RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560937.1

MFGE8-214, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 2

Gene MFGE8, Length 801 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-214ENST00000560937 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
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MFGE8-214ENST00000560937 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.11■■□□□ 1.45
MFGE8-214ENST00000560937 PRKAR2BP31323 418 aa24.1■■□□□ 1.45
MFGE8-214ENST00000560937 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.1■■□□□ 1.45
MFGE8-214ENST00000560937 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
MFGE8-214ENST00000560937 RGS12O14924 1447 aa24.1■■□□□ 1.45
MFGE8-214ENST00000560937 TNS2Q63HR2 1409 aa24.1■■□□□ 1.45
MFGE8-214ENST00000560937 FCHSD2O94868 740 aa24.09■■□□□ 1.45
MFGE8-214ENST00000560937 SEPT12Q8IYM1 358 aa24.09■■□□□ 1.45
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MFGE8-214ENST00000560937 DDB1Q16531 1140 aa24.08■■□□□ 1.45
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MFGE8-214ENST00000560937 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.08■■□□□ 1.44
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MFGE8-214ENST00000560937 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.06■■□□□ 1.44
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MFGE8-214ENST00000560937 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.06■■□□□ 1.44
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MFGE8-214ENST00000560937 KAT6BQ8WYB5 2073 aa24.04■■□□□ 1.44
MFGE8-214ENST00000560937 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa24.03■■□□□ 1.44
MFGE8-214ENST00000560937 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa24.03■■□□□ 1.44
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MFGE8-214ENST00000560937 AMOTQ4VCS5 1084 aa24.02■■□□□ 1.44
MFGE8-214ENST00000560937 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
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MFGE8-214ENST00000560937 PHACTR3Q96KR7 559 aa24■■□□□ 1.43
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MFGE8-214ENST00000560937 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP24■■□□□ 1.43
MFGE8-214ENST00000560937 C1orf141Q5JVX7 400 aa23.99■■□□□ 1.43
MFGE8-214ENST00000560937 KRT27Q7Z3Y8 459 aa23.99■■□□□ 1.43
MFGE8-214ENST00000560937 GAS2L2Q8NHY3 880 aa23.99■■□□□ 1.43
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MFGE8-214ENST00000560937 CYP27B1O15528 508 aa23.95■■□□□ 1.42
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MFGE8-214ENST00000560937 FAM182BQ5T319 152 aa23.94■■□□□ 1.42
MFGE8-214ENST00000560937 ITGB4P16144 1822 aa23.94■■□□□ 1.42
MFGE8-214ENST00000560937 MAP3K5Q99683 1374 aa23.93■■□□□ 1.42
MFGE8-214ENST00000560937 NFE2L2Q16236 605 aa23.93■■□□□ 1.42
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MFGE8-214ENST00000560937 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa23.92■■□□□ 1.42
MFGE8-214ENST00000560937 NEUROD2Q15784 382 aa23.92■■□□□ 1.42
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MFGE8-214ENST00000560937 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.87■■□□□ 1.41
MFGE8-214ENST00000560937 FAM196AQ6ZSG2 479 aa23.86■■□□□ 1.41
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MFGE8-214ENST00000560937 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP23.85■■□□□ 1.41
MFGE8-214ENST00000560937 ACSBG1Q96GR2 724 aa23.85■■□□□ 1.41
MFGE8-214ENST00000560937 DCAF5Q96JK2 942 aa23.85■■□□□ 1.41
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MFGE8-214ENST00000560937 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
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MFGE8-214ENST00000560937 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
MFGE8-214ENST00000560937 BCL9O00512 1426 aa23.83■■□□□ 1.4
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MFGE8-214ENST00000560937 LGR6Q9HBX8 967 aa23.82■■□□□ 1.4
MFGE8-214ENST00000560937 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
MFGE8-214ENST00000560937 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
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MFGE8-214ENST00000560937 IL17REQ8NFR9 667 aa23.79■■□□□ 1.4
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MFGE8-214ENST00000560937 TEFQ10587 303 aa23.78■■□□□ 1.4
MFGE8-214ENST00000560937 ILDR2Q71H61 639 aa23.78■■□□□ 1.4
MFGE8-214ENST00000560937 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
MFGE8-214ENST00000560937 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.78■■□□□ 1.4
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MFGE8-214ENST00000560937 TRIM37O94972 964 aa23.77■■□□□ 1.4
MFGE8-214ENST00000560937 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa23.77■■□□□ 1.4
MFGE8-214ENST00000560937 KCNQ2O43526 872 aa23.76■■□□□ 1.39
MFGE8-214ENST00000560937 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.76■■□□□ 1.39
MFGE8-214ENST00000560937 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.75■■□□□ 1.39
MFGE8-214ENST00000560937 NGEFQ8N5V2 710 aa23.74■■□□□ 1.39
MFGE8-214ENST00000560937 PAPPAQ13219 1627 aa23.73■■□□□ 1.39
MFGE8-214ENST00000560937 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa23.73■■□□□ 1.39
MFGE8-214ENST00000560937 KDM3BQ7LBC6 1761 aa23.73■■□□□ 1.39
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