RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 ZNF547Q8IVP9 402 aa20.69■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 ARL14Q8N4G2 192 aa20.69■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 DDHD1Q8NEL9 900 aa20.69■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 GDAP1Q8TB36 358 aa20.69■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 SMOXQ9NWM0 555 aa20.69■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa20.69■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 LRIT1Q9P2V4 623 aa20.69■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 SLC23A2Q9UGH3 650 aa20.69■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 APPL1Q9UKG1 709 aa20.69■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 KCNK6Q9Y257 313 aa20.69■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 TRABD2BA6NFA1 517 aa20.68■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 EML2O95834 649 aa20.68■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 CAPNS1P04632 268 aa20.68■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 PNLIPP16233 465 aa20.68■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 CLCNKAP51800 687 aa20.68■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 TMPRSS15P98073 1019 aa20.68■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 CDH17Q12864 832 aa20.68■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 POU6F1Q14863 301 aa20.68■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 LDLRAP1Q5SW96 308 aa20.68■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 GPRC6AQ5T6X5 926 aa20.68■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 TTC27Q6P3X3 843 aa20.68■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 CRTC3Q6UUV7 619 aa20.68■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 C4orf22Q6V702 233 aa20.68■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 GSTA5Q7RTV2 222 aa20.68■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 LRRTM4Q86VH4 590 aa20.68■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 AP1M1Q9BXS5 423 aa20.68■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 ASB8Q9H765 288 aa20.68■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 SNX12Q9UMY4 172 aa20.68■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PQM1 296 aa20.67■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 AGAP14A8MT82 685 aa20.67■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 E7EVH7 732 aa20.67■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 CCL22O00626 93 aa20.67■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 KMOO15229 486 aa20.67■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 HADHAP40939 763 aa20.67■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 LMAN1P49257 510 aa20.67■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 CCL7P80098 99 aa20.67■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 CCDC173Q0VFZ6 552 aa20.67■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 C11orf96Q7Z7L8 435 aa20.67■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 WDR48Q8TAF3 677 aa20.67■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 ACTRT1Q8TDG2 376 aa20.67■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 CASS4Q9NQ75 786 aa20.67■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 KLC4Q9NSK0 619 aa20.67■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D29Q9UFV1 150 aa20.67■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 AKAP13Q12802 2813 aa20.66■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 A6NCN8 305 aa20.66■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 MROH6A6NGR9 719 aa20.66■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 PRR19A6NJB7 356 aa20.66■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 CES2O00748 559 aa20.66■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 ZNF185O15231 689 aa20.66■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 TCEA3O75764 348 aa20.66■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
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ACTB-211ENST00000480301 PSMA3P25788 255 aa20.66■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 CTSCP53634 463 aa20.66■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 B4GALNT1Q00973 533 aa20.66■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 NFATC2Q13469 925 aa20.66■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 SEPT6Q14141 434 aa20.66■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 CYP1B1Q16678 543 aa20.66■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa20.66■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa20.66■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 MICALCLQ6ZW33 695 aa20.66■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 ZNF438Q7Z4V0 828 aa20.66■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa20.66■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 DNAAF3Q8N9W5 541 aa20.66■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 STYXQ8WUJ0 223 aa20.66■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 DEPDC7Q96QD5 511 aa20.66■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 TIMM29Q9BSF4 260 aa20.66■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 LRRN3Q9H3W5 708 aa20.66■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa20.66■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa20.65■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 H7C0S8 307 aa20.65■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 PPM1DO15297 605 aa20.65■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 CSO75390 466 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 COILP38432 576 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 GTF2H3Q13889 308 aa20.65■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 NR1D2Q14995 579 aa20.65■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 ISXQ2M1V0 245 aa20.65■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 CCDC38Q502W7 563 aa20.65■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 IYDQ6PHW0 289 aa20.65■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 SNX20Q7Z614 316 aa20.65■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 SPRED1Q7Z699 444 aa20.65■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 CCNJLQ8IV13 435 aa20.65■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 SFRP1Q8N474 314 aa20.65■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa20.65■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 TTC25Q96NG3 672 aa20.65■□□□□ 0.9
ACTB-211ENST00000480301 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
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