RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325942.10

FRAS1-201, Transcript of Fraser extracellular matrix complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FRAS1, Length 7,142 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAS1-201ENST00000325942 OR2AG1Q9H205 316 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 TLR9Q9NR96 1032 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 SEMA3GQ9NS98 782 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 GON4LQ3T8J9 2241 aa9.5□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 A0A087X1B8 175 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 GLTPD2A6NH11 291 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 REM1O75628 298 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 ZNF20P17024 532 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 TMED10P49755 219 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 BTN3A2P78410 334 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 FAM187BQ17R55 369 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 ABCA11PQ4W5N1 156 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 TMEM35AQ53FP2 167 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 MOXD1Q6UVY6 613 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 ZNF627Q7L945 461 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 GATSQ8NAP1 163 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 TPCN2Q8NHX9 752 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 HDAC10Q969S8 669 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 CCDC115Q96NT0 180 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 ZNF607Q96SK3 696 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 USP29Q9HBJ7 922 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 KLC4Q9NSK0 619 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 ANKRD63C9JTQ0 380 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 SYPP08247 313 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 TTPAP49638 278 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 CDH11P55287 796 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 C1QTNF8P60827 252 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 FAM153CQ494X1 144 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 PTCHD4Q6ZW05 846 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 NPAS4Q8IUM7 802 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 CEP97Q8IW35 865 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 REXO1L1PQ8IX06 675 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 TIFAQ96CG3 184 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 EXD2Q9NVH0 621 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 KCNK4Q9NYG8 393 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 PCDHB10Q9UN67 800 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 PGLSO95336 258 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 ICAM3P32942 547 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 ASMTP46597 345 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 CCT3P49368 545 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 NEK3P51956 506 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 TSPAN5P62079 268 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 MED22Q15528 200 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 FAM69BQ5VUD6 431 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 C12orf56Q8IXR9 622 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 ACTRT2Q8TDY3 377 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 SH3RF2Q8TEC5 729 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 DHRS7Q9Y394 339 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 WNT6Q9Y6F9 365 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 PIGNO95427 931 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 PRH1P02810 166 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 PRNPP04156 253 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 FASLGP48023 281 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 CTBP2P56545 445 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 GPR68Q15743 365 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 ZNF792Q3KQV3 632 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 CYP2U1Q7Z449 544 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 DOK4Q8TEW6 326 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 SEC14L3Q9UDX4 400 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 E7EQ34 232 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 PLD2O14939 933 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 SPAG6O75602 509 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 FAM58BPP0C7Q3 252 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 ARG2P78540 354 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 ABATP80404 500 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 TRAF3Q13114 568 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 LIX1LQ8IVB5 337 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 NUS1Q96E22 293 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 WDR24Q96S15 920 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 SERINC1Q9NRX5 453 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 LAMP2P13473 410 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 CPN2P22792 545 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 TXNDC8Q6A555 127 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 PRR18Q8N4B5 295 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 OR1F2PQ96R84 312 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 CPNE1Q99829 537 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 TRIM39Q9HCM9 518 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 SLAMF7Q9NQ25 335 aa9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
FRAS1-201ENST00000325942 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms