RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535551.1

PGA3-202, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

TSL 3

Gene PGA3, Length 1,449 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-202ENST00000535551 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
PGA3-202ENST00000535551 WDR17Q8IZU2 1322 aa13.77□□□□□ -0.21
PGA3-202ENST00000535551 RGPD2P0DJD1 1756 aa13.77□□□□□ -0.21
PGA3-202ENST00000535551 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
PGA3-202ENST00000535551 ZBTB7CA1YPR0 619 aa13.75□□□□□ -0.21
PGA3-202ENST00000535551 EXOC6Q8TAG9 804 aa13.75□□□□□ -0.21
PGA3-202ENST00000535551 STRN4Q9NRL3 753 aa13.75□□□□□ -0.21
PGA3-202ENST00000535551 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP13.75□□□□□ -0.21
PGA3-202ENST00000535551 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
PGA3-202ENST00000535551 SEPT12Q8IYM1 358 aa13.74□□□□□ -0.21
PGA3-202ENST00000535551 TCP11L2Q8N4U5 519 aa13.74□□□□□ -0.21
PGA3-202ENST00000535551 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
PGA3-202ENST00000535551 ERBB3P21860 1342 aa13.74□□□□□ -0.21
PGA3-202ENST00000535551 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
PGA3-202ENST00000535551 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
PGA3-202ENST00000535551 AXIN2Q9Y2T1 843 aa13.73□□□□□ -0.21
PGA3-202ENST00000535551 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP13.73□□□□□ -0.21
PGA3-202ENST00000535551 IP6K1Q92551 441 aa13.73□□□□□ -0.21
PGA3-202ENST00000535551 CARD10Q9BWT7 1032 aa13.73□□□□□ -0.21
PGA3-202ENST00000535551 KNSTRNQ9Y448 316 aa13.73□□□□□ -0.21
PGA3-202ENST00000535551 EP400Q96L91 3159 aa13.72□□□□□ -0.21
PGA3-202ENST00000535551 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP13.72□□□□□ -0.21
PGA3-202ENST00000535551 MAP3K19Q56UN5 1328 aa13.72□□□□□ -0.21
PGA3-202ENST00000535551 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.22
PGA3-202ENST00000535551 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa13.71□□□□□ -0.22
PGA3-202ENST00000535551 KRT27Q7Z3Y8 459 aa13.71□□□□□ -0.22
PGA3-202ENST00000535551 CCDC125Q86Z20 511 aa13.71□□□□□ -0.22
PGA3-202ENST00000535551 FLT4P35916 1363 aa13.71□□□□□ -0.22
PGA3-202ENST00000535551 LRRC37A3O60309 1634 aa13.7□□□□□ -0.22
PGA3-202ENST00000535551 RRP9O43818 475 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
PGA3-202ENST00000535551 FAM161AQ3B820 660 aa13.7□□□□□ -0.22
PGA3-202ENST00000535551 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
PGA3-202ENST00000535551 KDM2BQ8NHM5 1336 aa13.7□□□□□ -0.22
PGA3-202ENST00000535551 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa13.7□□□□□ -0.22
PGA3-202ENST00000535551 DISP2A7MBM2 1401 aa13.69□□□□□ -0.22
PGA3-202ENST00000535551 HOXC9P31274 260 aa13.69□□□□□ -0.22
PGA3-202ENST00000535551 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP13.69□□□□□ -0.22
PGA3-202ENST00000535551 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa13.69□□□□□ -0.22
PGA3-202ENST00000535551 RGPD1P0DJD0 1748 aa13.68□□□□□ -0.22
PGA3-202ENST00000535551 A0A0G2JS52 829 aa13.68□□□□□ -0.22
PGA3-202ENST00000535551 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa13.68□□□□□ -0.22
PGA3-202ENST00000535551 AMPHP49418 695 aa13.68□□□□□ -0.22
PGA3-202ENST00000535551 ANKRD24Q8TF21 1146 aa13.67□□□□□ -0.22
PGA3-202ENST00000535551 MORC1Q86VD1 984 aa13.66□□□□□ -0.22
PGA3-202ENST00000535551 BCL9O00512 1426 aa13.66□□□□□ -0.22
PGA3-202ENST00000535551 PARD3Q8TEW0 1356 aa13.66□□□□□ -0.22
PGA3-202ENST00000535551 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa13.66□□□□□ -0.22
PGA3-202ENST00000535551 TNS2Q63HR2 1409 aa13.65□□□□□ -0.22
PGA3-202ENST00000535551 POLKQ9UBT6 870 aa13.64□□□□□ -0.23
PGA3-202ENST00000535551 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
PGA3-202ENST00000535551 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa13.64□□□□□ -0.23
PGA3-202ENST00000535551 DDB1Q16531 1140 aa13.64□□□□□ -0.23
PGA3-202ENST00000535551 FAM196AQ6ZSG2 479 aa13.64□□□□□ -0.23
PGA3-202ENST00000535551 NLRP2Q9NX02 1062 aa13.64□□□□□ -0.23
PGA3-202ENST00000535551 NCAPD2Q15021 1401 aa13.63□□□□□ -0.23
PGA3-202ENST00000535551 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
PGA3-202ENST00000535551 SBF2Q86WG5 1849 aa13.63□□□□□ -0.23
PGA3-202ENST00000535551 CLCN1P35523 988 aa13.63□□□□□ -0.23
PGA3-202ENST00000535551 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa13.63□□□□□ -0.23
PGA3-202ENST00000535551 IL2RBP14784 551 aa13.62□□□□□ -0.23
PGA3-202ENST00000535551 C8orf34Q49A92 452 aa13.62□□□□□ -0.23
PGA3-202ENST00000535551 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
PGA3-202ENST00000535551 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa13.61□□□□□ -0.23
PGA3-202ENST00000535551 FAM182BQ5T319 152 aa13.61□□□□□ -0.23
PGA3-202ENST00000535551 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
PGA3-202ENST00000535551 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
PGA3-202ENST00000535551 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
PGA3-202ENST00000535551 PPP2R1AP30153 589 aa13.6□□□□□ -0.23
PGA3-202ENST00000535551 EXOC5O00471 708 aa13.59□□□□□ -0.23
PGA3-202ENST00000535551 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
PGA3-202ENST00000535551 BECN1Q14457 450 aa13.59□□□□□ -0.23
PGA3-202ENST00000535551 SHANK3Q9BYB0 1731 aa13.59□□□□□ -0.23
PGA3-202ENST00000535551 PKD1L3Q7Z443 1732 aa13.58□□□□□ -0.23
PGA3-202ENST00000535551 MTHFSP49914 203 aa13.58□□□□□ -0.24
PGA3-202ENST00000535551 USHBP1Q8N6Y0 703 aa13.57□□□□□ -0.24
PGA3-202ENST00000535551 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
PGA3-202ENST00000535551 CRBNQ96SW2 442 aa13.57□□□□□ -0.24
PGA3-202ENST00000535551 NHSQ6T4R5 1651 aa13.57□□□□□ -0.24
PGA3-202ENST00000535551 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
PGA3-202ENST00000535551 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
PGA3-202ENST00000535551 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
PGA3-202ENST00000535551 NBPF6Q5VWK0 638 aa13.56□□□□□ -0.24
PGA3-202ENST00000535551 NBPF4Q96M43 638 aa13.56□□□□□ -0.24
PGA3-202ENST00000535551 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
PGA3-202ENST00000535551 MEGF6O75095 1541 aa13.56□□□□□ -0.24
PGA3-202ENST00000535551 FSD2A1L4K1 749 aa13.56□□□□□ -0.24
PGA3-202ENST00000535551 BAG6P46379 1132 aa13.56□□□□□ -0.24
PGA3-202ENST00000535551 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa13.56□□□□□ -0.24
PGA3-202ENST00000535551 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
PGA3-202ENST00000535551 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
PGA3-202ENST00000535551 ZMYND15Q9H091 742 aa13.55□□□□□ -0.24
PGA3-202ENST00000535551 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP13.54□□□□□ -0.24
PGA3-202ENST00000535551 KAT6BQ8WYB5 2073 aa13.54□□□□□ -0.24
PGA3-202ENST00000535551 IGSF1Q8N6C5 1336 aa13.53□□□□□ -0.24
PGA3-202ENST00000535551 TATP17735 454 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
PGA3-202ENST00000535551 RREB1Q92766 1687 aa13.53□□□□□ -0.24
PGA3-202ENST00000535551 IL13P35225 146 aa13.52□□□□□ -0.25
PGA3-202ENST00000535551 AEBP1Q8IUX7 1158 aa13.52□□□□□ -0.25
PGA3-202ENST00000535551 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
PGA3-202ENST00000535551 EYA1Q99502 592 aa13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms