RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa12.99□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLC4Q9NSK0 619 aa12.99□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CROTQ9UKG9 612 aa12.99□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa12.99□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNMB2Q9Y691 235 aa12.99□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKRD66B4E2M5 251 aa12.98□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBXN7O94888 489 aa12.98□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VIPP01282 170 aa12.98□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TYRP1P17643 537 aa12.98□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GJC1P36383 396 aa12.98□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SSR1P43307 286 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD97P48960 835 aa12.98□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEPHS1P49903 392 aa12.98□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SH3BP2P78314 561 aa12.98□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa12.98□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC183Q5T5S1 534 aa12.98□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HGSNATQ68CP4 663 aa12.98□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM48Q8IWZ4 208 aa12.98□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GALNT6Q8NCL4 622 aa12.98□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRN4Q8WUT4 740 aa12.98□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa12.98□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TGM7Q96PF1 710 aa12.98□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR6C1Q96RD1 312 aa12.98□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2AG1Q9H205 316 aa12.98□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARFGAP3Q9NP61 516 aa12.98□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POLHQ9Y253 713 aa12.98□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1B0GTH6 734 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR89AB7ZAQ6 455 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MKRN2OSH3BPM6 223 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MYO1FO00160 1098 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MTSS1O43312 755 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIAA0754O94854 1291 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NDUFA10O95299 355 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MMP2P08253 660 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR89BP0CG08 455 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AMD1P17707 334 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MX2P20592 715 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC19A1P41440 591 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD86P42081 329 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DCDC1P59894 354 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERV3-1Q14264 604 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GALNT3Q14435 633 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IL11RAQ14626 422 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 INSCQ1MX18 579 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANO6Q4KMQ2 910 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALS2CLQ60I27 953 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TCTN3Q6NUS6 607 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRTC3Q6UUV7 619 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATCAYQ86WG3 371 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RASGRP3Q8IV61 690 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC13Q8IYE1 715 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EID2BQ96D98 161 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HDAC11Q96DB2 347 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BPIFA3Q9BQP9 254 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPATA16Q9BXB7 569 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM39Q9HCM9 518 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POT1Q9NUX5 634 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDZK1P1A8MUH7 402 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 K7EM74 188 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHUKO15111 745 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RFPL1O75677 317 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RASSF9O75901 435 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYP1A2P05177 515 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FURINP09958 794 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CAPZBP47756 277 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GBE1Q04446 702 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FIGNQ5HY92 759 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDPK2PQ6A1A2 396 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRSS42Q7Z5A4 293 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRTM4Q86VH4 590 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LURAP1LQ8IV03 231 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAM1L1Q8N609 369 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TEX19Q8NA77 164 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCTD6Q8NC69 237 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR26Q8NDV2 337 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RSC1A1Q92681 617 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAF2Q96CS3 445 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ELMO2Q96JJ3 720 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GBP4Q96PP9 640 aa12.97□□□□□ -0.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms