RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567316.1

CTU2-209, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 3

Gene CTU2, Length 452 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-209ENST00000567316 CARD10Q9BWT7 1032 aa20.47■□□□□ 0.87
CTU2-209ENST00000567316 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CTU2-209ENST00000567316 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa20.45■□□□□ 0.86
CTU2-209ENST00000567316 SEPT12Q8IYM1 358 aa20.45■□□□□ 0.86
CTU2-209ENST00000567316 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP20.44■□□□□ 0.86
CTU2-209ENST00000567316 BARGINQ6ZT62 677 aa20.43■□□□□ 0.86
CTU2-209ENST00000567316 PHACTR3Q96KR7 559 aa20.43■□□□□ 0.86
CTU2-209ENST00000567316 MEGF6O75095 1541 aa20.43■□□□□ 0.86
CTU2-209ENST00000567316 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CTU2-209ENST00000567316 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa20.42■□□□□ 0.86
CTU2-209ENST00000567316 KAT6BQ8WYB5 2073 aa20.42■□□□□ 0.86
CTU2-209ENST00000567316 APAF1O14727 1248 aa20.41■□□□□ 0.86
CTU2-209ENST00000567316 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CTU2-209ENST00000567316 TCP11L2Q8N4U5 519 aa20.41■□□□□ 0.86
CTU2-209ENST00000567316 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CTU2-209ENST00000567316 SCN11AQ9UI33 1791 aa20.41■□□□□ 0.86
CTU2-209ENST00000567316 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa20.4■□□□□ 0.86
CTU2-209ENST00000567316 NEFMP07197 916 aa20.4■□□□□ 0.86
CTU2-209ENST00000567316 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.39■□□□□ 0.85
CTU2-209ENST00000567316 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa20.39■□□□□ 0.85
CTU2-209ENST00000567316 USP35Q9P2H5 1018 aa20.39■□□□□ 0.85
CTU2-209ENST00000567316 DISP2A7MBM2 1401 aa20.38■□□□□ 0.85
CTU2-209ENST00000567316 TATP17735 454 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CTU2-209ENST00000567316 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU2-209ENST00000567316 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa20.37■□□□□ 0.85
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CTU2-209ENST00000567316 KRT27Q7Z3Y8 459 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU2-209ENST00000567316 LRRC37A3O60309 1634 aa20.37■□□□□ 0.85
CTU2-209ENST00000567316 IL2RBP14784 551 aa20.36■□□□□ 0.85
CTU2-209ENST00000567316 NFE2L2Q16236 605 aa20.36■□□□□ 0.85
CTU2-209ENST00000567316 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CTU2-209ENST00000567316 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CTU2-209ENST00000567316 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CTU2-209ENST00000567316 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa20.35■□□□□ 0.85
CTU2-209ENST00000567316 NEUROD2Q15784 382 aa20.34■□□□□ 0.85
CTU2-209ENST00000567316 CCDC125Q86Z20 511 aa20.34■□□□□ 0.85
CTU2-209ENST00000567316 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CTU2-209ENST00000567316 ITGB4P16144 1822 aa20.34■□□□□ 0.85
CTU2-209ENST00000567316 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CTU2-209ENST00000567316 RIPK4P57078 832 aa20.33■□□□□ 0.85
CTU2-209ENST00000567316 AMOTQ4VCS5 1084 aa20.33■□□□□ 0.85
CTU2-209ENST00000567316 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CTU2-209ENST00000567316 GAS2L2Q8NHY3 880 aa20.33■□□□□ 0.85
CTU2-209ENST00000567316 NGEFQ8N5V2 710 aa20.32■□□□□ 0.84
CTU2-209ENST00000567316 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
CTU2-209ENST00000567316 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
CTU2-209ENST00000567316 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.3■□□□□ 0.84
CTU2-209ENST00000567316 EP400Q96L91 3159 aa20.3■□□□□ 0.84
CTU2-209ENST00000567316 A0A0G2JS52 829 aa20.3■□□□□ 0.84
CTU2-209ENST00000567316 MYT1Q01538 1121 aa20.3■□□□□ 0.84
CTU2-209ENST00000567316 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CTU2-209ENST00000567316 TRIM35Q9UPQ4 493 aa20.3■□□□□ 0.84
CTU2-209ENST00000567316 SPG7Q9UQ90 795 aa20.3■□□□□ 0.84
CTU2-209ENST00000567316 CCDC27Q2M243 656 aa20.29■□□□□ 0.84
CTU2-209ENST00000567316 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CTU2-209ENST00000567316 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa20.29■□□□□ 0.84
CTU2-209ENST00000567316 MAP3K5Q99683 1374 aa20.28■□□□□ 0.84
CTU2-209ENST00000567316 ZNF521Q96K83 1311 aa20.27■□□□□ 0.84
CTU2-209ENST00000567316 TNS2Q63HR2 1409 aa20.27■□□□□ 0.84
CTU2-209ENST00000567316 SBF2Q86WG5 1849 aa20.27■□□□□ 0.84
CTU2-209ENST00000567316 AKAP4Q5JQC9 854 aa20.27■□□□□ 0.84
CTU2-209ENST00000567316 DOT1LQ8TEK3 1739 aa20.27■□□□□ 0.83
CTU2-209ENST00000567316 GNAT3A8MTJ3 354 aa20.26■□□□□ 0.83
CTU2-209ENST00000567316 WWC1Q8IX03 1113 aa20.26■□□□□ 0.83
CTU2-209ENST00000567316 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa20.26■□□□□ 0.83
CTU2-209ENST00000567316 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa20.26■□□□□ 0.83
CTU2-209ENST00000567316 CYP27B1O15528 508 aa20.25■□□□□ 0.83
CTU2-209ENST00000567316 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
CTU2-209ENST00000567316 LMOD3Q0VAK6 560 aa20.25■□□□□ 0.83
CTU2-209ENST00000567316 PDE3BQ13370 1112 aa20.25■□□□□ 0.83
CTU2-209ENST00000567316 C1orf141Q5JVX7 400 aa20.25■□□□□ 0.83
CTU2-209ENST00000567316 IFNL2Q8IZJ0 200 aa20.25■□□□□ 0.83
CTU2-209ENST00000567316 EXOC5O00471 708 aa20.24■□□□□ 0.83
CTU2-209ENST00000567316 PHKG2P15735 406 aa20.24■□□□□ 0.83
CTU2-209ENST00000567316 FAM196AQ6ZSG2 479 aa20.24■□□□□ 0.83
CTU2-209ENST00000567316 KDM3BQ7LBC6 1761 aa20.23■□□□□ 0.83
CTU2-209ENST00000567316 DCTN1Q14203 1278 aa20.23■□□□□ 0.83
CTU2-209ENST00000567316 DDB1Q16531 1140 aa20.23■□□□□ 0.83
CTU2-209ENST00000567316 MCM10Q7L590 875 aa20.22■□□□□ 0.83
CTU2-209ENST00000567316 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CTU2-209ENST00000567316 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
CTU2-209ENST00000567316 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CTU2-209ENST00000567316 WDR63Q8IWG1 891 aa20.21■□□□□ 0.83
CTU2-209ENST00000567316 IL17REQ8NFR9 667 aa20.21■□□□□ 0.83
CTU2-209ENST00000567316 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
CTU2-209ENST00000567316 BCL9O00512 1426 aa20.2■□□□□ 0.82
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CTU2-209ENST00000567316 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
CTU2-209ENST00000567316 FAM182BQ5T319 152 aa20.2■□□□□ 0.82
CTU2-209ENST00000567316 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa20.2■□□□□ 0.82
CTU2-209ENST00000567316 LGR6Q9HBX8 967 aa20.2■□□□□ 0.82
CTU2-209ENST00000567316 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa20.2■□□□□ 0.82
CTU2-209ENST00000567316 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CTU2-209ENST00000567316 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CTU2-209ENST00000567316 GOLGA2Q08379 1002 aa20.18■□□□□ 0.82
CTU2-209ENST00000567316 MRC1P22897 1456 aa20.18■□□□□ 0.82
CTU2-209ENST00000567316 CDCA7LQ96GN5 454 aa20.17■□□□□ 0.82
CTU2-209ENST00000567316 IL16Q14005 1332 aa20.17■□□□□ 0.82
CTU2-209ENST00000567316 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CTU2-209ENST00000567316 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
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