RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319107.8

RALGPS1-202, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 3

Gene RALGPS1, Length 770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-202ENST00000319107 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
RALGPS1-202ENST00000319107 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
RALGPS1-202ENST00000319107 EYA1Q99502 592 aa27.13■■□□□ 1.93
RALGPS1-202ENST00000319107 PKD1L3Q7Z443 1732 aa27.11■■□□□ 1.93
RALGPS1-202ENST00000319107 USHBP1Q8N6Y0 703 aa27.11■■□□□ 1.93
RALGPS1-202ENST00000319107 MEGF6O75095 1541 aa27.11■■□□□ 1.93
RALGPS1-202ENST00000319107 SHANK3Q9BYB0 1731 aa27.1■■□□□ 1.93
RALGPS1-202ENST00000319107 TRIM37O94972 964 aa27.1■■□□□ 1.93
RALGPS1-202ENST00000319107 DDB1Q16531 1140 aa27.1■■□□□ 1.93
RALGPS1-202ENST00000319107 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
RALGPS1-202ENST00000319107 APBA3O96018 575 aa27.09■■□□□ 1.93
RALGPS1-202ENST00000319107 YY1P25490 414 aa27.09■■□□□ 1.93
RALGPS1-202ENST00000319107 KDRP35968 1356 aa27.08■■□□□ 1.93
RALGPS1-202ENST00000319107 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa27.07■■□□□ 1.92
RALGPS1-202ENST00000319107 TNS2Q63HR2 1409 aa27.07■■□□□ 1.92
RALGPS1-202ENST00000319107 IL2RBP14784 551 aa27.06■■□□□ 1.92
RALGPS1-202ENST00000319107 NBPF14Q5TI25 921 aa27.06■■□□□ 1.92
RALGPS1-202ENST00000319107 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa27.06■■□□□ 1.92
RALGPS1-202ENST00000319107 NUDCQ9Y266 331 aa27.05■■□□□ 1.92
RALGPS1-202ENST00000319107 DCAF8L1A6NGE4 600 aa27.02■■□□□ 1.92
RALGPS1-202ENST00000319107 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
RALGPS1-202ENST00000319107 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa27.02■■□□□ 1.92
RALGPS1-202ENST00000319107 AEBP1Q8IUX7 1158 aa27.01■■□□□ 1.91
RALGPS1-202ENST00000319107 EXOC5O00471 708 aa27■■□□□ 1.91
RALGPS1-202ENST00000319107 SULT6B1Q6IMI4 303 aa27■■□□□ 1.91
RALGPS1-202ENST00000319107 TATP17735 454 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
RALGPS1-202ENST00000319107 SBF2Q86WG5 1849 aa26.99■■□□□ 1.91
RALGPS1-202ENST00000319107 HMOX1P09601 288 aa26.98■■□□□ 1.91
RALGPS1-202ENST00000319107 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
RALGPS1-202ENST00000319107 CCDC184Q52MB2 194 aa26.97■■□□□ 1.91
RALGPS1-202ENST00000319107 SPON1Q9HCB6 807 aa26.97■■□□□ 1.91
RALGPS1-202ENST00000319107 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
RALGPS1-202ENST00000319107 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.96■■□□□ 1.91
RALGPS1-202ENST00000319107 RREB1Q92766 1687 aa26.95■■□□□ 1.91
RALGPS1-202ENST00000319107 BCL9O00512 1426 aa26.94■■□□□ 1.9
RALGPS1-202ENST00000319107 MRS2Q9HD23 443 aa26.94■■□□□ 1.9
RALGPS1-202ENST00000319107 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.93■■□□□ 1.9
RALGPS1-202ENST00000319107 KCNQ2O43526 872 aa26.92■■□□□ 1.9
RALGPS1-202ENST00000319107 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
RALGPS1-202ENST00000319107 NUP188Q5SRE5 1749 aa26.92■■□□□ 1.9
RALGPS1-202ENST00000319107 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
RALGPS1-202ENST00000319107 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.9■■□□□ 1.9
RALGPS1-202ENST00000319107 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP26.9■■□□□ 1.99e-6■□□□□ 9.4
RALGPS1-202ENST00000319107 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
RALGPS1-202ENST00000319107 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa26.9■■□□□ 1.9
RALGPS1-202ENST00000319107 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa26.9■■□□□ 1.9
RALGPS1-202ENST00000319107 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
RALGPS1-202ENST00000319107 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa26.89■■□□□ 1.9
RALGPS1-202ENST00000319107 FCHSD2O94868 740 aa26.89■■□□□ 1.9
RALGPS1-202ENST00000319107 DOT1LQ8TEK3 1739 aa26.89■■□□□ 1.9
RALGPS1-202ENST00000319107 PRKAR2BP31323 418 aa26.88■■□□□ 1.89
RALGPS1-202ENST00000319107 SPG7Q9UQ90 795 aa26.88■■□□□ 1.89
RALGPS1-202ENST00000319107 CCER2I3L3R5 266 aa26.87■■□□□ 1.89
RALGPS1-202ENST00000319107 AMOTQ4VCS5 1084 aa26.87■■□□□ 1.89
RALGPS1-202ENST00000319107 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa26.87■■□□□ 1.89
RALGPS1-202ENST00000319107 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
RALGPS1-202ENST00000319107 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
RALGPS1-202ENST00000319107 DLG5Q8TDM6 1919 aa26.85■■□□□ 1.89
RALGPS1-202ENST00000319107 MIER1Q8N108 512 aa26.85■■□□□ 1.89
RALGPS1-202ENST00000319107 NHSQ6T4R5 1651 aa26.85■■□□□ 1.89
RALGPS1-202ENST00000319107 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa26.83■■□□□ 1.89
RALGPS1-202ENST00000319107 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
RALGPS1-202ENST00000319107 SCN11AQ9UI33 1791 aa26.83■■□□□ 1.89
RALGPS1-202ENST00000319107 CYP27B1O15528 508 aa26.82■■□□□ 1.88
RALGPS1-202ENST00000319107 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
RALGPS1-202ENST00000319107 PLEKHF1Q96S99 279 aa26.82■■□□□ 1.88
RALGPS1-202ENST00000319107 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
RALGPS1-202ENST00000319107 ADAMTS8Q9UP79 889 aa26.82■■□□□ 1.88
RALGPS1-202ENST00000319107 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
RALGPS1-202ENST00000319107 KAT6BQ8WYB5 2073 aa26.81■■□□□ 1.88
RALGPS1-202ENST00000319107 PLSCR1O15162 318 aa26.8■■□□□ 1.88
RALGPS1-202ENST00000319107 ITGB4P16144 1822 aa26.79■■□□□ 1.88
RALGPS1-202ENST00000319107 PHKG2P15735 406 aa26.79■■□□□ 1.88
RALGPS1-202ENST00000319107 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP26.79■■□□□ 1.88
RALGPS1-202ENST00000319107 IFNL2Q8IZJ0 200 aa26.79■■□□□ 1.88
RALGPS1-202ENST00000319107 PHACTR3Q96KR7 559 aa26.79■■□□□ 1.88
RALGPS1-202ENST00000319107 NEFMP07197 916 aa26.78■■□□□ 1.88
RALGPS1-202ENST00000319107 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26.78■■□□□ 1.88
RALGPS1-202ENST00000319107 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.77■■□□□ 1.88
RALGPS1-202ENST00000319107 C1orf141Q5JVX7 400 aa26.76■■□□□ 1.87
RALGPS1-202ENST00000319107 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
RALGPS1-202ENST00000319107 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
RALGPS1-202ENST00000319107 MAP3K5Q99683 1374 aa26.74■■□□□ 1.87
RALGPS1-202ENST00000319107 AKAP4Q5JQC9 854 aa26.74■■□□□ 1.87
RALGPS1-202ENST00000319107 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.74■■□□□ 1.87
RALGPS1-202ENST00000319107 RUNDC1Q96C34 613 aa26.74■■□□□ 1.87
RALGPS1-202ENST00000319107 ACSBG1Q96GR2 724 aa26.74■■□□□ 1.87
RALGPS1-202ENST00000319107 PTF1AQ7RTS3 328 aa26.73■■□□□ 1.87
RALGPS1-202ENST00000319107 BTAF1O14981 1849 aa26.73■■□□□ 1.87
RALGPS1-202ENST00000319107 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
RALGPS1-202ENST00000319107 MRC1P22897 1456 aa26.72■■□□□ 1.87
RALGPS1-202ENST00000319107 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
RALGPS1-202ENST00000319107 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.7■■□□□ 1.86
RALGPS1-202ENST00000319107 NFE2L2Q16236 605 aa26.69■■□□□ 1.86
RALGPS1-202ENST00000319107 DCAF5Q96JK2 942 aa26.69■■□□□ 1.86
RALGPS1-202ENST00000319107 GNAT3A8MTJ3 354 aa26.68■■□□□ 1.86
RALGPS1-202ENST00000319107 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
RALGPS1-202ENST00000319107 PAPPAQ13219 1627 aa26.65■■□□□ 1.86
RALGPS1-202ENST00000319107 TMPOP42166 694 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
RALGPS1-202ENST00000319107 TXNRD1Q16881 649 aa26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms