RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498648.5

STRADB-210, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-210ENST00000498648 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 LGR5O75473 907 aa7.03□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 FAM13AO94988 1023 aa7.03□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 JUNDP17535 347 aa7.03□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 CTHP32929 405 aa7.03□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 CCDC144BQ3MJ40 725 aa7.03□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.03□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 ARMC2Q8NEN0 867 aa7.03□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 FAM161BQ96MY7 647 aa7.03□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 HINFPQ9BQA5 517 aa7.03□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 CAPN10Q9HC96 672 aa7.03□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 MRS2Q9HD23 443 aa7.03□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 PARP2Q9UGN5 583 aa7.03□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 RABGEF1Q9UJ41 708 aa7.03□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa7.03□□□□□ -1.28
STRADB-210ENST00000498648 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 LDHBP07195 334 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP7.02□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 DSC3Q14574 896 aa7.02□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 NBPF14Q5TI25 921 aa7.02□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 SAMD7Q7Z3H4 446 aa7.02□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 DCBLD2Q96PD2 775 aa7.02□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 GMLQ99445 158 aa7.02□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa7.01□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 M0R2N6 131 aa7.01□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 HAX1O00165 279 aa7.01□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 NDUFB5O43674 189 aa7.01□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 SORBS3O60504 671 aa7.01□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 DAB2P98082 770 aa7.01□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 PSME1Q06323 249 aa7.01□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 BRICD5Q6PL45 260 aa7.01□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 ACBD3Q9H3P7 528 aa7.01□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 TBX22Q9Y458 520 aa7.01□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 ZNF76P36508 570 aa7□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa7□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 SDE2Q6IQ49 451 aa7□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 KCNH8Q96L42 1107 aa7□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 CITED4Q96RK1 184 aa7□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa7□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP7□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 MARCH6O60337 910 aa6.99□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 RNF40O75150 1001 aa6.99□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 CCNYL3P0C7X3 344 aa6.99□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 MPSTP25325 297 aa6.99□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 EHHADHQ08426 723 aa6.99□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 PRKD2Q9BZL6 878 aa6.99□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 PIF1Q9H611 641 aa6.99□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 RNF19AQ9NV58 838 aa6.99□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 VTI1BQ9UEU0 232 aa6.99□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 FOXO3O43524 673 aa6.98□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 IGHA2P01877 340 aa6.98□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 MAPK8P45983 427 aa6.98□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 TNNI2P48788 182 aa6.98□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 PLCB3Q01970 1234 aa6.98□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 RBL2Q08999 1139 aa6.98□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 PSMD2Q13200 908 aa6.98□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 ZBTB33Q86T24 672 aa6.98□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 DMRTB1Q96MA1 342 aa6.98□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 EVA1BQ9NVM1 165 aa6.98□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 GABBR2O75899 941 aa6.97□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 IGFBP4P22692 258 aa6.97□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa6.97□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa6.97□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 THAP11Q96EK4 314 aa6.97□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
STRADB-210ENST00000498648 RAB11FIP3O75154 756 aa6.96□□□□□ -1.3
STRADB-210ENST00000498648 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
STRADB-210ENST00000498648 RNF20Q5VTR2 975 aa6.96□□□□□ -1.3
STRADB-210ENST00000498648 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa6.96□□□□□ -1.3
STRADB-210ENST00000498648 NLGN1Q8N2Q7 840 aa6.96□□□□□ -1.3
STRADB-210ENST00000498648 TMC1Q8TDI8 760 aa6.96□□□□□ -1.3
STRADB-210ENST00000498648 GPATCH3Q96I76 525 aa6.96□□□□□ -1.3
STRADB-210ENST00000498648 SPACA7Q96KW9 195 aa6.96□□□□□ -1.3
STRADB-210ENST00000498648 FAM129BQ96TA1 746 aa6.96□□□□□ -1.3
STRADB-210ENST00000498648 SLC4A5Q9BY07 1137 aa6.96□□□□□ -1.3
STRADB-210ENST00000498648 ATP2B2Q01814 1243 aa6.95□□□□□ -1.3
STRADB-210ENST00000498648 USP4Q13107 963 aa6.95□□□□□ -1.3
STRADB-210ENST00000498648 SOGA3Q5TF21 947 aa6.95□□□□□ -1.3
STRADB-210ENST00000498648 CERS3Q8IU89 383 aa6.95□□□□□ -1.3
STRADB-210ENST00000498648 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
STRADB-210ENST00000498648 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa6.95□□□□□ -1.3
STRADB-210ENST00000498648 WWC3Q9ULE0 1092 aa6.95□□□□□ -1.3
STRADB-210ENST00000498648 GPR182O15218 404 aa6.94□□□□□ -1.3
STRADB-210ENST00000498648 FZD6O60353 706 aa6.94□□□□□ -1.3
STRADB-210ENST00000498648 ARID5AQ03989 594 aa6.94□□□□□ -1.3
STRADB-210ENST00000498648 PDE3BQ13370 1112 aa6.94□□□□□ -1.3
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