RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547449.1

CS-209, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-209ENST00000547449 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
CS-209ENST00000547449 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
CS-209ENST00000547449 SMC4Q9NTJ3 1288 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-209ENST00000547449 KIAA0232Q92628 1395 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-209ENST00000547449 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
CS-209ENST00000547449 USHBP1Q8N6Y0 703 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-209ENST00000547449 C8orf58Q8NAV2 365 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-209ENST00000547449 CABLES1Q8TDN4 633 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-209ENST00000547449 ARHGAP45Q92619 1136 aa12.54□□□□□ -0.4
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CS-209ENST00000547449 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
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CS-209ENST00000547449 IL17REQ8NFR9 667 aa12.53□□□□□ -0.4
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CS-209ENST00000547449 BCL2L13Q9BXK5 485 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-209ENST00000547449 ERBB3P21860 1342 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-209ENST00000547449 MAP3K5Q99683 1374 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-209ENST00000547449 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP12.52□□□□□ -0.41
CS-209ENST00000547449 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa12.52□□□□□ -0.41
CS-209ENST00000547449 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
CS-209ENST00000547449 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP12.52□□□□□ -0.41
CS-209ENST00000547449 KIF16BQ96L93 1317 aa12.52□□□□□ -0.41
CS-209ENST00000547449 ABCC6O95255 1503 aa12.52□□□□□ -0.41
CS-209ENST00000547449 AKAP4Q5JQC9 854 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-209ENST00000547449 COG6Q9Y2V7 657 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-209ENST00000547449 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-209ENST00000547449 LTN1O94822 1766 aa12.51□□□□□ -0.41
CS-209ENST00000547449 RLBP1P12271 317 aa12.5□□□□□ -0.41
CS-209ENST00000547449 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP12.5□□□□□ -0.412e-10■■■□□ 15.7
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CS-209ENST00000547449 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-209ENST00000547449 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
CS-209ENST00000547449 TRIM27P14373 513 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-209ENST00000547449 MVPQ14764 893 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
CS-209ENST00000547449 CLUAP1Q96AJ1 413 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-209ENST00000547449 NLRP2Q9NX02 1062 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-209ENST00000547449 TSPYL4Q9UJ04 414 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-209ENST00000547449 TNNQ9UQP3 1299 aa12.49□□□□□ -0.41
CS-209ENST00000547449 KDM2BQ8NHM5 1336 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-209ENST00000547449 CHRNA2Q15822 529 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-209ENST00000547449 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
CS-209ENST00000547449 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP12.48□□□□□ -0.41
CS-209ENST00000547449 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
CS-209ENST00000547449 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-209ENST00000547449 LTBP4Q8N2S1 1624 aa12.48□□□□□ -0.41
CS-209ENST00000547449 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-209ENST00000547449 TATP17735 454 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
CS-209ENST00000547449 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-209ENST00000547449 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
CS-209ENST00000547449 PRDM11Q9NQV5 511 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-209ENST00000547449 MIS18AQ9NYP9 233 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-209ENST00000547449 DDX19BQ9UMR2 479 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-209ENST00000547449 DLG5Q8TDM6 1919 aa12.47□□□□□ -0.41
CS-209ENST00000547449 RNMTO43148 476 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
CS-209ENST00000547449 C1orf141Q5JVX7 400 aa12.46□□□□□ -0.41
CS-209ENST00000547449 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
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CS-209ENST00000547449 COL18A1P39060 1754 aa12.46□□□□□ -0.42
CS-209ENST00000547449 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-209ENST00000547449 KRT24Q2M2I5 525 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-209ENST00000547449 CHMP4AQ9BY43 222 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-209ENST00000547449 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-209ENST00000547449 LMO7Q8WWI1 1683 aa12.45□□□□□ -0.42
CS-209ENST00000547449 WDR17Q8IZU2 1322 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-209ENST00000547449 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-209ENST00000547449 TMEM57Q8N5G2 664 aa12.44□□□□□ -0.42
CS-209ENST00000547449 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-209ENST00000547449 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
CS-209ENST00000547449 TEFQ10587 303 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-209ENST00000547449 NHSL1Q5SYE7 1610 aa12.43□□□□□ -0.42
CS-209ENST00000547449 ABCC4O15439 1325 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-209ENST00000547449 PTPRCP08575 1304 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-209ENST00000547449 IGHDP01880 384 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-209ENST00000547449 HOXB7P09629 217 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-209ENST00000547449 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
CS-209ENST00000547449 CCDC30Q5VVM6 783 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-209ENST00000547449 ITPRIPQ8IWB1 547 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-209ENST00000547449 IFNL2Q8IZJ0 200 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-209ENST00000547449 CARD10Q9BWT7 1032 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-209ENST00000547449 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
CS-209ENST00000547449 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-209ENST00000547449 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa12.42□□□□□ -0.42
CS-209ENST00000547449 LRRC37A3O60309 1634 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-209ENST00000547449 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
CS-209ENST00000547449 SLC4A2P04920 1241 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-209ENST00000547449 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
CS-209ENST00000547449 PHKG2P15735 406 aa12.41□□□□□ -0.42
CS-209ENST00000547449 BTBD11A6QL63 1104 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-209ENST00000547449 TOM1O60784 492 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-209ENST00000547449 EVA1CP58658 441 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-209ENST00000547449 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
CS-209ENST00000547449 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa12.4□□□□□ -0.42
CS-209ENST00000547449 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP12.4□□□□□ -0.42
CS-209ENST00000547449 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
CS-209ENST00000547449 DCAF5Q96JK2 942 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-209ENST00000547449 STK31Q9BXU1 1019 aa12.39□□□□□ -0.43
CS-209ENST00000547449 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP12.39□□□□□ -0.43
CS-209ENST00000547449 MEGF6O75095 1541 aa12.38□□□□□ -0.43
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