RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000101395.2

Hoxa4-201, Transcript of Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxa4, Length 1,594 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tnks1bp1P58871 1720 aa37.11■■■■□ 3.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Emilin2Q8K482 1074 aa37.09■■■■□ 3.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Snap23O09044 210 aa37.08■■■■□ 3.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Myo5bP21271 1818 aa37.08■■■■□ 3.53
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Igsf1Q7TQA1 1317 aa37.06■■■■□ 3.52
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP37.06■■■■□ 3.52
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Phkg2Q9DB30 406 aa37.06■■■■□ 3.52
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Calr4Q3TQS0 420 aa37.05■■■■□ 3.52
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Eif3bQ8JZQ9 803 aaKnown RBP37.05■■■■□ 3.52
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fam50bQ9WTJ8 334 aa37.05■■■■□ 3.52
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ggnbp2Q5SV77 696 aa37.04■■■■□ 3.52
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pdzd9Q9D9M4 266 aa37.04■■■■□ 3.52
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Vamp4O70480 141 aa37.03■■■■□ 3.52
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Chmp7Q8R1T1 451 aa37.03■■■■□ 3.52
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ssfa2Q922B9 1252 aa37.03■■■■□ 3.52
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Polr3glQ8R0C0 218 aa37.02■■■■□ 3.52
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Foxp4Q9DBY0 795 aaKnown RBP37.02■■■■□ 3.52
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Prim1P20664 417 aa37.01■■■■□ 3.52
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ccdc60Q8C4J0 545 aa37■■■■□ 3.51
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Klhdc4Q921I2 584 aa37■■■■□ 3.51
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Shank2Q80Z38 1476 aa37■■■■□ 3.51
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Trim26Q99PN3 545 aa37■■■■□ 3.51
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pm20d1Q8C165 503 aa36.99■■■■□ 3.51
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP36.98■■■■□ 3.51
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Mst1rQ62190 1378 aa36.97■■■■□ 3.51
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP36.96■■■■□ 3.51
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ginm1Q91WR6 327 aa36.96■■■■□ 3.51
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Speer4bQ9D9F7 267 aa36.96■■■■□ 3.51
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kcnh4A2A5F7 1018 aa36.95■■■■□ 3.51
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cntnap1O54991 1385 aa36.93■■■■□ 3.5
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Trim58Q5NCC9 485 aa36.92■■■■□ 3.5
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 KarsQ99MN1 595 aaKnown RBP36.92■■■■□ 3.5
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm21680A0A0G2JGR8 267 aa36.91■■■■□ 3.5
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm6268A2A3U9 297 aa36.91■■■■□ 3.5
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nyap1Q6PFX7 833 aa36.91■■■■□ 3.5
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nhsl1Q8CAF4 1587 aa36.9■■■■□ 3.5
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ccdc129Q14B48 1034 aa36.9■■■■□ 3.5
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 InhbeO08717 350 aa36.89■■■■□ 3.5
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sema6bO54951 886 aa36.89■■■■□ 3.5
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Btbd11Q6GQW0 1109 aa36.89■■■■□ 3.5
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Elp1Q7TT37 1333 aaKnown RBP36.88■■■■□ 3.5
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Vps33bP59016 617 aa36.88■■■■□ 3.49
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Asic4Q7TNS7 539 aa36.88■■■■□ 3.49
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa36.88■■■■□ 3.49
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 NeflP08551 543 aa36.87■■■■□ 3.49
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Apbb1Q9QXJ1 710 aa36.87■■■■□ 3.49
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Slc5a1Q8C3K6 665 aa36.86■■■■□ 3.49
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Akap11E9Q777 1895 aa36.85■■■■□ 3.49
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Atf5O70191 283 aa36.85■■■■□ 3.49
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Psrc1Q9D0P7 329 aa36.85■■■■□ 3.49
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa36.84■■■■□ 3.49
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Kat6bQ8BRB7 1872 aa36.84■■■■□ 3.49
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Q3TQI7 289 aaKnown RBP36.83■■■■□ 3.49
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Msh6P54276 1358 aaKnown RBP36.83■■■■□ 3.49
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm21663A0A0G2JE01 267 aa36.83■■■■□ 3.49
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm7361D3Z6R1 267 aa36.83■■■■□ 3.49
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 5031410I06RikE9Q4E0 267 aa36.83■■■■□ 3.49
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm1979E9QAN3 267 aa36.83■■■■□ 3.49
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm5862K7N5V5 267 aa36.83■■■■□ 3.49
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Gm10220K7N660 267 aa36.83■■■■□ 3.49
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nkx2-3P97334 362 aa36.82■■■■□ 3.48
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sf3b2Q3UJB0 878 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.48
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 MypopQ8R4U1 393 aa36.82■■■■□ 3.48
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Senp3Q9EP97 568 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.48
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Eif4a1P60843 406 aaKnown RBP36.81■■■■□ 3.48
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Sik1Q60670 779 aa36.81■■■■□ 3.48
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pibf1E9Q6K3 756 aa36.8■■■■□ 3.48
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Chl1P70232 1209 aa36.8■■■■□ 3.48
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Larp1Q6ZQ58 1072 aaKnown RBP36.8■■■■□ 3.48
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Col1a2Q01149 1372 aa36.8■■■■□ 3.48
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ubr2Q6WKZ8 1755 aa36.8■■■■□ 3.48
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Lrp6O88572 1613 aa36.8■■■■□ 3.48
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fnbp4Q6ZQ03 1031 aa36.79■■■■□ 3.48
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ankrd23Q812A3 306 aa36.79■■■■□ 3.48
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fer1l6E0CZ42 1862 aa36.79■■■■□ 3.48
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Nsd3Q6P2L6 1439 aa36.78■■■■□ 3.48
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 AampJ3QN89 436 aa36.78■■■■□ 3.48
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Exoc5Q3TPX4 708 aa36.77■■■■□ 3.48
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ccdc155Q80VJ8 648 aa36.75■■■■□ 3.47
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cacna1sQ02789 1880 aa36.74■■■■□ 3.47
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 MarsQ68FL6 902 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Chpf2Q3UU43 768 aa36.74■■■■□ 3.47
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 PappaQ8R4K8 1624 aa36.73■■■■□ 3.47
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tmco5bQ80X59 307 aa36.73■■■■□ 3.47
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Pank1Q8K4K6 548 aa36.72■■■■□ 3.47
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Aldh1l1Q8R0Y6 902 aa36.72■■■■□ 3.47
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cyp2d12Q8BVD2 504 aa36.71■■■■□ 3.47
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Q3UPC7 1272 aa36.69■■■■□ 3.46
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 PsapQ61207 557 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Fbxo41Q6NS60 873 aa36.68■■■■□ 3.46
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Prkrip1Q9CWV6 186 aaKnown RBP36.68■■■■□ 3.46
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Znf521Q6KAS7 1311 aa36.67■■■■□ 3.46
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Cnksr1A2A9K7 700 aa36.67■■■■□ 3.46
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tnrc6cQ3UHC0 1690 aaKnown RBP36.66■■■■□ 3.46
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Eno4Q8C042 619 aa36.66■■■■□ 3.46
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Tmem119Q8R138 280 aa36.66■■■■□ 3.46
Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Ddb1Q3U1J4 1140 aaKnown RBP36.66■■■■□ 3.46
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Hoxa4-201ENSMUST00000101395 Taf7Q9R1C0 341 aa36.65■■■■□ 3.46
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