RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467691.1

CASQ1-202, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CASQ1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-202ENST00000467691 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa11.79□□□□□ -0.52
CASQ1-202ENST00000467691 PDE3BQ13370 1112 aa11.79□□□□□ -0.52
CASQ1-202ENST00000467691 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP11.79□□□□□ -0.52
CASQ1-202ENST00000467691 ILDR2Q71H61 639 aa11.79□□□□□ -0.52
CASQ1-202ENST00000467691 KRT27Q7Z3Y8 459 aa11.79□□□□□ -0.52
CASQ1-202ENST00000467691 TNS2Q63HR2 1409 aa11.78□□□□□ -0.52
CASQ1-202ENST00000467691 FAM182BQ5T319 152 aa11.78□□□□□ -0.52
CASQ1-202ENST00000467691 MIER1Q8N108 512 aa11.78□□□□□ -0.52
CASQ1-202ENST00000467691 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
CASQ1-202ENST00000467691 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
CASQ1-202ENST00000467691 BRWD3Q6RI45 1802 aa11.78□□□□□ -0.52
CASQ1-202ENST00000467691 PRKAR2BP31323 418 aa11.77□□□□□ -0.53
CASQ1-202ENST00000467691 RSPH6AQ9H0K4 717 aa11.77□□□□□ -0.53
CASQ1-202ENST00000467691 FCHSD2O94868 740 aa11.76□□□□□ -0.53
CASQ1-202ENST00000467691 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
CASQ1-202ENST00000467691 SPG7Q9UQ90 795 aa11.76□□□□□ -0.53
CASQ1-202ENST00000467691 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
CASQ1-202ENST00000467691 ADAMTS8Q9UP79 889 aa11.75□□□□□ -0.53
CASQ1-202ENST00000467691 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa11.75□□□□□ -0.53
CASQ1-202ENST00000467691 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa11.75□□□□□ -0.53
CASQ1-202ENST00000467691 EP400Q96L91 3159 aa11.75□□□□□ -0.53
CASQ1-202ENST00000467691 PKD1L3Q7Z443 1732 aa11.74□□□□□ -0.53
CASQ1-202ENST00000467691 SHANK3Q9BYB0 1731 aa11.74□□□□□ -0.53
CASQ1-202ENST00000467691 CYP27B1O15528 508 aa11.74□□□□□ -0.53
CASQ1-202ENST00000467691 AMOTQ4VCS5 1084 aa11.74□□□□□ -0.53
CASQ1-202ENST00000467691 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
CASQ1-202ENST00000467691 CCDC146Q8IYE0 955 aa11.74□□□□□ -0.53
CASQ1-202ENST00000467691 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
CASQ1-202ENST00000467691 PHACTR3Q96KR7 559 aa11.74□□□□□ -0.53
CASQ1-202ENST00000467691 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP11.74□□□□□ -0.53
CASQ1-202ENST00000467691 CCER2I3L3R5 266 aa11.73□□□□□ -0.53
CASQ1-202ENST00000467691 NEFMP07197 916 aa11.73□□□□□ -0.53
CASQ1-202ENST00000467691 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
CASQ1-202ENST00000467691 FAM9BQ8IZU0 186 aa11.73□□□□□ -0.53
CASQ1-202ENST00000467691 PLEKHF1Q96S99 279 aa11.73□□□□□ -0.53
CASQ1-202ENST00000467691 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
CASQ1-202ENST00000467691 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa11.72□□□□□ -0.53
CASQ1-202ENST00000467691 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa11.72□□□□□ -0.53
CASQ1-202ENST00000467691 PHKG2P15735 406 aa11.72□□□□□ -0.53
CASQ1-202ENST00000467691 C1orf141Q5JVX7 400 aa11.72□□□□□ -0.53
CASQ1-202ENST00000467691 IFNL2Q8IZJ0 200 aa11.72□□□□□ -0.53
CASQ1-202ENST00000467691 FAM196AQ6ZSG2 479 aa11.71□□□□□ -0.53
CASQ1-202ENST00000467691 ACSBG1Q96GR2 724 aa11.71□□□□□ -0.53
CASQ1-202ENST00000467691 AKAP4Q5JQC9 854 aa11.7□□□□□ -0.54
CASQ1-202ENST00000467691 GAS2L2Q8NHY3 880 aa11.7□□□□□ -0.54
CASQ1-202ENST00000467691 RUNDC1Q96C34 613 aa11.7□□□□□ -0.54
CASQ1-202ENST00000467691 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa11.69□□□□□ -0.54
CASQ1-202ENST00000467691 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
CASQ1-202ENST00000467691 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa11.68□□□□□ -0.54
CASQ1-202ENST00000467691 KCNQ2O43526 872 aa11.68□□□□□ -0.54
CASQ1-202ENST00000467691 TRIM37O94972 964 aa11.68□□□□□ -0.54
CASQ1-202ENST00000467691 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CASQ1-202ENST00000467691 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
CASQ1-202ENST00000467691 NFE2L2Q16236 605 aa11.68□□□□□ -0.54
CASQ1-202ENST00000467691 DCAF5Q96JK2 942 aa11.68□□□□□ -0.54
CASQ1-202ENST00000467691 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CASQ1-202ENST00000467691 BCL9O00512 1426 aa11.68□□□□□ -0.54
CASQ1-202ENST00000467691 MAP3K5Q99683 1374 aa11.67□□□□□ -0.54
CASQ1-202ENST00000467691 DOT1LQ8TEK3 1739 aa11.67□□□□□ -0.54
CASQ1-202ENST00000467691 GNAT3A8MTJ3 354 aa11.67□□□□□ -0.54
CASQ1-202ENST00000467691 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
CASQ1-202ENST00000467691 NEUROD2Q15784 382 aa11.67□□□□□ -0.54
CASQ1-202ENST00000467691 PTF1AQ7RTS3 328 aa11.67□□□□□ -0.54
CASQ1-202ENST00000467691 LGR6Q9HBX8 967 aa11.67□□□□□ -0.54
CASQ1-202ENST00000467691 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CASQ1-202ENST00000467691 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa11.66□□□□□ -0.54
CASQ1-202ENST00000467691 APAF1O14727 1248 aa11.66□□□□□ -0.54
CASQ1-202ENST00000467691 TMPOP42166 694 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CASQ1-202ENST00000467691 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
CASQ1-202ENST00000467691 RNMTO43148 476 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CASQ1-202ENST00000467691 RIPK4P57078 832 aa11.65□□□□□ -0.54
CASQ1-202ENST00000467691 DCTN1Q14203 1278 aa11.65□□□□□ -0.54
CASQ1-202ENST00000467691 MCM10Q7L590 875 aa11.65□□□□□ -0.54
CASQ1-202ENST00000467691 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CASQ1-202ENST00000467691 NHSQ6T4R5 1651 aa11.65□□□□□ -0.55
CASQ1-202ENST00000467691 SBF2Q86WG5 1849 aa11.65□□□□□ -0.55
CASQ1-202ENST00000467691 CABP4P57796 275 aa11.64□□□□□ -0.55
CASQ1-202ENST00000467691 IL17REQ8NFR9 667 aa11.64□□□□□ -0.55
CASQ1-202ENST00000467691 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
CASQ1-202ENST00000467691 TMOD3Q9NYL9 352 aa11.64□□□□□ -0.55
CASQ1-202ENST00000467691 ERVV-2B6SEH9 535 aa11.63□□□□□ -0.55
CASQ1-202ENST00000467691 APBA3O96018 575 aa11.63□□□□□ -0.55
CASQ1-202ENST00000467691 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CASQ1-202ENST00000467691 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa11.63□□□□□ -0.55
CASQ1-202ENST00000467691 PIGBQ92521 554 aa11.63□□□□□ -0.55
CASQ1-202ENST00000467691 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CASQ1-202ENST00000467691 SCN11AQ9UI33 1791 aa11.63□□□□□ -0.55
CASQ1-202ENST00000467691 DLG5Q8TDM6 1919 aa11.62□□□□□ -0.55
CASQ1-202ENST00000467691 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
CASQ1-202ENST00000467691 TEFQ10587 303 aa11.62□□□□□ -0.55
CASQ1-202ENST00000467691 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
CASQ1-202ENST00000467691 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
CASQ1-202ENST00000467691 ITGB4P16144 1822 aa11.62□□□□□ -0.55
CASQ1-202ENST00000467691 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa11.62□□□□□ -0.55
CASQ1-202ENST00000467691 KAT6BQ8WYB5 2073 aa11.61□□□□□ -0.55
CASQ1-202ENST00000467691 BTAF1O14981 1849 aa11.61□□□□□ -0.55
CASQ1-202ENST00000467691 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
CASQ1-202ENST00000467691 LMOD3Q0VAK6 560 aa11.61□□□□□ -0.55
CASQ1-202ENST00000467691 CCDC125Q86Z20 511 aa11.61□□□□□ -0.55
CASQ1-202ENST00000467691 SLC52A2Q9HAB3 445 aa11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms