RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000188769.1

Gm28345-201, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Gm28345, Length 1,139 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Ddx54Q8K4L0 874 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Ssfa2Q922B9 1252 aa14.84□□□□□ -0.03
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Foxp4Q9DBY0 795 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Vamp4O70480 141 aa14.83□□□□□ -0.04
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Aplp2Q06335 707 aa14.82□□□□□ -0.04
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Usp16Q99LG0 825 aa14.82□□□□□ -0.04
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Shank2Q80Z38 1476 aa14.82□□□□□ -0.04
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Akap11E9Q777 1895 aa14.81□□□□□ -0.04
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Emilin2Q8K482 1074 aa14.81□□□□□ -0.04
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Phkg2Q9DB30 406 aa14.81□□□□□ -0.04
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Mst1rQ62190 1378 aa14.81□□□□□ -0.04
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Calr4Q3TQS0 420 aa14.8□□□□□ -0.04
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Pak3Q61036 559 aa14.8□□□□□ -0.04
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Eif3bQ8JZQ9 803 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Pdzd9Q9D9M4 266 aa14.8□□□□□ -0.04
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Kcnh4A2A5F7 1018 aa14.79□□□□□ -0.04
Gm28345-201ENSMUST00000188769 AampJ3QN89 436 aa14.79□□□□□ -0.04
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Snap23O09044 210 aa14.79□□□□□ -0.04
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Pm20d1Q8C165 503 aa14.79□□□□□ -0.04
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Fer1l6E0CZ42 1862 aa14.78□□□□□ -0.04
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Ubr2Q6WKZ8 1755 aa14.78□□□□□ -0.04
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Prim1P20664 417 aa14.78□□□□□ -0.04
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Vps33bP59016 617 aa14.78□□□□□ -0.04
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Trim58Q5NCC9 485 aa14.78□□□□□ -0.04
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Ginm1Q91WR6 327 aa14.78□□□□□ -0.04
Gm28345-201ENSMUST00000188769 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Ecm2Q5FW85 670 aa14.77□□□□□ -0.05
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Ggnbp2Q5SV77 696 aa14.77□□□□□ -0.05
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Ccdc60Q8C4J0 545 aa14.77□□□□□ -0.05
Gm28345-201ENSMUST00000188769 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Atf5O70191 283 aa14.76□□□□□ -0.05
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Chmp7Q8R1T1 451 aa14.76□□□□□ -0.05
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Msh6P54276 1358 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Chl1P70232 1209 aa14.75□□□□□ -0.05
Gm28345-201ENSMUST00000188769 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa14.75□□□□□ -0.05
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Klhdc4Q921I2 584 aa14.75□□□□□ -0.05
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Fam50bQ9WTJ8 334 aa14.75□□□□□ -0.05
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Nhsl1Q8CAF4 1587 aa14.75□□□□□ -0.05
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Cntnap1O54991 1385 aa14.74□□□□□ -0.05
Gm28345-201ENSMUST00000188769 PappaQ8R4K8 1624 aa14.74□□□□□ -0.05
Gm28345-201ENSMUST00000188769 InhbeO08717 350 aa14.74□□□□□ -0.05
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Dlg5E9Q9R9 1921 aa14.74□□□□□ -0.05
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Cacna1sQ02789 1880 aa14.74□□□□□ -0.05
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Znf521Q6KAS7 1311 aa14.73□□□□□ -0.05
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Ccdc129Q14B48 1034 aa14.73□□□□□ -0.05
Gm28345-201ENSMUST00000188769 MarsQ68FL6 902 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Ggt6Q6PDE7 497 aa14.73□□□□□ -0.05
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa14.73□□□□□ -0.05
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Asic4Q7TNS7 539 aa14.73□□□□□ -0.05
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Eif4a1P60843 406 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Nkx2-3P97334 362 aa14.72□□□□□ -0.05
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Btbd11Q6GQW0 1109 aa14.72□□□□□ -0.05
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Speer4bQ9D9F7 267 aa14.72□□□□□ -0.05
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Col1a2Q01149 1372 aa14.72□□□□□ -0.05
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Elp1Q7TT37 1333 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Gm21680A0A0G2JGR8 267 aa14.71□□□□□ -0.05
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Sema6bO54951 886 aa14.71□□□□□ -0.05
Gm28345-201ENSMUST00000188769 BcorQ8CGN4 1759 aa14.7□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Lrp6O88572 1613 aa14.7□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Cnksr1A2A9K7 700 aa14.7□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 NeflP08551 543 aa14.7□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Sik1Q60670 779 aa14.7□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Morc2aQ69ZX6 1030 aa14.7□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Slc5a1Q8C3K6 665 aa14.7□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Polr3glQ8R0C0 218 aa14.7□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Aldh1l1Q8R0Y6 902 aa14.7□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Trim26Q99PN3 545 aa14.7□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Prkrip1Q9CWV6 186 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Nsd3Q6P2L6 1439 aa14.69□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Gm6268A2A3U9 297 aa14.69□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Q3TQI7 289 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Nyap1Q6PFX7 833 aa14.69□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Ankrd23Q812A3 306 aa14.69□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Tmem119Q8R138 280 aa14.69□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Exoc5Q3TPX4 708 aa14.68□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 PsapQ61207 557 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Larp1Q6ZQ58 1072 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 MypopQ8R4U1 393 aa14.68□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Mast2Q60592 1734 aa14.68□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Nwd2Q6P5U7 1742 aa14.68□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Gm21663A0A0G2JE01 267 aa14.67□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Gm7361D3Z6R1 267 aa14.67□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 5031410I06RikE9Q4E0 267 aa14.67□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Gm1979E9QAN3 267 aa14.67□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Gm5862K7N5V5 267 aa14.67□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Gm10220K7N660 267 aa14.67□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Q3UPC7 1272 aa14.67□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Cyp2d12Q8BVD2 504 aa14.67□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Psrc1Q9D0P7 329 aa14.67□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Tnrc6cQ3UHC0 1690 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Chpf2Q3UU43 768 aa14.66□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Apbb1Q9QXJ1 710 aa14.66□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Taf7Q9R1C0 341 aa14.66□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Pnpla7A2AJ88 1352 aa14.65□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Cers3Q1A3B0 383 aa14.65□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Iqsec3Q3TES0 1195 aa14.65□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Sf3b2Q3UJB0 878 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Gm28345-201ENSMUST00000188769 Pank1Q8K4K6 548 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 82.4 ms