RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 EPHA4P54764 986 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 INHBCP55103 352 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 GABREP78334 506 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 CTBSQ01459 385 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 GALNT3Q14435 633 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 KRT33BQ14525 404 aa5.55□□□□□ -1.52
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CLSTN3-215ENST00000544584 TBC1D25Q3MII6 688 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 GPR33Q49SQ1 333 aa5.55□□□□□ -1.52
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CLSTN3-215ENST00000544584 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 CDCP2Q5VXM1 449 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 ARMC3Q5W041 872 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 GUSBP11Q6P575 273 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 IGF2-ASQ6U949 168 aa5.55□□□□□ -1.52
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CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF662Q6ZS27 426 aa5.55□□□□□ -1.52
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CLSTN3-215ENST00000544584 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 GSTA5Q7RTV2 222 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 TSPAN33Q86UF1 283 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 PLXDC1Q8IUK5 500 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF567Q8N184 647 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 FBXO39Q8N4B4 442 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC25A41Q8N5S1 370 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 CNTD1Q8N815 330 aa5.55□□□□□ -1.52
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CLSTN3-215ENST00000544584 ACRBPQ8NEB7 543 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 SCAMP4Q969E2 229 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC74AQ96AQ1 378 aa5.55□□□□□ -1.52
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CLSTN3-215ENST00000544584 PDXPQ96GD0 296 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 HES6Q96HZ4 224 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 COX14Q96I36 57 aa5.55□□□□□ -1.52
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CLSTN3-215ENST00000544584 TIMM29Q9BSF4 260 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 CCM2Q9BSQ5 444 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 EFHD1Q9BUP0 239 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 LGR4Q9BXB1 951 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 LACRTQ9GZZ8 138 aa5.55□□□□□ -1.52
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CLSTN3-215ENST00000544584 CRLS1Q9UJA2 301 aa5.55□□□□□ -1.52
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CLSTN3-215ENST00000544584 ACSL5Q9ULC5 683 aa5.55□□□□□ -1.52
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CLSTN3-215ENST00000544584 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 PLXNA2O75051 1894 aa5.55□□□□□ -1.52
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CLSTN3-215ENST00000544584 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 WISP1O95388 367 aa5.54□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 ECEL1O95672 775 aa5.54□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 FTCDO95954 541 aa5.54□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 IFNB1P01574 187 aa5.54□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 MMP2P08253 660 aa5.54□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 F3P13726 295 aa5.54□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 AMD1P17707 334 aa5.54□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 FASLGP48023 281 aa5.54□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 ATP1A2P50993 1020 aa5.54□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 RAB15P59190 212 aa5.54□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 CDK16Q00536 496 aa5.54□□□□□ -1.52
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CLSTN3-215ENST00000544584 CFHR1Q03591 330 aa5.54□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC173Q0VFZ6 552 aa5.54□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 WASHC5Q12768 1159 aa5.54□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 CDH17Q12864 832 aa5.54□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 SQSTM1Q13501 440 aa5.54□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 CAMK2BQ13554 666 aa5.54□□□□□ -1.52
CLSTN3-215ENST00000544584 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP5.54□□□□□ -1.52
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