RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512611.5

RAPGEF6-211, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAPGEF6, Length 3,683 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-211ENST00000512611 ANAPC2Q9UJX6 822 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 PSME2Q9UL46 239 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 MED16Q9Y2X0 877 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 MIA3Q5JRA6 1907 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 A0A1W2PP18 115 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 TREHO43280 583 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 LDLRP01130 860 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 RBP1P09455 135 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 BMP1P13497 986 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 WARSP23381 471 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCR1P32246 355 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 VBP1P61758 197 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 GALNT3Q14435 633 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 OXA1LQ15070 435 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 ARL13BQ3SXY8 428 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 NIPAL1Q6NVV3 410 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 PAQR3Q6TCH7 311 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 SYVN1Q86TM6 617 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 LGI2Q8N0V4 545 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 OR52B6Q8NGF0 335 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 PPTC7Q8NI37 304 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 FBXO30Q8TB52 745 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 PROKR1Q8TCW9 393 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 STON2Q8WXE9 905 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 RSPH1Q8WYR4 309 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 UBE2FQ969M7 185 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 TSGA13Q96PP4 275 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 VAT1Q99536 393 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 RTP3Q9BQQ7 232 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 ING2Q9H160 280 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 SP110Q9HB58 689 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 PKD2L2Q9NZM6 624 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF639Q9UID6 485 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 MUSKO15146 869 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 AQP9O43315 295 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 LDB2O43679 373 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 MITFO75030 526 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 GOT2P00505 430 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 ALBP02768 609 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 CYBBP04839 570 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 DARSP14868 501 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 TSNQ15631 228 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 TRIM16LQ309B1 348 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 ADPRMQ3LIE5 342 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 ALFQ53S48 1182 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 SIRPB2Q5JXA9 342 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC22A15Q8IZD6 547 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 BPIFB1Q8TDL5 484 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 PSMG2Q969U7 264 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 MYEOVQ96EZ4 313 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAR2Q96K12 515 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCDC90BQ9GZT6 254 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 DERAQ9Y315 318 aa6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 AGRPO00253 132 aa6.78□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 ANXA9O76027 345 aa6.78□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 PFKLP17858 780 aa6.78□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 LBPP18428 481 aa6.78□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 CD6P30203 668 aa6.78□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 MTHFRP42898 656 aa6.78□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMED10P49755 219 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 CD47Q08722 323 aa6.78□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC13A2Q13183 592 aa6.78□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 RCAN2Q14206 197 aa6.78□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP6.78□□□□□ -1.321e-6■■■□□ 15.8
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC14A2Q15849 920 aa6.78□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
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RAPGEF6-211ENST00000512611 DEFB132Q7Z7B7 95 aa6.78□□□□□ -1.32
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RAPGEF6-211ENST00000512611 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa6.78□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 HMCESQ96FZ2 354 aa6.78□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 ATOH8Q96SQ7 321 aa6.78□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZBED2Q9BTP6 218 aa6.78□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 TBCDQ9BTW9 1192 aa6.78□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 KATNBL1Q9H079 304 aa6.78□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 ACTL8Q9H568 366 aa6.78□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa6.78□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 SCUBE2Q9NQ36 999 aa6.78□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 ITM2CQ9NQX7 267 aa6.78□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC6A13Q9NSD5 602 aa6.78□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAM118AQ9NWS6 357 aa6.78□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 GIN1Q9NXP7 522 aa6.78□□□□□ -1.32
RAPGEF6-211ENST00000512611 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
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