RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

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Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 PRR5P85299 388 aa8.45□□□□□ -1.06
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PTPRB-208ENST00000550358 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa8.45□□□□□ -1.06
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PTPRB-208ENST00000550358 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa8.45□□□□□ -1.06
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PTPRB-208ENST00000550358 SOX30O94993 753 aa8.45□□□□□ -1.06
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PTPRB-208ENST00000550358 MAPK11Q15759 364 aa8.45□□□□□ -1.06
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PTPRB-208ENST00000550358 SLC44A4Q53GD3 710 aa8.45□□□□□ -1.06
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PTPRB-208ENST00000550358 RAD51AP1Q96B01 352 aa8.45□□□□□ -1.06
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PTPRB-208ENST00000550358 TRBC1P01850 177 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 MTM1Q13496 603 aa8.45□□□□□ -1.06
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PTPRB-208ENST00000550358 TTMPQ5BVD1 217 aa8.45□□□□□ -1.06
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PTPRB-208ENST00000550358 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 DHRS12A0PJE2 317 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 UBE2QL1A1L167 161 aa8.45□□□□□ -1.06
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PTPRB-208ENST00000550358 KRT33AO76009 404 aa8.45□□□□□ -1.06
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PTPRB-208ENST00000550358 PHF11Q9UIL8 331 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 RAB26Q9ULW5 256 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 ADAMDEC1O15204 470 aa8.44□□□□□ -1.06
PTPRB-208ENST00000550358 LRCH4O75427 683 aa8.44□□□□□ -1.06
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