RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427644.1

LIMD1-AS1-201, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMD1-AS1, Length 1,536 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 WDR63Q8IWG1 891 aa12.85□□□□□ -0.35
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RGPD1P0DJD0 1748 aa12.85□□□□□ -0.35
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PRDM11Q9NQV5 511 aa12.84□□□□□ -0.35
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CHRNA2Q15822 529 aa12.78□□□□□ -0.36
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 AXIN2Q9Y2T1 843 aa12.77□□□□□ -0.37
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LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.38
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.38
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.38
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.38
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BCL2L13Q9BXK5 485 aa12.69□□□□□ -0.38
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IFT57Q9NWB7 429 aa12.69□□□□□ -0.38
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP12.69□□□□□ -0.38
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SPG7Q9UQ90 795 aa12.69□□□□□ -0.38
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP12.68□□□□□ -0.38
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GNAI1P63096 354 aa12.68□□□□□ -0.38
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCDC136Q96JN2 1154 aa12.68□□□□□ -0.38
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NRAPQ86VF7 1730 aa12.68□□□□□ -0.38
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MAP3K5Q99683 1374 aa12.68□□□□□ -0.38
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GNAT3A8MTJ3 354 aa12.67□□□□□ -0.38
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C1orf141Q5JVX7 400 aa12.67□□□□□ -0.38
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MCM10Q7L590 875 aa12.67□□□□□ -0.38
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NGLY1Q96IV0 654 aa12.67□□□□□ -0.38
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