Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Top3aO70157 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Top3aO70157 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Top3aO70157 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Top3aO70157 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Top3aO70157 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Top3aO70157 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Top3aO70157 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Top3aO70157 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Top3aO70157 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Top3aO70157 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Top3aO70157 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Top3aO70157 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Top3aO70157 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Top3aO70157 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Top3aO70157 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Top3aO70157 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Top3aO70157 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Top3aO70157 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Top3aO70157 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Top3aO70157 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Top3aO70157 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Top3aO70157 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Top3aO70157 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Top3aO70157 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Top3aO70157 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Top3aO70157 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Top3aO70157 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Top3aO70157 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Top3aO70157 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Top3aO70157 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Top3aO70157 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Top3aO70157 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Top3aO70157 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Top3aO70157 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Top3aO70157 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Top3aO70157 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Top3aO70157 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Top3aO70157 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Top3aO70157 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Top3aO70157 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Top3aO70157 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Top3aO70157 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Top3aO70157 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Top3aO70157 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Top3aO70157 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Top3aO70157 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Top3aO70157 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Top3aO70157 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Top3aO70157 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Top3aO70157 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Top3aO70157 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Top3aO70157 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Top3aO70157 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Top3aO70157 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Top3aO70157 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Top3aO70157 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Top3aO70157 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Top3aO70157 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Top3aO70157 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Top3aO70157 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Top3aO70157 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Top3aO70157 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Top3aO70157 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Top3aO70157 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Top3aO70157 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Top3aO70157 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Top3aO70157 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Top3aO70157 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Top3aO70157 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Top3aO70157 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Top3aO70157 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Top3aO70157 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Top3aO70157 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Top3aO70157 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Top3aO70157 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Top3aO70157 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Top3aO70157 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Top3aO70157 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Top3aO70157 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Top3aO70157 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Top3aO70157 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Top3aO70157 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Top3aO70157 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Top3aO70157 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Top3aO70157 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Top3aO70157 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Top3aO70157 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Top3aO70157 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Top3aO70157 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Top3aO70157 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Top3aO70157 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Top3aO70157 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Top3aO70157 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Top3aO70157 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Top3aO70157 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Top3aO70157 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Top3aO70157 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Top3aO70157 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Top3aO70157 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms