RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 PTGIRP43119 386 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-214ENST00000530727 TSGA10IPQ3SY00 556 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-214ENST00000530727 CYP2U1Q7Z449 544 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRC-214ENST00000530727 TTLL8A6PVC2 850 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-214ENST00000530727 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-214ENST00000530727 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-214ENST00000530727 PLPP7Q8NBV4 271 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-214ENST00000530727 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-214ENST00000530727 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-214ENST00000530727 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-214ENST00000530727 SOBPA7XYQ1 873 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-214ENST00000530727 PIK3CDO00329 1044 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-214ENST00000530727 MAP7D1Q3KQU3 841 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-214ENST00000530727 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-214ENST00000530727 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-214ENST00000530727 OSBPL3Q9H4L5 887 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-214ENST00000530727 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRC-214ENST00000530727 USP4Q13107 963 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-214ENST00000530727 SIRT1Q96EB6 747 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-214ENST00000530727 SKIP12755 728 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-214ENST00000530727 GLMNQ92990 594 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-214ENST00000530727 CHIC2Q9UKJ5 165 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRC-214ENST00000530727 FIGNL2A6NMB9 653 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-214ENST00000530727 TRAK2O60296 914 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-214ENST00000530727 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-214ENST00000530727 DNMT3LQ9UJW3 386 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRC-214ENST00000530727 MEN1O00255 615 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-214ENST00000530727 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
PTPRC-214ENST00000530727 A0A1W2PRU2 124 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-214ENST00000530727 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-214ENST00000530727 NLRP3Q96P20 1036 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRC-214ENST00000530727 GNRH1P01148 92 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-214ENST00000530727 EML3Q32P44 896 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-214ENST00000530727 RNF217Q8TC41 542 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-214ENST00000530727 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-214ENST00000530727 RAB6BQ9NRW1 208 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-214ENST00000530727 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-214ENST00000530727 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-214ENST00000530727 UCN2Q96RP3 112 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRC-214ENST00000530727 CLN3Q13286 438 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-214ENST00000530727 NCOA4Q13772 614 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-214ENST00000530727 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRC-214ENST00000530727 USP17L5A8MUK1 530 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-214ENST00000530727 DEPDC4Q8N2C3 294 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-214ENST00000530727 ZMYND15Q9H091 742 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-214ENST00000530727 PODXL2Q9NZ53 605 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-214ENST00000530727 TERTO14746 1132 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-214ENST00000530727 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-214ENST00000530727 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-214ENST00000530727 ESCO1Q5FWF5 840 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-214ENST00000530727 SLC27A3Q5K4L6 730 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-214ENST00000530727 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-214ENST00000530727 NOD1Q9Y239 953 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-214ENST00000530727 ABCC9O60706 1549 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRC-214ENST00000530727 ATP9BO43861 1147 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 GPC1P35052 558 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 CNKSR1Q969H4 720 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 MYO15BQ96JP2 1530 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 VEGFBP49765 207 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 USP17L3A6NCW0 530 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 USP17L4A6NCW7 530 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 IL2RAP01589 272 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 PTSQ03393 145 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 USP17L2Q6R6M4 530 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 USP17L1Q7RTZ2 530 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 SLC16A10Q8TF71 515 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 STAU1O95793 577 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 PSME1Q06323 249 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 ETNK1Q9HBU6 452 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 WFS1O76024 890 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 GTF2IP78347 998 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 NPAS3Q8IXF0 933 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 XAGE2Q96GT9 111 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 GDF10P55107 478 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 TREML4Q6UXN2 200 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 RHOQP17081 205 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 CENPCQ03188 943 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 TRIM50Q86XT4 487 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 GRIP2Q9C0E4 1043 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 H3BM21 787 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 PPFIA3O75145 1194 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 INHAP05111 366 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 SCNN1DP51172 638 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 CCDC155Q8N6L0 562 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 ATP1A2P50993 1020 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRC-214ENST00000530727 TLR1Q15399 786 aa7.16□□□□□ -1.26
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