RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478988.2

PDZRN3-AS1-201, PDZRN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PDZRN3-AS1, Length 961 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 A0A1W2PP64 1363 aa7.56□□□□□ -1.2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PKD1L3Q7Z443 1732 aa7.55□□□□□ -1.2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PDE3BQ13370 1112 aa7.55□□□□□ -1.2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CARD11Q9BXL7 1154 aa7.55□□□□□ -1.2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CCDC7Q96M83 1385 aa7.55□□□□□ -1.2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TRIM37O94972 964 aa7.54□□□□□ -1.2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 AXIN2Q9Y2T1 843 aa7.54□□□□□ -1.2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 C19orf67A6NJJ6 358 aa7.53□□□□□ -1.2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa7.53□□□□□ -1.2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TESK2Q96S53 571 aa7.53□□□□□ -1.2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CARD10Q9BWT7 1032 aa7.53□□□□□ -1.2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ERBB3P21860 1342 aa7.52□□□□□ -1.2
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 C5P01031 1676 aa7.52□□□□□ -1.21
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PLSCR1O15162 318 aa7.52□□□□□ -1.21
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 APBA3O96018 575 aa7.52□□□□□ -1.21
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 VASPP50552 380 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 DDB1Q16531 1140 aa7.52□□□□□ -1.21
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PROM2Q8N271 834 aa7.52□□□□□ -1.21
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa7.52□□□□□ -1.21
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa7.51□□□□□ -1.21
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TERF2IPQ9NYB0 399 aa7.51□□□□□ -1.21
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RTL1A6NKG5 1358 aa7.5□□□□□ -1.21
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 USP47Q96K76 1375 aa7.5□□□□□ -1.21
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NME9Q86XW9 330 aa7.5□□□□□ -1.21
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa7.5□□□□□ -1.21
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa7.49□□□□□ -1.21
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ZBTB7CA1YPR0 619 aa7.49□□□□□ -1.21
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP7.49□□□□□ -1.21
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 UBR3Q6ZT12 1888 aa7.49□□□□□ -1.21
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SOX12O15370 315 aa7.48□□□□□ -1.21
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NBPF14Q5TI25 921 aa7.48□□□□□ -1.21
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TMC1Q8TDI8 760 aa7.48□□□□□ -1.21
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ZNF831Q5JPB2 1677 aa7.47□□□□□ -1.21
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KIF24Q5T7B8 1368 aa7.47□□□□□ -1.21
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 EXOC5O00471 708 aa7.47□□□□□ -1.21
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa7.47□□□□□ -1.21
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IL2RBP14784 551 aa7.47□□□□□ -1.21
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MEGF6O75095 1541 aa7.47□□□□□ -1.21
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NCAPD2Q15021 1401 aa7.46□□□□□ -1.21
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PTF1AQ7RTS3 328 aa7.46□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ANKRD24Q8TF21 1146 aa7.46□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IP6K1Q92551 441 aa7.46□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CREBZFQ9NS37 354 aa7.46□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 UTRNP46939 3433 aa7.46□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TMF1P82094 1093 aa7.45□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 COG3Q96JB2 828 aa7.45□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MAP3K19Q56UN5 1328 aa7.45□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SCN11AQ9UI33 1791 aa7.44□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 HOXC9P31274 260 aa7.44□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PLCB2Q00722 1185 aa7.44□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 TXNRD1Q16881 649 aa7.44□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NLRP2Q9NX02 1062 aa7.44□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NSD2O96028 1365 aa7.44□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FLT4P35916 1363 aa7.44□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 C4BP0C0L5 1744 aa7.44□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FYB1O15117 783 aa7.43□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KCNQ2O43526 872 aa7.43□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CDCA8Q53HL2 280 aa7.43□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SPON1Q9HCB6 807 aa7.43□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CGNL1Q0VF96 1302 aa7.43□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 INSRP06213 1382 aa7.43□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KIF13BQ9NQT8 1826 aa7.43□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NSD3Q9BZ95 1437 aa7.43□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SLC15A2Q16348 729 aa7.42□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MAP3K5Q99683 1374 aa7.42□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa7.42□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 C4AP0C0L4 1744 aa7.41□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 GABBR2O75899 941 aa7.41□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 CD44P16070 742 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PTGER2P43116 358 aa7.41□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 STK32BQ9NY57 414 aa7.41□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 AMPHP49418 695 aa7.4□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ACSBG1Q96GR2 724 aa7.4□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SGIP1Q9BQI5 828 aa7.4□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MTFR1LQ9H019 292 aa7.4□□□□□ -1.22
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 FBLN1P23142 703 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 SLC27A3Q5K4L6 730 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NBPF6Q5VWK0 638 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZRN3-AS1-201ENST00000478988 NBPF4Q96M43 638 aa7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms