RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRK-202ENST00000368205 DIP2AQ14689 1571 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRK-202ENST00000368205 MYH15Q9Y2K3 1946 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRK-202ENST00000368205 UTYO14607 1347 aa3.71□□□□□ -1.81
PTPRK-202ENST00000368205 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 A0A0D9SFI3 127 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 HIP1O00291 1037 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 FAM155BO75949 473 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 PATE4P0C8F1 98 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 SETSIPP0DME0 302 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 S1PR1P21453 382 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 ANKRD1Q15327 319 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 SLC35E4Q6ICL7 350 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 SARM1Q6SZW1 724 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF852Q6ZMS4 543 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 ERC1Q8IUD2 1116 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 C1orf87Q8N0U7 546 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 CPXM2Q8N436 756 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 SCCPDHQ8NBX0 429 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 AGBL3Q8NEM8 1001 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 RAB40AQ8WXH6 277 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 THAP4Q8WY91 577 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF583Q96ND8 569 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 CHMP4AQ9BY43 222 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 LMAN2LQ9H0V9 348 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 CHODLQ9H9P2 273 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 SAYSD1Q9NPB0 183 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 AMDHD2Q9Y303 409 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 HEG1Q9ULI3 1381 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 LMO7Q8WWI1 1683 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 RGPD2P0DJD1 1756 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 NPHP3Q7Z494 1330 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF318Q5VUA4 2279 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 LAMA4Q16363 1823 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 USP27XA6NNY8 438 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 PCDH7O60245 1069 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 NEMFO60524 1076 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 JAK2O60674 1132 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 CAVIN2O95810 425 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 ITGA2P17301 1181 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 CLCNKAP51800 687 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 RAD23BP54727 409 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 LPAL2Q16609 132 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 CTF1Q16619 201 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 PDSS1Q5T2R2 415 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 C17orf99Q6UX52 265 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 CEACAM20Q6UY09 585 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 AACSQ86V21 672 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 LRRC8AQ8IWT6 810 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF248Q8NDW4 579 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 KIF18AQ8NI77 898 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 RND1Q92730 232 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 TCEANC2Q96MN5 208 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 ZNF599Q96NL3 588 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 TWNKQ96RR1 684 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 ASCL2Q99929 193 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 DERAQ9Y315 318 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 PRSS21Q9Y6M0 314 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 MED23Q9ULK4 1368 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 LTN1O94822 1766 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 DVL1O14640 695 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 CTAGE5O15320 804 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 CEP104O60308 925 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 PFKFB2O60825 505 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 CTDNEP1O95476 244 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 TK1P04183 234 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 IGKV5-2P06315 115 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 NR1D1P20393 614 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 CCZ1BP86790 482 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 CUL4BQ13620 913 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 BLMHQ13867 455 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 CTXN3Q4LDR2 81 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 FAM83BQ5T0W9 1011 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 KCTD8Q6ZWB6 473 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 MTSS1LQ765P7 747 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 SH2D6Q7Z4S9 175 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRK-202ENST00000368205 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms