RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586027.5

GIPC1-205, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-205ENST00000586027 KRT27Q7Z3Y8 459 aa42.06■■■■■ 4.32
GIPC1-205ENST00000586027 EXOC5O00471 708 aa42.04■■■■■ 4.32
GIPC1-205ENST00000586027 FAM182BQ5T319 152 aa42.02■■■■■ 4.32
GIPC1-205ENST00000586027 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP42.01■■■■■ 4.32
GIPC1-205ENST00000586027 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP42.01■■■■■ 4.32
GIPC1-205ENST00000586027 PDE3BQ13370 1112 aa42.01■■■■■ 4.32
GIPC1-205ENST00000586027 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP42■■■■■ 4.31
GIPC1-205ENST00000586027 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP42■■■■■ 4.31
GIPC1-205ENST00000586027 SHANK3Q9BYB0 1731 aa41.99■■■■■ 4.31
GIPC1-205ENST00000586027 RSPH6AQ9H0K4 717 aa41.96■■■■■ 4.31
GIPC1-205ENST00000586027 PKD1L3Q7Z443 1732 aa41.96■■■■■ 4.31
GIPC1-205ENST00000586027 EP400Q96L91 3159 aa41.95■■■■■ 4.31
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GIPC1-205ENST00000586027 PRKAR2BP31323 418 aa41.89■■■■■ 4.3
GIPC1-205ENST00000586027 CYP27B1O15528 508 aa41.88■■■■■ 4.3
GIPC1-205ENST00000586027 MRS2Q9HD23 443 aa41.88■■■■■ 4.3
GIPC1-205ENST00000586027 SPG7Q9UQ90 795 aa41.88■■■■■ 4.3
GIPC1-205ENST00000586027 FCHSD2O94868 740 aa41.88■■■■■ 4.29
GIPC1-205ENST00000586027 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa41.87■■■■■ 4.29
GIPC1-205ENST00000586027 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa41.87■■■■■ 4.29
GIPC1-205ENST00000586027 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP41.86■■■■■ 4.29
GIPC1-205ENST00000586027 PHACTR3Q96KR7 559 aa41.84■■■■■ 4.29
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GIPC1-205ENST00000586027 AMOTQ4VCS5 1084 aa41.83■■■■■ 4.29
GIPC1-205ENST00000586027 ADAMTS8Q9UP79 889 aa41.82■■■■■ 4.29
GIPC1-205ENST00000586027 FAM196AQ6ZSG2 479 aa41.81■■■■■ 4.28
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GIPC1-205ENST00000586027 PLEKHF1Q96S99 279 aa41.79■■■■■ 4.28
GIPC1-205ENST00000586027 BCL9O00512 1426 aa41.79■■■■■ 4.28
GIPC1-205ENST00000586027 PHKG2P15735 406 aa41.78■■■■■ 4.28
GIPC1-205ENST00000586027 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
GIPC1-205ENST00000586027 IFNL2Q8IZJ0 200 aa41.76■■■■■ 4.27
GIPC1-205ENST00000586027 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP41.72■■■■■ 4.27
GIPC1-205ENST00000586027 ACSBG1Q96GR2 724 aa41.71■■■■■ 4.27
GIPC1-205ENST00000586027 CCDC146Q8IYE0 955 aa41.7■■■■■ 4.27
GIPC1-205ENST00000586027 CCER2I3L3R5 266 aa41.69■■■■■ 4.26
GIPC1-205ENST00000586027 PTF1AQ7RTS3 328 aa41.69■■■■■ 4.26
GIPC1-205ENST00000586027 SBF2Q86WG5 1849 aa41.69■■■■■ 4.26
GIPC1-205ENST00000586027 TRIM37O94972 964 aa41.68■■■■■ 4.26
GIPC1-205ENST00000586027 C1orf141Q5JVX7 400 aa41.68■■■■■ 4.26
GIPC1-205ENST00000586027 AKAP4Q5JQC9 854 aa41.67■■■■■ 4.26
GIPC1-205ENST00000586027 GAS2L2Q8NHY3 880 aa41.67■■■■■ 4.26
GIPC1-205ENST00000586027 KCNQ2O43526 872 aa41.66■■■■■ 4.26
GIPC1-205ENST00000586027 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP41.66■■■■■ 4.264e-10■■■■■ 44
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GIPC1-205ENST00000586027 DOT1LQ8TEK3 1739 aa41.66■■■■■ 4.26
GIPC1-205ENST00000586027 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa41.66■■■■■ 4.26
GIPC1-205ENST00000586027 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa41.63■■■■■ 4.25
GIPC1-205ENST00000586027 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa41.62■■■■■ 4.25
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GIPC1-205ENST00000586027 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP41.61■■■■■ 4.25
GIPC1-205ENST00000586027 RUNDC1Q96C34 613 aa41.61■■■■■ 4.25
GIPC1-205ENST00000586027 MAP3K5Q99683 1374 aa41.6■■■■■ 4.25
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GIPC1-205ENST00000586027 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP41.58■■■■■ 4.25
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GIPC1-205ENST00000586027 LGR6Q9HBX8 967 aa41.57■■■■■ 4.25
GIPC1-205ENST00000586027 KAT6BQ8WYB5 2073 aa41.56■■■■■ 4.24
GIPC1-205ENST00000586027 NFE2L2Q16236 605 aa41.56■■■■■ 4.24
GIPC1-205ENST00000586027 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP41.56■■■■■ 4.24
GIPC1-205ENST00000586027 GNAT3A8MTJ3 354 aa41.55■■■■■ 4.24
GIPC1-205ENST00000586027 SOCS7O14512 581 aa41.53■■■■■ 4.24
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GIPC1-205ENST00000586027 SCN11AQ9UI33 1791 aa41.51■■■■■ 4.24
GIPC1-205ENST00000586027 TMPOP42166 694 aaKnown RBP41.5■■■■■ 4.23
GIPC1-205ENST00000586027 IL17REQ8NFR9 667 aa41.5■■■■■ 4.23
GIPC1-205ENST00000586027 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP41.5■■■■■ 4.23
GIPC1-205ENST00000586027 ITGB4P16144 1822 aa41.5■■■■■ 4.23
GIPC1-205ENST00000586027 CCDC125Q86Z20 511 aa41.5■■■■■ 4.23
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GIPC1-205ENST00000586027 DLG5Q8TDM6 1919 aa41.48■■■■■ 4.23
GIPC1-205ENST00000586027 APAF1O14727 1248 aa41.47■■■■■ 4.23
GIPC1-205ENST00000586027 APBA3O96018 575 aa41.47■■■■■ 4.23
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GIPC1-205ENST00000586027 BTAF1O14981 1849 aa41.47■■■■■ 4.23
GIPC1-205ENST00000586027 DCTN1Q14203 1278 aa41.46■■■■■ 4.23
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GIPC1-205ENST00000586027 TMOD3Q9NYL9 352 aa41.44■■■■■ 4.22
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GIPC1-205ENST00000586027 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa41.43■■■■■ 4.22
GIPC1-205ENST00000586027 CABP4P57796 275 aa41.43■■■■■ 4.22
GIPC1-205ENST00000586027 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
GIPC1-205ENST00000586027 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa41.41■■■■■ 4.22
GIPC1-205ENST00000586027 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
GIPC1-205ENST00000586027 SLC52A2Q9HAB3 445 aa41.41■■■■■ 4.22
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