RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297163.3

SMAD5-AS1-201, SMAD5 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD5-AS1, Length 1,816 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TTLL13PA6NNM8 815 aa10.51□□□□□ -0.73
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 AXIN2Q9Y2T1 843 aa10.51□□□□□ -0.73
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 NRAPQ86VF7 1730 aa10.51□□□□□ -0.73
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CGNL1Q0VF96 1302 aa10.51□□□□□ -0.73
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 FBLN1P23142 703 aa10.51□□□□□ -0.73
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 COL18A1P39060 1754 aa10.5□□□□□ -0.73
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 GLI3P10071 1580 aa10.5□□□□□ -0.73
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 EP400Q96L91 3159 aa10.5□□□□□ -0.73
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ZBTB7CA1YPR0 619 aa10.49□□□□□ -0.73
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 STRN4Q9NRL3 753 aa10.49□□□□□ -0.73
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 RGS12O14924 1447 aa10.49□□□□□ -0.73
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa10.49□□□□□ -0.73
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa10.49□□□□□ -0.73
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MAP3K19Q56UN5 1328 aa10.48□□□□□ -0.73
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TRPC6Q9Y210 931 aa10.48□□□□□ -0.73
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 KIF20BQ96Q89 1820 aa10.48□□□□□ -0.73
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ABCC6O95255 1503 aa10.48□□□□□ -0.73
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa10.47□□□□□ -0.73
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 EVA1CP58658 441 aa10.47□□□□□ -0.73
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 KNSTRNQ9Y448 316 aa10.47□□□□□ -0.73
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 NSD2O96028 1365 aa10.46□□□□□ -0.73
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 WDR17Q8IZU2 1322 aa10.46□□□□□ -0.73
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 FAM205CA6NFA0 338 aa10.46□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PLCG2P16885 1265 aa10.46□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 IP6K1Q92551 441 aa10.46□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ERBB3P21860 1342 aa10.45□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 LTN1O94822 1766 aa10.45□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 HOXC9P31274 260 aa10.45□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CRB1P82279 1406 aa10.45□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 POTEB3A0JP26 581 aa10.44□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 POTEBQ6S5H4 581 aa10.44□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 USP35Q9P2H5 1018 aa10.44□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TRIM35Q9UPQ4 493 aa10.44□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 RGPD5Q99666 1765 aa10.44□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SOCS7O14512 581 aa10.44□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 AMPHP49418 695 aa10.44□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 BARGINQ6ZT62 677 aa10.44□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SEPT12Q8IYM1 358 aa10.44□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TCP11L2Q8N4U5 519 aa10.44□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa10.44□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 RTL1A6NKG5 1358 aa10.44□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa10.43□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ANKRD24Q8TF21 1146 aa10.43□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CARD10Q9BWT7 1032 aa10.43□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 POLKQ9UBT6 870 aa10.43□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 KIF24Q5T7B8 1368 aa10.43□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa10.43□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa10.43□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 FLT4P35916 1363 aa10.42□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PEAK1Q9H792 1746 aa10.42□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa10.42□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa10.42□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MORC1Q86VD1 984 aa10.42□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa10.42□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa10.41□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 INSRP06213 1382 aa10.41□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 A0A0G2JS52 829 aa10.4□□□□□ -0.75
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.75
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 NLRP2Q9NX02 1062 aa10.4□□□□□ -0.75
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.75
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 DISP2A7MBM2 1401 aa10.39□□□□□ -0.75
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 KRT27Q7Z3Y8 459 aa10.39□□□□□ -0.75
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 BRWD3Q6RI45 1802 aa10.38□□□□□ -0.75
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 NBPF6Q5VWK0 638 aa10.37□□□□□ -0.75
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 NBPF4Q96M43 638 aa10.37□□□□□ -0.75
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP10.37□□□□□ -0.75
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MAP3K13O43283 966 aa10.35□□□□□ -0.75
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 IL2RBP14784 551 aa10.35□□□□□ -0.75
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 MTHFSP49914 203 aa10.35□□□□□ -0.75
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 DDB1Q16531 1140 aa10.35□□□□□ -0.75
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 FAM182BQ5T319 152 aa10.35□□□□□ -0.75
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 NCAPD2Q15021 1401 aa10.35□□□□□ -0.75
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 PTGER2P43116 358 aa10.35□□□□□ -0.75
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 USHBP1Q8N6Y0 703 aa10.35□□□□□ -0.75
SMAD5-AS1-201ENST00000297163 EYA1Q99502 592 aa10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms