST00000637223 RUNDC1Q96C34 613 aa22.76■■□□□ 1.23
CLN6-218ENST00000637223 LGR6Q9HBX8 967 aa22.76■■□□□ 1.23
CLN6-218ENST00000637223 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.76■■□□□ 1.23
CLN6-218ENST00000637223 SBF2Q86WG5 1849 aa22.75■■□□□ 1.23
CLN6-218ENST00000637223 NFE2L2Q16236 605 aa22.75■■□□□ 1.23
CLN6-218ENST00000637223 CCER2I3L3R5 266 aa22.74■■□□□ 1.23
CLN6-218ENST00000637223 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
CLN6-218ENST00000637223 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.74■■□□□ 1.23
CLN6-218ENST00000637223 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.73■■□□□ 1.23
CLN6-218ENST00000637223 CABP4P57796 275 aa22.73■■□□□ 1.23
CLN6-218ENST00000637223 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.73■■□□□ 1.23
CLN6-218ENST00000637223 PIGBQ92521 554 aa22.73■■□□□ 1.23
CLN6-218ENST00000637223 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa22.72■■□□□ 1.23
CLN6-218ENST00000637223 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CLN6-218ENST00000637223 IL17REQ8NFR9 667 aa22.71■■□□□ 1.23
CLN6-218ENST00000637223 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
CLN6-218ENST00000637223 TMPOP42166 694 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CLN6-218ENST00000637223 DCTN1Q14203 1278 aa22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms