RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 OXLD1Q5BKU9 147 aa9.83□□□□□ -0.84
RBM39-241ENST00000496183 PLPP7Q8NBV4 271 aa9.83□□□□□ -0.84
RBM39-241ENST00000496183 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
RBM39-241ENST00000496183 A6NJR5 290 aa9.82□□□□□ -0.84
RBM39-241ENST00000496183 MEN1O00255 615 aa9.82□□□□□ -0.84
RBM39-241ENST00000496183 WFS1O76024 890 aa9.82□□□□□ -0.84
RBM39-241ENST00000496183 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
RBM39-241ENST00000496183 GPC1P35052 558 aa9.82□□□□□ -0.84
RBM39-241ENST00000496183 ESCO1Q5FWF5 840 aa9.82□□□□□ -0.84
RBM39-241ENST00000496183 PHTF2Q8N3S3 785 aa9.82□□□□□ -0.84
RBM39-241ENST00000496183 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa9.82□□□□□ -0.84
RBM39-241ENST00000496183 CLUAP1Q96AJ1 413 aa9.82□□□□□ -0.84
RBM39-241ENST00000496183 DNMT3LQ9UJW3 386 aa9.82□□□□□ -0.84
RBM39-241ENST00000496183 SCTRP47872 440 aa9.81□□□□□ -0.84
RBM39-241ENST00000496183 TREML4Q6UXN2 200 aa9.81□□□□□ -0.84
RBM39-241ENST00000496183 ALG2Q9H553 416 aa9.81□□□□□ -0.84
RBM39-241ENST00000496183 A0A1W2PRU2 124 aa9.8□□□□□ -0.84
RBM39-241ENST00000496183 FIGNL2A6NMB9 653 aa9.8□□□□□ -0.84
RBM39-241ENST00000496183 SOBPA7XYQ1 873 aa9.8□□□□□ -0.84
RBM39-241ENST00000496183 TRAK2O60296 914 aa9.8□□□□□ -0.84
RBM39-241ENST00000496183 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
RBM39-241ENST00000496183 EML3Q32P44 896 aa9.8□□□□□ -0.84
RBM39-241ENST00000496183 SLC27A3Q5K4L6 730 aa9.8□□□□□ -0.84
RBM39-241ENST00000496183 OSBPL3Q9H4L5 887 aa9.8□□□□□ -0.84
RBM39-241ENST00000496183 CHIC2Q9UKJ5 165 aa9.8□□□□□ -0.84
RBM39-241ENST00000496183 SKIP12755 728 aa9.79□□□□□ -0.84
RBM39-241ENST00000496183 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
RBM39-241ENST00000496183 CLN3Q13286 438 aa9.79□□□□□ -0.84
RBM39-241ENST00000496183 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa9.79□□□□□ -0.84
RBM39-241ENST00000496183 RNF217Q8TC41 542 aa9.79□□□□□ -0.84
RBM39-241ENST00000496183 IRF7Q92985 503 aa9.79□□□□□ -0.84
RBM39-241ENST00000496183 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP9.79□□□□□ -0.84
RBM39-241ENST00000496183 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa9.79□□□□□ -0.84
RBM39-241ENST00000496183 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa9.77□□□□□ -0.85
RBM39-241ENST00000496183 POM121CA8CG34 1229 aa9.76□□□□□ -0.85
RBM39-241ENST00000496183 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
RBM39-241ENST00000496183 NOD1Q9Y239 953 aa9.76□□□□□ -0.85
RBM39-241ENST00000496183 H3BM21 787 aa9.75□□□□□ -0.85
RBM39-241ENST00000496183 PTSQ03393 145 aa9.75□□□□□ -0.85
RBM39-241ENST00000496183 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
RBM39-241ENST00000496183 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
RBM39-241ENST00000496183 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
RBM39-241ENST00000496183 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa9.75□□□□□ -0.85
RBM39-241ENST00000496183 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
RBM39-241ENST00000496183 GLMNQ92990 594 aa9.74□□□□□ -0.85
RBM39-241ENST00000496183 CNKSR1Q969H4 720 aa9.74□□□□□ -0.85
RBM39-241ENST00000496183 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
RBM39-241ENST00000496183 TRIM50Q86XT4 487 aa9.73□□□□□ -0.85
RBM39-241ENST00000496183 RAB6BQ9NRW1 208 aa9.73□□□□□ -0.85
RBM39-241ENST00000496183 USP17L5A8MUK1 530 aa9.72□□□□□ -0.85
RBM39-241ENST00000496183 PIK3CDO00329 1044 aa9.72□□□□□ -0.85
RBM39-241ENST00000496183 PPFIA3O75145 1194 aa9.72□□□□□ -0.85
RBM39-241ENST00000496183 TSGA10IPQ3SY00 556 aa9.72□□□□□ -0.85
RBM39-241ENST00000496183 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa9.72□□□□□ -0.85
RBM39-241ENST00000496183 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa9.72□□□□□ -0.85
RBM39-241ENST00000496183 ATP9BO43861 1147 aa9.71□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 VEGFBP49765 207 aa9.71□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 ATP1A2P50993 1020 aa9.71□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 PSME1Q06323 249 aa9.71□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 NCOA4Q13772 614 aa9.71□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 GNASQ5JWF2 1037 aa9.71□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 CCDC155Q8N6L0 562 aa9.71□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 WDR44Q5JSH3 913 aa9.7□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 TAS1R3Q7RTX0 852 aa9.7□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa9.7□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 XAGE2Q96GT9 111 aa9.7□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 SLC35F4A4IF30 521 aa9.69□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 IL2RAP01589 272 aa9.69□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 GDF10P55107 478 aa9.69□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 CENPCQ03188 943 aa9.69□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa9.69□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 GRIP2Q9C0E4 1043 aa9.69□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 USP17L3A6NCW0 530 aa9.68□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 USP17L4A6NCW7 530 aa9.68□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa9.68□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 WASLO00401 505 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 BACH1O14867 736 aa9.68□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 GTF2IP78347 998 aa9.68□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 TLR1Q15399 786 aa9.68□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 USP17L2Q6R6M4 530 aa9.68□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 USP17L1Q7RTZ2 530 aa9.68□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 INHAP05111 366 aa9.67□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 VSIG8P0DPA2 414 aa9.67□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 ITGA6P23229 1130 aa9.67□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 NBPF15Q8N660 670 aa9.67□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 GMCL1Q96IK5 515 aa9.67□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 ETNK1Q9HBU6 452 aa9.67□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 DYRK1BQ9Y463 629 aa9.67□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 RHOQP17081 205 aa9.66□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa9.66□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 DEPDC4Q8N2C3 294 aa9.66□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 CDC14CA4D256 554 aa9.65□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 H7C1W4 665 aa9.65□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 WIPF1O43516 503 aa9.65□□□□□ -0.86
RBM39-241ENST00000496183 POU4F2Q12837 409 aa9.65□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.9 ms