RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524681.1

CTSW-202, Transcript of cathepsin W, humanhuman

TSL 2

Gene CTSW, Length 521 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSW-202ENST00000524681 CCDC146Q8IYE0 955 aa9.91□□□□□ -0.82
CTSW-202ENST00000524681 FAM9BQ8IZU0 186 aa9.91□□□□□ -0.82
CTSW-202ENST00000524681 RUNDC1Q96C34 613 aa9.91□□□□□ -0.82
CTSW-202ENST00000524681 USP35Q9P2H5 1018 aa9.91□□□□□ -0.82
CTSW-202ENST00000524681 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CTSW-202ENST00000524681 LRRC37A3O60309 1634 aa9.9□□□□□ -0.82
CTSW-202ENST00000524681 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CTSW-202ENST00000524681 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP9.9□□□□□ -0.82
CTSW-202ENST00000524681 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CTSW-202ENST00000524681 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CTSW-202ENST00000524681 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
CTSW-202ENST00000524681 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CTSW-202ENST00000524681 TRIM35Q9UPQ4 493 aa9.9□□□□□ -0.82
CTSW-202ENST00000524681 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa9.9□□□□□ -0.83
CTSW-202ENST00000524681 ZNF521Q96K83 1311 aa9.89□□□□□ -0.83
CTSW-202ENST00000524681 APAF1O14727 1248 aa9.89□□□□□ -0.83
CTSW-202ENST00000524681 TATP17735 454 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CTSW-202ENST00000524681 TMPOP42166 694 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
CTSW-202ENST00000524681 AMOTQ4VCS5 1084 aa9.88□□□□□ -0.83
CTSW-202ENST00000524681 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
CTSW-202ENST00000524681 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
CTSW-202ENST00000524681 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa9.88□□□□□ -0.83
CTSW-202ENST00000524681 PHKG2P15735 406 aa9.87□□□□□ -0.83
CTSW-202ENST00000524681 NFE2L2Q16236 605 aa9.87□□□□□ -0.83
CTSW-202ENST00000524681 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CTSW-202ENST00000524681 SEPT12Q8IYM1 358 aa9.87□□□□□ -0.83
CTSW-202ENST00000524681 IL17REQ8NFR9 667 aa9.87□□□□□ -0.83
CTSW-202ENST00000524681 BCL9O00512 1426 aa9.87□□□□□ -0.83
CTSW-202ENST00000524681 RGS12O14924 1447 aa9.87□□□□□ -0.83
CTSW-202ENST00000524681 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CTSW-202ENST00000524681 TNS2Q63HR2 1409 aa9.87□□□□□ -0.83
CTSW-202ENST00000524681 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa9.87□□□□□ -0.83
CTSW-202ENST00000524681 RXRBP28702 533 aa9.86□□□□□ -0.83
CTSW-202ENST00000524681 CCDC27Q2M243 656 aa9.86□□□□□ -0.83
CTSW-202ENST00000524681 LGR6Q9HBX8 967 aa9.86□□□□□ -0.83
CTSW-202ENST00000524681 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CTSW-202ENST00000524681 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CTSW-202ENST00000524681 BRWD3Q6RI45 1802 aa9.85□□□□□ -0.83
CTSW-202ENST00000524681 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa9.85□□□□□ -0.83
CTSW-202ENST00000524681 EXOC5O00471 708 aa9.85□□□□□ -0.83
CTSW-202ENST00000524681 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CTSW-202ENST00000524681 AKAP4Q5JQC9 854 aa9.85□□□□□ -0.83
CTSW-202ENST00000524681 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CTSW-202ENST00000524681 SPG7Q9UQ90 795 aa9.85□□□□□ -0.83
CTSW-202ENST00000524681 DLG5Q8TDM6 1919 aa9.84□□□□□ -0.83
CTSW-202ENST00000524681 RIPK4P57078 832 aa9.84□□□□□ -0.83
CTSW-202ENST00000524681 DDB1Q16531 1140 aa9.84□□□□□ -0.83
CTSW-202ENST00000524681 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
CTSW-202ENST00000524681 WWC1Q8IX03 1113 aa9.84□□□□□ -0.83
CTSW-202ENST00000524681 GAS2L2Q8NHY3 880 aa9.84□□□□□ -0.83
CTSW-202ENST00000524681 MAP3K5Q99683 1374 aa9.84□□□□□ -0.83
CTSW-202ENST00000524681 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa9.84□□□□□ -0.83
CTSW-202ENST00000524681 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa9.83□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa9.83□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 GNAT3A8MTJ3 354 aa9.83□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 DCTN1Q14203 1278 aa9.83□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa9.83□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 PTF1AQ7RTS3 328 aa9.83□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 IFNL2Q8IZJ0 200 aa9.83□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 MRC1P22897 1456 aa9.83□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 RNMTO43148 476 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 ZNF853P0CG23 659 aa9.82□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 MCM10Q7L590 875 aa9.82□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 DCAF5Q96JK2 942 aa9.82□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa9.82□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 SCN11AQ9UI33 1791 aa9.81□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 FAM182BQ5T319 152 aa9.81□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 NGEFQ8N5V2 710 aa9.81□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 ERVV-2B6SEH9 535 aa9.8□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 CHL1O00533 1208 aa9.8□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 KCNQ2O43526 872 aa9.8□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 NEUROD2Q15784 382 aa9.8□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 KRT27Q7Z3Y8 459 aa9.8□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 EP400Q96L91 3159 aa9.8□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 PDE3BQ13370 1112 aa9.79□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 WDR63Q8IWG1 891 aa9.79□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 PIGBQ92521 554 aa9.79□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 CDCA7LQ96GN5 454 aa9.79□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 SLC52A2Q9HAB3 445 aa9.79□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 IL16Q14005 1332 aa9.79□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 ZBED9Q6R2W3 1325 aa9.79□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 HEG1Q9ULI3 1381 aa9.78□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 SBF2Q86WG5 1849 aa9.78□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP9.78□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 C1orf141Q5JVX7 400 aa9.78□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa9.78□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 ITGB4P16144 1822 aa9.77□□□□□ -0.84
CTSW-202ENST00000524681 KCNQ3O43525 872 aa9.77□□□□□ -0.85
CTSW-202ENST00000524681 SLFN5Q08AF3 891 aa9.77□□□□□ -0.85
CTSW-202ENST00000524681 MIS18AQ9NYP9 233 aa9.77□□□□□ -0.85
CTSW-202ENST00000524681 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CTSW-202ENST00000524681 PAPPAQ13219 1627 aa9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms