RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306324.3

HOXD4-201, Transcript of homeobox D4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD4, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4-201ENST00000306324 PRRT3Q5FWE3 981 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 LDLRAP1Q5SW96 308 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 DDHD1Q8NEL9 900 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 OR4L1Q8NH43 312 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 ART4Q93070 314 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 ULK4Q96C45 1275 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 TTC25Q96NG3 672 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 CEP250Q9BV73 2442 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF883P0CG24 379 aa22.1■■□□□ 1.13
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HOXD4-201ENST00000306324 TMEM115Q12893 351 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 C1orf61Q13536 156 aa22.1■■□□□ 1.13
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HOXD4-201ENST00000306324 NXPE1Q8N323 547 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 FBXO25Q8TCJ0 367 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 LMX1AQ8TE12 382 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 AGAP14A8MT82 685 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 CDK14O94921 469 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 VAPBO95292 243 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 POLBP06746 335 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 IVLP07476 585 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
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HOXD4-201ENST00000306324 DGKAP23743 735 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 FOXN2P32314 431 aa22.09■■□□□ 1.13
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HOXD4-201ENST00000306324 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM135Q86UB9 458 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 SERPINA9Q86WD7 417 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 GALNT13Q8IUC8 556 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 PIANPQ8IYJ0 282 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 SAP25Q8TEE9 199 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 SEC14L1Q92503 715 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
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HOXD4-201ENST00000306324 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 LRRC61Q9BV99 259 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 UCKL1Q9NWZ5 548 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 SPASTQ9UBP0 616 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 CHMP2BQ9UQN3 213 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 PRKAB1Q9Y478 270 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 GPSM3Q9Y4H4 160 aa22.09■■□□□ 1.13
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HOXD4-201ENST00000306324 AQP9O43315 295 aa22.09■■□□□ 1.13
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HOXD4-201ENST00000306324 RHOXF2BP0C7M4 288 aa22.09■■□□□ 1.13
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HOXD4-201ENST00000306324 OTUD6BQ8N6M0 293 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 NETO1Q8TDF5 533 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 COPS8Q99627 209 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 RHOXF2Q9BQY4 288 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 TMEM168Q9H0V1 697 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 FAM114A2Q9NRY5 505 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXD4-201ENST00000306324 CATSPERZQ9NTU4 200 aa22.09■■□□□ 1.13
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HOXD4-201ENST00000306324 GOLGA8TH3BQL2 631 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 LIMK1P53667 647 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 PYCR3Q53H96 274 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 CRTC3Q6UUV7 619 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 ANKMY2Q8IV38 441 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 PNPLA1Q8N8W4 532 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 IFT81Q8WYA0 676 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 LRRC39Q96DD0 335 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 CFAP36Q96G28 342 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 DCUN1D1Q96GG9 259 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 OR2M4Q96R27 311 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 NAT9Q9BTE0 207 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 RMI1Q9H9A7 625 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa22.08■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 GPR89AB7ZAQ6 455 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 FFAR2O15552 330 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXD4-201ENST00000306324 GRID2O43424 1007 aa22.07■■□□□ 1.12
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