RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609764.1

PCMTD2-208, Transcript of protein-L-isoaspartate (D-aspartate) O-methyltransferase domain containing 2, human

TSL 4

Gene PCMTD2, Length 572 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCMTD2-208	ENST00000609764	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		10.14	□□□□□ -0.79
PCMTD2-208	ENST00000609764	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PCMTD2-208	ENST00000609764	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PCMTD2-208	ENST00000609764	KANK1	Q14678	1352 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PCMTD2-208	ENST00000609764	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		10.13	□□□□□ -0.79
PCMTD2-208	ENST00000609764	ASXL1	Q8IXJ9	1541 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PCMTD2-208	ENST00000609764	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PCMTD2-208	ENST00000609764	WWC1	Q8IX03	1113 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PCMTD2-208	ENST00000609764	LIMD1	Q9UGP4	676 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PCMTD2-208	ENST00000609764	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
PCMTD2-208	ENST00000609764	KIF15	Q9NS87	1388 aa		10.12	□□□□□ -0.79
PCMTD2-208	ENST00000609764	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PCMTD2-208	ENST00000609764	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PCMTD2-208	ENST00000609764	SPTLC1	O15269	473 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PCMTD2-208	ENST00000609764	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
PCMTD2-208	ENST00000609764	RDH13	Q8NBN7	331 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PCMTD2-208	ENST00000609764	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PCMTD2-208	ENST00000609764	LRP5	O75197	1615 aa		10.11	□□□□□ -0.79
PCMTD2-208	ENST00000609764	ATRN	O75882	1429 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PCMTD2-208	ENST00000609764	MST1R	Q04912	1400 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PCMTD2-208	ENST00000609764	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PCMTD2-208	ENST00000609764	RIMS2	Q9UQ26	1411 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PCMTD2-208	ENST00000609764	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
PCMTD2-208	ENST00000609764	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
PCMTD2-208	ENST00000609764	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PCMTD2-208	ENST00000609764	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	10.1	□□□□□ -0.79
PCMTD2-208	ENST00000609764	USP21	Q9UK80	565 aa		10.1	□□□□□ -0.79
PCMTD2-208	ENST00000609764	PPP1R15A	O75807	674 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
PCMTD2-208	ENST00000609764	GJA5	P36382	358 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PCMTD2-208	ENST00000609764	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PCMTD2-208	ENST00000609764	POM121	Q96HA1	1249 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PCMTD2-208	ENST00000609764	KCNK17	Q96T54	332 aa		10.09	□□□□□ -0.79
PCMTD2-208	ENST00000609764	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
PCMTD2-208	ENST00000609764	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PCMTD2-208	ENST00000609764	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PCMTD2-208	ENST00000609764	SLC4A3	P48751	1232 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PCMTD2-208	ENST00000609764	SNRK	Q9NRH2	765 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PCMTD2-208	ENST00000609764	RRP7BP	Q9NSQ0	103 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PCMTD2-208	ENST00000609764	AMOTL2	Q9Y2J4	779 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PCMTD2-208	ENST00000609764	COG6	Q9Y2V7	657 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PCMTD2-208	ENST00000609764	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
PCMTD2-208	ENST00000609764	PTCH1	Q13635	1447 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PCMTD2-208	ENST00000609764	PTPRU	Q92729	1446 aa		10.07	□□□□□ -0.8
PCMTD2-208	ENST00000609764	KDM4A	O75164	1064 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PCMTD2-208	ENST00000609764	ADAMTS2	O95450	1211 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PCMTD2-208	ENST00000609764	USP46	P62068	366 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PCMTD2-208	ENST00000609764	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PCMTD2-208	ENST00000609764	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		10.06	□□□□□ -0.8
PCMTD2-208	ENST00000609764	SMAP	O00193	183 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PCMTD2-208	ENST00000609764	DDX17	Q92841	729 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
PCMTD2-208	ENST00000609764	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
PCMTD2-208	ENST00000609764	ABCC5	O15440	1437 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PCMTD2-208	ENST00000609764	LAMC1	P11047	1609 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PCMTD2-208	ENST00000609764	TRPM2	O94759	1503 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PCMTD2-208	ENST00000609764	NDUFV2	P19404	249 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PCMTD2-208	ENST00000609764	PROX2	Q3B8N5	592 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PCMTD2-208	ENST00000609764	SOS2	Q07890	1332 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PCMTD2-208	ENST00000609764	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PCMTD2-208	ENST00000609764	C3orf80	F5H4A9	247 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PCMTD2-208	ENST00000609764	LILRB3	O75022	631 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PCMTD2-208	ENST00000609764	AP1G2	O75843	785 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PCMTD2-208	ENST00000609764	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
PCMTD2-208	ENST00000609764	GJD4	Q96KN9	370 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
PCMTD2-208	ENST00000609764	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PCMTD2-208	ENST00000609764	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
PCMTD2-208	ENST00000609764	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PCMTD2-208	ENST00000609764	HRC	P23327	699 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PCMTD2-208	ENST00000609764	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PCMTD2-208	ENST00000609764	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PCMTD2-208	ENST00000609764	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PCMTD2-208	ENST00000609764	GCC2	Q8IWJ2	1684 aa		10.01	□□□□□ -0.81
PCMTD2-208	ENST00000609764	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
PCMTD2-208	ENST00000609764	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		10	□□□□□ -0.81
PCMTD2-208	ENST00000609764	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		10	□□□□□ -0.81
PCMTD2-208	ENST00000609764	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		10	□□□□□ -0.81
PCMTD2-208	ENST00000609764	GCGR	P47871	477 aa		10	□□□□□ -0.81
PCMTD2-208	ENST00000609764	QPCT	Q16769	361 aa		10	□□□□□ -0.81
PCMTD2-208	ENST00000609764	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
PCMTD2-208	ENST00000609764	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		10	□□□□□ -0.81
PCMTD2-208	ENST00000609764	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		10	□□□□□ -0.81
PCMTD2-208	ENST00000609764	UNC13B	O14795	1591 aa		10	□□□□□ -0.81
PCMTD2-208	ENST00000609764	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
PCMTD2-208	ENST00000609764	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		10	□□□□□ -0.81
PCMTD2-208	ENST00000609764	DAPK1	P53355	1430 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PCMTD2-208	ENST00000609764	MYOM2	P54296	1465 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PCMTD2-208	ENST00000609764	FDX1	P10109	184 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PCMTD2-208	ENST00000609764	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PCMTD2-208	ENST00000609764	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PCMTD2-208	ENST00000609764	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		9.99	□□□□□ -0.81
PCMTD2-208	ENST00000609764	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
PCMTD2-208	ENST00000609764	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PCMTD2-208	ENST00000609764	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
PCMTD2-208	ENST00000609764	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		9.98	□□□□□ -0.81
PCMTD2-208	ENST00000609764	HOXA2	O43364	376 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PCMTD2-208	ENST00000609764	ABL2	P42684	1182 aa		9.97	□□□□□ -0.81
PCMTD2-208	ENST00000609764	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
PCMTD2-208	ENST00000609764	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		9.96	□□□□□ -0.81
PCMTD2-208	ENST00000609764	ARHGAP33	O14559	1287 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PCMTD2-208	ENST00000609764	USP17L8	P0C7I0	530 aa		9.96	□□□□□ -0.82
PCMTD2-208	ENST00000609764	YY1	P25490	414 aa		9.96	□□□□□ -0.82

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