RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641425.1

CASC19-231, Transcript of cancer susceptibility 19, human

Gene CASC19, Length 1,156 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CASC19-231	ENST00000641425	RAMP2	O60895	175 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	LRCH4	O75427	683 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	PROSC	O94903	275 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	SEMA4F	O95754	770 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	DES	P17661	470 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	PCK1	P35558	622 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	MPL	P40238	635 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	SELENOP	P49908	381 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	AIF1	P55008	147 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	CDH6	P55285	790 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	SLC20A2	Q08357	652 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	SCAP	Q12770	1279 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	SEMA3B	Q13214	749 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	KRT81	Q14533	505 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	ACAP1	Q15027	740 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	LLGL1	Q15334	1064 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	CST6	Q15828	149 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	CSRP2	Q16527	193 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	MYLK3	Q32MK0	819 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	FAM209A	Q5JX71	171 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	LYSMD4	Q5XG99	296 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	RFX8	Q6ZV50	586 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	C11orf74	Q86VG3	221 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	SYT12	Q8IV01	421 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	CNGA4	Q8IV77	575 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	RTL3	Q8N8U3	475 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	KDM1B	Q8NB78	822 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	KCTD6	Q8NC69	237 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	SNX19	Q92543	992 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	RMDN1	Q96DB5	314 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	HMCES	Q96FZ2	354 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	LMF1	Q96S06	567 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	TM6SF2	Q9BZW4	377 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	EBF2	Q9HAK2	575 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	VPS45	Q9NRW7	570 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	NEU3	Q9UQ49	428 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	USP34	Q70CQ2	3546 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425		A0A0U1RQJ8	604 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425		A0A1B0GVT2	93 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	C4orf47	A7E2U8	309 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	MEI4	A8MW99	385 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	DFFA	O00273	331 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	KPNA3	O00505	521 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	AQP7	O14520	342 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	MUSK	O15146	869 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	PDPK1	O15530	556 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	FOXS1	O43638	330 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	POP4	O95707	220 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	AMY2A	P04746	511 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	CFI	P05156	583 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	AMY2B	P19961	511 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	C5AR1	P21730	350 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	COMT	P21964	271 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	KDELR1	P24390	212 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	DRD3	P35462	400 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	ID4	P47928	161 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	HCAR3	P49019	387 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	CSNK1E	P49674	416 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	SERPINH1	P50454	418 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	ARSE	P51690	589 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CASC19-231	ENST00000641425	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67

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