RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490478.5

CACNA2D3-210, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-210ENST00000490478 DCDC2Q9UHG0 476 aa6.85□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa6.85□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 PIPSLA2A3N6 862 aa6.85□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMEM233B4DJY2 109 aa6.85□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 NFIBO00712 420 aa6.85□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 NME4O00746 187 aa6.85□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 GPR37O15354 613 aa6.85□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 FZD6O60353 706 aa6.85□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 MAOBP27338 520 aa6.85□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 TGFBR2P37173 567 aa6.85□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 MASP1P48740 699 aa6.85□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 RGS7P49802 495 aa6.85□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 CTSWP56202 376 aa6.85□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 OGDHQ02218 1023 aa6.85□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 KCTD2Q14681 263 aa6.85□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF124Q15973 351 aa6.85□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ANKRD34AQ69YU3 496 aa6.85□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa6.85□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 METTL23Q86XA0 190 aa6.85□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 P3H2Q8IVL5 708 aa6.85□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa6.85□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 KLHL6Q8WZ60 621 aa6.85□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 RORBQ92753 470 aa6.85□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 MFSD3Q96ES6 412 aa6.85□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 TNIP3Q96KP6 325 aa6.85□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 MTMR4Q9NYA4 1195 aa6.85□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 COA4Q9NYJ1 87 aa6.85□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 BFARQ9NZS9 450 aa6.85□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 MAPRE3Q9UPY8 281 aa6.85□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 CDYLQ9Y232 598 aa6.85□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 KLHL20Q9Y2M5 609 aa6.85□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 U3KQV3 271 aa6.85□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa6.85□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 RAB19A4D1S5 217 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 WDR64B1ANS9 1081 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 BTN3A1O00481 513 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 LRIG2O94898 1065 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 USP17L8P0C7I0 530 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 STMN1P16949 149 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 PSMB9P28065 219 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 PTPN7P35236 360 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 NSFP46459 744 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 SERPINB9P50453 376 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 RPL14P50914 215 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 AKR1D1P51857 326 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 UBXN2AP68543 259 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 BAMBIQ13145 260 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 Q3ZCU0 254 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 GLYATQ6IB77 296 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 IFNL2Q8IZJ0 200 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 DNERQ8NFT8 737 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 SGK3Q96BR1 496 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAF2Q96CS3 445 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 MBOAT4Q96T53 435 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 NAT9Q9BTE0 207 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF416Q9BWM5 594 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 SPATA9Q9BWV2 254 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRIM8Q9BZR9 551 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 CCDC167Q9P0B6 97 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 PLIN4Q96Q06 1357 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 AQP12BA6NM10 295 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 DFFAO00273 331 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 BTN3A3O00478 584 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 GMDSO60547 372 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 SNX4O95219 450 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 STAU1O95793 577 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 C1QBP02746 253 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 CYBBP04839 570 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 F7P08709 466 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 KRT19P08727 400 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 PHKG2P15735 406 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 SOX11P35716 441 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 CABP4P57796 275 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 INPP5AQ14642 412 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 CLCA4Q14CN2 919 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 SMTNL2Q2TAL5 461 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 PDSS1Q5T2R2 415 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 PIK3R6Q5UE93 754 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM219BQ5XKK7 198 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 DENND5AQ6IQ26 1287 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZNF720Q7Z2F6 126 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 CMC1Q7Z7K0 106 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 AQP12AQ8IXF9 295 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 PLD5Q8N7P1 536 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 YIPF5Q969M3 257 aa6.84□□□□□ -1.31
CACNA2D3-210ENST00000490478 PHF21AQ96BD5 680 aa6.84□□□□□ -1.31
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