Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36,31■■■■□ 3,4
Top3aO70157 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
Top3aO70157 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Top3aO70157 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,93■■■□□ 2,86
Top3aO70157 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,93■■■□□ 2,86
Top3aO70157 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,69■■■□□ 2,82
Top3aO70157 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32,22■■■□□ 2,75
Top3aO70157 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31,58■■■□□ 2,65
Top3aO70157 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,53■■■□□ 2,64
Top3aO70157 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC31,41■■■□□ 2,62
Top3aO70157 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC31,23■■■□□ 2,59
Top3aO70157 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,18■■■□□ 2,58
Top3aO70157 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,06■■■□□ 2,56
Top3aO70157 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,94■■■□□ 2,54
Top3aO70157 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,92■■■□□ 2,54
Top3aO70157 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,81■■■□□ 2,52
Top3aO70157 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,62■■■□□ 2,49
Top3aO70157 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Top3aO70157 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30,39■■■□□ 2,46
Top3aO70157 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Top3aO70157 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,33■■■□□ 2,45
Top3aO70157 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,32■■■□□ 2,44
Top3aO70157 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Top3aO70157 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Top3aO70157 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Top3aO70157 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Top3aO70157 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Top3aO70157 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,43
Top3aO70157 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Top3aO70157 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30,09■■■□□ 2,41
Top3aO70157 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Top3aO70157 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Top3aO70157 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,76■■■□□ 2,35
Top3aO70157 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Top3aO70157 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Top3aO70157 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29,62■■■□□ 2,33
Top3aO70157 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29,59■■■□□ 2,33
Top3aO70157 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Top3aO70157 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Top3aO70157 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,37■■■□□ 2,29
Top3aO70157 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Top3aO70157 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Top3aO70157 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Top3aO70157 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Top3aO70157 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC28,95■■■□□ 2,23
Top3aO70157 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Top3aO70157 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28,92■■■□□ 2,22
Top3aO70157 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,91■■■□□ 2,22
Top3aO70157 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
Top3aO70157 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28,88■■■□□ 2,21
Top3aO70157 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
Top3aO70157 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Top3aO70157 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Top3aO70157 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,17
Top3aO70157 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Top3aO70157 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,55■■■□□ 2,16
Top3aO70157 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,53■■■□□ 2,16
Top3aO70157 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC28,49■■■□□ 2,15
Top3aO70157 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Top3aO70157 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Top3aO70157 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Top3aO70157 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Top3aO70157 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,36■■■□□ 2,13
Top3aO70157 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Top3aO70157 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28,31■■■□□ 2,12
Top3aO70157 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Top3aO70157 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28,29■■■□□ 2,12
Top3aO70157 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Top3aO70157 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28,26■■■□□ 2,12
Top3aO70157 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Top3aO70157 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Top3aO70157 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,24■■■□□ 2,11
Top3aO70157 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC28,14■■■□□ 2,1
Top3aO70157 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28,14■■■□□ 2,1
Top3aO70157 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Top3aO70157 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Top3aO70157 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Top3aO70157 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Top3aO70157 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Top3aO70157 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27,95■■■□□ 2,06
Top3aO70157 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,93■■■□□ 2,06
Top3aO70157 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Top3aO70157 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Top3aO70157 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Top3aO70157 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Top3aO70157 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Top3aO70157 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Top3aO70157 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,76■■■□□ 2,03
Top3aO70157 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Top3aO70157 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27,73■■■□□ 2,03
Top3aO70157 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC27,73■■■□□ 2,03
Top3aO70157 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Top3aO70157 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Top3aO70157 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,71■■■□□ 2,03
Top3aO70157 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Top3aO70157 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Top3aO70157 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Top3aO70157 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27,61■■■□□ 2,01
Top3aO70157 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Top3aO70157 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,1 ms