RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568586.5

RAB40C-211, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, humanhuman

TSL 2

Gene RAB40C, Length 648 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40C-211ENST00000568586 ATXN10Q9UBB4 475 aa29.1■■■□□ 2.25
RAB40C-211ENST00000568586 RSPH14Q9UHP6 348 aa29.1■■■□□ 2.25
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RAB40C-211ENST00000568586 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa29.09■■■□□ 2.25
RAB40C-211ENST00000568586 MACROD2A1Z1Q3 448 aa29.09■■■□□ 2.25
RAB40C-211ENST00000568586 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
RAB40C-211ENST00000568586 RBP3P10745 1247 aa29.09■■■□□ 2.25
RAB40C-211ENST00000568586 INHBCP55103 352 aa29.09■■■□□ 2.25
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RAB40C-211ENST00000568586 SQSTM1Q13501 440 aa29.09■■■□□ 2.25
RAB40C-211ENST00000568586 AADACL2Q6P093 401 aa29.09■■■□□ 2.25
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RAB40C-211ENST00000568586 VPS35Q96QK1 796 aa29.09■■■□□ 2.25
RAB40C-211ENST00000568586 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa29.09■■■□□ 2.25
RAB40C-211ENST00000568586 THSD1Q9NS62 852 aa29.09■■■□□ 2.25
RAB40C-211ENST00000568586 CDRT15L2A8MXV6 281 aa29.08■■■□□ 2.25
RAB40C-211ENST00000568586 CHUKO15111 745 aa29.08■■■□□ 2.25
RAB40C-211ENST00000568586 ANXA9O76027 345 aa29.08■■■□□ 2.25
RAB40C-211ENST00000568586 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
RAB40C-211ENST00000568586 CHRNA4P43681 627 aa29.08■■■□□ 2.25
RAB40C-211ENST00000568586 FASLGP48023 281 aa29.08■■■□□ 2.25
RAB40C-211ENST00000568586 CLCNKAP51800 687 aa29.08■■■□□ 2.25
RAB40C-211ENST00000568586 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa29.08■■■□□ 2.25
RAB40C-211ENST00000568586 ALS2CLQ60I27 953 aa29.08■■■□□ 2.25
RAB40C-211ENST00000568586 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa29.08■■■□□ 2.25
RAB40C-211ENST00000568586 SLITRK4Q8IW52 837 aa29.08■■■□□ 2.25
RAB40C-211ENST00000568586 SFRP1Q8N474 314 aa29.08■■■□□ 2.25
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RAB40C-211ENST00000568586 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa29.08■■■□□ 2.25
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RAB40C-211ENST00000568586 IL17CQ9P0M4 197 aa29.08■■■□□ 2.25
RAB40C-211ENST00000568586 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa29.08■■■□□ 2.25
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RAB40C-211ENST00000568586 RHPN2P1A8MT19 583 aa29.07■■■□□ 2.24
RAB40C-211ENST00000568586 PPM1DO15297 605 aa29.07■■■□□ 2.24
RAB40C-211ENST00000568586 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
RAB40C-211ENST00000568586 ZW10O43264 779 aa29.07■■■□□ 2.24
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RAB40C-211ENST00000568586 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
RAB40C-211ENST00000568586 ITPKBP27987 946 aa29.07■■■□□ 2.24
RAB40C-211ENST00000568586 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
RAB40C-211ENST00000568586 ADRA1AP35348 466 aa29.07■■■□□ 2.24
RAB40C-211ENST00000568586 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
RAB40C-211ENST00000568586 GEMP55040 296 aa29.07■■■□□ 2.24
RAB40C-211ENST00000568586 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
RAB40C-211ENST00000568586 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa29.07■■■□□ 2.24
RAB40C-211ENST00000568586 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa29.07■■■□□ 2.24
RAB40C-211ENST00000568586 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa29.07■■■□□ 2.24
RAB40C-211ENST00000568586 RANBP10Q6VN20 620 aa29.07■■■□□ 2.24
RAB40C-211ENST00000568586 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa29.07■■■□□ 2.24
RAB40C-211ENST00000568586 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa29.07■■■□□ 2.24
RAB40C-211ENST00000568586 CLEC14AQ86T13 490 aa29.07■■■□□ 2.24
RAB40C-211ENST00000568586 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa29.07■■■□□ 2.24
RAB40C-211ENST00000568586 ZNF248Q8NDW4 579 aa29.07■■■□□ 2.24
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RAB40C-211ENST00000568586 PMS2P1A4D2B8 440 aa29.06■■■□□ 2.24
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RAB40C-211ENST00000568586 OR1D5P58170 312 aa29.06■■■□□ 2.24
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RAB40C-211ENST00000568586 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
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RAB40C-211ENST00000568586 SLC25A41Q8N5S1 370 aa29.06■■■□□ 2.24
RAB40C-211ENST00000568586 TMEM159Q96B96 161 aa29.06■■■□□ 2.24
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RAB40C-211ENST00000568586 SPATA13Q96N96 652 aa29.05■■■□□ 2.24
RAB40C-211ENST00000568586 TBC1D29Q9UFV1 150 aa29.05■■■□□ 2.24
RAB40C-211ENST00000568586 SSUH2Q9Y2M2 353 aa29.05■■■□□ 2.24
RAB40C-211ENST00000568586 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
RAB40C-211ENST00000568586 PRR19A6NJB7 356 aa29.04■■■□□ 2.24
RAB40C-211ENST00000568586 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa29.04■■■□□ 2.24
RAB40C-211ENST00000568586 F5H423 210 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
RAB40C-211ENST00000568586 KCNN4O15554 427 aa29.04■■■□□ 2.24
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