RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000032842.12

Ccdc90b-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc90b, Length 1,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Cys1Q8R4T1 145 aa14.5□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Epsti1Q8VDI1 314 aa14.5□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Lrrc40Q9CRC8 602 aa14.5□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 ItpaQ9D892 198 aa14.5□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Rfwd2Q9R1A8 733 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 PygmQ9WUB3 842 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Slfn8B1ARD8 910 aa14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Vmn2r21K7N6Y7 853 aa14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Olfr603L7N1Y4 312 aa14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Vmn2r20L7N2B1 853 aa14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Art2bO35975 289 aa14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Nckap1P28660 1128 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 VdrP48281 422 aa14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 LmnaP48678 665 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Gucy2eP52785 1108 aa14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Dusp2Q05922 318 aa14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Mat2aQ3THS6 395 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Cdkl4Q3TZA2 342 aa14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 PianpQ6P1B3 278 aa14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Olfr309Q7TS01 308 aa14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Tmem214Q8BM55 687 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 C1raQ8CG16 707 aa14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Creb5Q8K1L0 357 aa14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Hdac8Q8VH37 377 aa14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Abcf2Q99LE6 628 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Tbc1d20Q9D9I4 402 aa14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 MrgbpQ9DAT2 204 aa14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Krt7Q9DCV7 457 aa14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Sars2Q9JJL8 518 aa14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Akr1c12Q9JLI0 323 aa14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Hey2Q9QUS4 339 aa14.49□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Pdzd7E9Q9W7 1021 aa14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Zfp871G5E905 615 aa14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Serpinb6bO08804 377 aa14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Il4i1O09046 630 aa14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Ripk2P58801 539 aa14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Sox4Q06831 440 aa14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Cyb5r2Q3KNK3 276 aa14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Fpr-rs6Q3SXG2 339 aa14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Defb48Q3UW22 87 aa14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Taok1Q5F2E8 1001 aa14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Zdhhc20Q5Y5T1 380 aa14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Fzd3Q61086 666 aa14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 PapolgQ6PCL9 739 aa14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Tra2aQ6PFR5 281 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Rps9Q6ZWN5 194 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 FukQ7TMC8 1090 aa14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Lrp10Q7TQH7 713 aa14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Ppm1lQ8BHN0 360 aa14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 PygbQ8CI94 843 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Vps39Q8R5L3 886 aa14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Pcdhgb5Q91XX5 926 aa14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Olfr459Q924H8 314 aa14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Tcam1Q99NB3 548 aa14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Nt5c3aQ9D020 331 aa14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Dus2Q9D7B1 493 aa14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Hapln1Q9QUP5 356 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Fam166bA2AIP0 273 aa14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Tmem45a2B7ZWJ5 289 aa14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Tsc22d2E9Q7M2 769 aa14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Angpt1O08538 498 aa14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Nfatc2ipO09130 412 aa14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Top3aO70157 1003 aa14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Srpk1O70551 648 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Hoxb3P09026 433 aa14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Ncam1P13595 1115 aa14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Csf2rb2P26954 878 aa14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 MybphP70402 483 aa14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Ubtfl1Q3USZ2 394 aa14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Itpripl2Q3UV16 535 aa14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Hif1aQ61221 836 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Hbs1lQ69ZS7 682 aa14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Trpm4Q7TN37 1213 aa14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Zic5Q7TQ40 622 aa14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Acat3Q80X81 397 aa14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Strip2Q8C9H6 844 aa14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Parp9Q8CAS9 866 aa14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Adgre4Q91ZE5 689 aa14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Mta3Q924K8 591 aa14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Zfp655Q9CZP3 541 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Mdm1Q9D067 708 aa14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Jph3Q9ET77 744 aa14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Clcn5Q9WVD4 746 aa14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 CorinQ9Z319 1113 aa14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 DmdP11531 3678 aa14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Fbxo47A2A6H3 451 aa14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 CerklA2AQH1 525 aa14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Enthd1E9Q1Z2 618 aa14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Fpr1P33766 364 aa14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Stmn4P63042 189 aa14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Serpinb5P70124 375 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 D17Wsu92eQ3TT38 291 aa14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Cnga4Q3UW12 575 aa14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Ints7Q7TQK1 966 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Lats2Q7TSJ6 1042 aa14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Znf423Q80TS5 1292 aa14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Tbx10Q810F8 385 aa14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Fbxo48Q8CAT8 161 aa14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Rnf222Q8CEF8 211 aa14.47□□□□□ -0.09
Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 Fam3cQ91VU0 227 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 40 ms